267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0070 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0070  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 
131 aa  260  4e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7238  large conductance mechanosensitive channel protein  75.78 
 
 
129 aa  196  1e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0390041  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6488  large conductance mechanosensitive channel protein  73.17 
 
 
169 aa  166  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.182707  normal  0.360955 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2291  large conductance mechanosensitive channel protein  55.47 
 
 
131 aa  142  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30610  large conductance mechanosensitive channel protein  52.8 
 
 
164 aa  134  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0156749  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1383  large conductance mechanosensitive channel protein  61.47 
 
 
145 aa  127  4e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190141  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1843  large conductance mechanosensitive channel protein  51.16 
 
 
126 aa  127  5e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.130997  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8656  large conductance mechanosensitive channel protein  54.39 
 
 
134 aa  121  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0006  large conductance mechanosensitive channel protein  50 
 
 
138 aa  120  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404291  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2817  large conductance mechanosensitive channel protein  50.77 
 
 
130 aa  120  6e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234312  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1972  large conductance mechanosensitive channel protein  48.8 
 
 
132 aa  120  8e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16810  mscL large conductance mechanosensitive channel protein  45.04 
 
 
140 aa  117  6e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230846  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1657  large-conductance mechanosensitive channel  45.67 
 
 
125 aa  113  8e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0902  large conductance mechanosensitive channel protein  45.86 
 
 
134 aa  112  1e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1165  large conductance mechanosensitive channel protein  47.62 
 
 
122 aa  110  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.423534 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2197  large conductance mechanosensitive channel protein  48.85 
 
 
132 aa  110  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.270032  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2915  large conductance mechanosensitive channel protein  49.62 
 
 
130 aa  108  2e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0900  large conductance mechanosensitive channel protein  41.61 
 
 
166 aa  107  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  43.08 
 
 
131 aa  107  7e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  3.47005e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0624  large conductance mechanosensitive channel protein  41.79 
 
 
176 aa  106  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.29249  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  43.9 
 
 
126 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0305  large conductance mechanosensitive channel protein  50.39 
 
 
131 aa  103  8e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.504961 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2624  large conductance mechanosensitive channel protein  46.56 
 
 
129 aa  102  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.462758 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2342  large conductance mechanosensitive channel protein  49.61 
 
 
126 aa  102  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998505  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3137  large conductance mechanosensitive channel protein  49.21 
 
 
127 aa  101  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13070  large conductance mechanosensitive channel protein  41.04 
 
 
151 aa  101  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00812185  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1428  large conductance mechanosensitive channel protein  47.24 
 
 
126 aa  100  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144967  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0038  large conductance mechanosensitive channel protein  47.92 
 
 
136 aa  100  6e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0832  large conductance mechanosensitive channel protein  40.88 
 
 
201 aa  99  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1595  large conductance mechanosensitive channel protein  43.57 
 
 
142 aa  98.6  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1924  Large-conductance mechanosensitive channel  39.55 
 
 
168 aa  97.1  7e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.79206  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  44.37 
 
 
145 aa  96.7  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0317  large conductance mechanosensitive channel protein  37.98 
 
 
123 aa  95.5  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209684  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2606  hypothetical protein  40.94 
 
 
127 aa  95.5  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4091  large conductance mechanosensitive channel protein  42.11 
 
 
135 aa  95.5  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.845287  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2461  hypothetical protein  40.16 
 
 
127 aa  95.5  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  36.88 
 
 
138 aa  94.7  4e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  45.19 
 
 
134 aa  94.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  45.19 
 
 
137 aa  94  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  45.19 
 
 
137 aa  94  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  42.54 
 
 
136 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  37.96 
 
 
137 aa  92.8  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  42.54 
 
 
136 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  42.54 
 
 
136 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  42.54 
 
 
136 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  1.68159e-05 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  42.54 
 
 
136 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  40.71 
 
 
159 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  42.54 
 
 
136 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  42.54 
 
 
136 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  42.54 
 
 
136 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0156  large conductance mechanosensitive channel protein  53.27 
 
 
138 aa  92  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.024147  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4648  large conductance mechanosensitive channel protein  41.41 
 
 
146 aa  91.7  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.508499  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  41.79 
 
 
136 aa  91.3  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  37.04 
 
 
136 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  37.04 
 
 
136 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0554  large-conductance mechanosensitive channel  37.04 
 
 
136 aa  90.9  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000110723  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  36.3 
 
 
136 aa  90.5  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3339  large-conductance mechanosensitive channel  37.04 
 
 
136 aa  90.5  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3527  large conductance mechanosensitive channel protein  40.88 
 
 
143 aa  90.5  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0055  large conductance mechanosensitive channel protein  43.75 
 
 
140 aa  90.1  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  34.97 
 
 
142 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4421  large-conductance mechanosensitive channel  41.73 
 
 
132 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4049  large conductance mechanosensitive channel protein  42.42 
 
 
152 aa  89.4  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4404  large-conductance mechanosensitive channel  41.73 
 
 
132 aa  90.1  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4569  large-conductance mechanosensitive channel  41.73 
 
 
132 aa  90.1  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4924  large-conductance mechanosensitive channel  41.73 
 
 
132 aa  90.1  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4790  large-conductance mechanosensitive channel  40.94 
 
 
132 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0090  large conductance mechanosensitive channel protein  38.41 
 
 
151 aa  89  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.343086  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4785  large-conductance mechanosensitive channel  41.41 
 
 
132 aa  89  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4808  large-conductance mechanosensitive channel  41.41 
 
 
132 aa  89  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0352  large conductance mechanosensitive channel protein  38.81 
 
 
141 aa  88.6  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.559193  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3972  large-conductance mechanosensitive channel  37.23 
 
 
137 aa  89  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0532201  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  38.41 
 
 
142 aa  89.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  38.69 
 
 
139 aa  88.6  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  38.57 
 
 
138 aa  88.6  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5645  large conductance mechanosensitive channel protein  46.39 
 
 
174 aa  88.2  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0366128  normal  0.120344 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0756  large conductance mechanosensitive channel protein  36.84 
 
 
132 aa  87.8  4e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4806  large-conductance mechanosensitive channel  41.73 
 
 
133 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  35.56 
 
 
136 aa  87.4  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  40.3 
 
 
137 aa  87.8  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  35.56 
 
 
136 aa  87.4  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  35.56 
 
 
136 aa  87.4  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  35.56 
 
 
136 aa  87.4  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3512  large conductance mechanosensitive channel protein  41.13 
 
 
154 aa  87.4  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.178106  normal  0.287508 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11003  large-conductance mechanosensitive channel  44.19 
 
 
151 aa  87  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.00405e-34  normal  0.629119 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4501  large-conductance mechanosensitive channel  40.16 
 
 
133 aa  87  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0522  large-conductance mechanosensitive channel  36.3 
 
 
136 aa  87  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  42.66 
 
 
138 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1408  large conductance mechanosensitive channel protein  41.41 
 
 
274 aa  87  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  34.97 
 
 
141 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2579  large conductance mechanosensitive channel protein  34.97 
 
 
141 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0941  large conductance mechanosensitive channel protein  41.67 
 
 
137 aa  86.3  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.954406  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0241  large conductance mechanosensitive channel protein  42.64 
 
 
131 aa  86.7  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.709816  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  36.36 
 
 
137 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  35.34 
 
 
132 aa  85.9  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  36.36 
 
 
137 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3340  large-conductance mechanosensitive channel  37.01 
 
 
132 aa  85.1  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  4.22883e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1256  large conductance mechanosensitive channel protein  38.64 
 
 
136 aa  85.1  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00104806  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  36.88 
 
 
138 aa  85.1  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0435  large conductance mechanosensitive channel protein  37.31 
 
 
135 aa  84.7  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>