More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0069 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 
579 aa  1108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7239  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  67.08 
 
 
569 aa  521  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1593  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.68 
 
 
512 aa  274  4e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421913  normal  0.822638 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  47.8 
 
 
423 aa  266  6e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0353  trypsin-like serine protease  44.59 
 
 
583 aa  263  7e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.326819  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4679  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.37 
 
 
440 aa  263  8e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0383364 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4385  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.79 
 
 
440 aa  262  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4299  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.79 
 
 
440 aa  262  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143756  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3684  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.04 
 
 
518 aa  258  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.358044  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1398  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.2 
 
 
349 aa  259  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.66 
 
 
674 aa  258  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0459  2-alkenal reductase  47.11 
 
 
584 aa  255  1e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4062  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.31 
 
 
524 aa  253  9e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0658  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  50.99 
 
 
434 aa  250  5e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1008  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.45 
 
 
487 aa  248  3e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3284  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.97 
 
 
420 aa  247  4e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.71487  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21640  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  46.25 
 
 
417 aa  245  1e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00345268  normal  0.0571371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0886  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.26 
 
 
916 aa  245  1e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.421013 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1186  HtrA2 peptidase  44.36 
 
 
597 aa  246  1e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.934322  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1859  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.73 
 
 
544 aa  244  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.308507  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3830  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.15 
 
 
515 aa  244  4e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778945  normal  0.0341938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8413  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  41.03 
 
 
527 aa  243  8e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32730  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  46.03 
 
 
443 aa  241  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229019  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0507  trypsin-like serine protease  41.25 
 
 
489 aa  241  3e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3992  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.5 
 
 
501 aa  237  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4066  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.5 
 
 
501 aa  237  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1212  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.79 
 
 
471 aa  236  6e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152583  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4006  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.5 
 
 
497 aa  236  7e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503851  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1889  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.38 
 
 
515 aa  235  1e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3273  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  43.35 
 
 
485 aa  236  1e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5142  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  44.23 
 
 
614 aa  235  2e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309432  normal  0.441282 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3234  2-alkenal reductase  46.65 
 
 
575 aa  234  5e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222667  normal  0.0363808 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11001  serine protease pepD  44.72 
 
 
464 aa  233  7e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.3367e-05  normal  0.424973 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07340  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  41.54 
 
 
552 aa  233  8e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.191801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2919  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.65 
 
 
558 aa  233  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  hitchhiker  0.00800528 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06450  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  45.11 
 
 
517 aa  232  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2158  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.5 
 
 
507 aa  231  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0489221  normal  0.0113989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25880  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  44.88 
 
 
537 aa  231  3e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5199  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.52 
 
 
640 aa  229  9e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.219359  normal  0.800514 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0813  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.27 
 
 
485 aa  228  2e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.71 
 
 
417 aa  228  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.63894  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10940  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  41.81 
 
 
539 aa  226  1e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  3.45024e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0705  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.16 
 
 
439 aa  226  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1353  trypsin-like serine protease  42.16 
 
 
673 aa  225  2e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1153  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.85 
 
 
436 aa  225  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  normal  0.0134445 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4842  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.32 
 
 
456 aa  224  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.369386 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.28 
 
 
545 aa  222  2e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331753  normal  0.316507 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2743  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  37.64 
 
 
545 aa  220  6e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24150  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  42.99 
 
 
515 aa  219  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  37.14 
 
 
415 aa  219  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  36.62 
 
 
453 aa  218  3e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  7.22472e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2202  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.11 
 
 
497 aa  218  3e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.718376  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11247  serine protease htrA  44.52 
 
 
528 aa  218  3e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.039312  hitchhiker  0.00292251 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0797  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.41 
 
 
512 aa  217  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4494  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.37 
 
 
496 aa  216  8e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.18457  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3622  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.69 
 
 
486 aa  213  7e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0344622  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  44 
 
 
511 aa  213  8e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  3.07319e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  42.62 
 
 
506 aa  213  9e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0850  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.56 
 
 
475 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0867  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.56 
 
 
475 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0856  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.56 
 
 
475 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0131628  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  36.43 
 
 
389 aa  212  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7403  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.9 
 
 
618 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  43.3 
 
 
411 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  42.57 
 
 
505 aa  211  3e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0535  2-alkenal reductase  44.41 
 
 
469 aa  211  3e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.474663  normal  0.227386 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  42.86 
 
 
498 aa  210  4e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1344  trypsin  39.37 
 
 
594 aa  211  4e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0379667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  41.31 
 
 
424 aa  210  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  45.02 
 
 
420 aa  208  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  40.98 
 
 
504 aa  208  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3888  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.03 
 
 
506 aa  208  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  41.75 
 
 
391 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  43.2 
 
 
513 aa  207  4e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.39 
 
 
415 aa  207  5e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  40.71 
 
 
408 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5068  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.29 
 
 
416 aa  206  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.705563  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  42.05 
 
 
385 aa  205  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  41.05 
 
 
471 aa  206  1e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16811  trypsin-like serine protease  38.59 
 
 
376 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  41 
 
 
402 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  40.8 
 
 
467 aa  204  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  40.59 
 
 
408 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  42.62 
 
 
393 aa  204  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.6371e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.28 
 
 
428 aa  203  7e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.72 
 
 
387 aa  203  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1943  2-alkenal reductase  41.16 
 
 
418 aa  202  1e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.768183 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0764  peptidase S1C, Do  39.53 
 
 
471 aa  202  1e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000251476  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  43.34 
 
 
475 aa  202  1e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1069  PDZ/DHR/GLGF domain protein  41.61 
 
 
497 aa  202  2e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.905759  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1125  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.35 
 
 
523 aa  202  2e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33278  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16941  trypsin-like serine protease  38.31 
 
 
376 aa  201  2e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  43.3 
 
 
457 aa  201  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0497  protease DO  41.64 
 
 
472 aa  201  4e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0231688  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1242  protease DO  41.84 
 
 
472 aa  200  5e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  2.25025e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  41.9 
 
 
500 aa  200  6e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  42.36 
 
 
466 aa  200  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  8.36052e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.52 
 
 
423 aa  199  1e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.58 
 
 
384 aa  199  1e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  40.83 
 
 
461 aa  199  1e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>