166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0067 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0067  HNH endonuclease  100 
 
 
458 aa  936  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4861  HNH endonuclease  45.39 
 
 
472 aa  331  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.254841 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  35.4 
 
 
441 aa  213  6e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3452  HNH endonuclease  35.75 
 
 
341 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01520  HNH endonuclease  31.36 
 
 
504 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2095  hypothetical protein  54.72 
 
 
122 aa  119  2e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2508  hypothetical protein  27.37 
 
 
441 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.0045565  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0436  hypothetical protein  26.85 
 
 
430 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257628  normal  0.0261589 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0426  hypothetical protein  26.85 
 
 
434 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2479  hypothetical protein  26.48 
 
 
430 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1187  hypothetical protein  26.85 
 
 
430 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102985  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1204  hypothetical protein  26.85 
 
 
430 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1214  hypothetical protein  26.85 
 
 
426 aa  100  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0413  hypothetical protein  26.85 
 
 
426 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2442  hypothetical protein  25.94 
 
 
440 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  28.84 
 
 
469 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3732  hypothetical protein  26 
 
 
438 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3805  hypothetical protein  26 
 
 
438 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.482154  normal  0.0784296 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2516  hypothetical protein  25.65 
 
 
445 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  25.81 
 
 
408 aa  93.6  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2471  hypothetical protein  25.65 
 
 
445 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11790  hypothetical protein  25.7 
 
 
418 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.8127e-48  hitchhiker  5.99328e-06 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  28.78 
 
 
485 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5006  hypothetical protein  25.56 
 
 
435 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0237713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5094  hypothetical protein  25.56 
 
 
435 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0514803  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1846  hypothetical protein  25.75 
 
 
434 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785639  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0040  hypothetical protein  26.84 
 
 
436 aa  90.1  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  27.4 
 
 
413 aa  88.2  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0273  hypothetical protein  25.6 
 
 
466 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.88175  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3744  hypothetical protein  25.25 
 
 
436 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4558  hypothetical protein  25.06 
 
 
489 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361669  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2332  HNH endonuclease  24.37 
 
 
620 aa  85.9  1e-15  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.611085 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5387  hypothetical protein  24.44 
 
 
437 aa  83.2  1e-14  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  39.34 
 
 
661 aa  82.8  1e-14  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1988  hypothetical protein  24.44 
 
 
436 aa  81.3  3e-14  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  25.52 
 
 
407 aa  80.9  5e-14  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  31.63 
 
 
561 aa  79.3  1e-13  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  30.86 
 
 
546 aa  78.2  3e-13  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  36.13 
 
 
494 aa  76.6  8e-13  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  3.78313e-06  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2401  hypothetical protein  42.37 
 
 
256 aa  76.6  9e-13  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  40 
 
 
627 aa  74.7  3e-12  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4621  hypothetical protein  43.22 
 
 
481 aa  74.7  3e-12  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.957856  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  32.79 
 
 
442 aa  73.9  6e-12  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2373  hypothetical protein  42.37 
 
 
480 aa  72.8  1e-11  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.022356 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  38.46 
 
 
572 aa  73.2  1e-11  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3314  hypothetical protein  24.37 
 
 
526 aa  72.4  1e-11  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0608226  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  37.76 
 
 
469 aa  72  2e-11  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  26.79 
 
 
414 aa  71.6  3e-11  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1199  hypothetical protein  23.87 
 
 
505 aa  71.2  4e-11  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  34.55 
 
 
432 aa  68.6  2e-10  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2809  HNH endonuclease  35.09 
 
 
255 aa  68.9  2e-10  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1280  HNH nuclease  34.21 
 
 
414 aa  68.9  2e-10  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  39.36 
 
 
464 aa  68.6  2e-10  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  29.24 
 
 
391 aa  67.8  4e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1865  HNH endonuclease  45.78 
 
 
142 aa  67.8  4e-10  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  25.89 
 
 
414 aa  66.6  8e-10  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  39.8 
 
 
540 aa  65.5  2e-09  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  35.4 
 
 
508 aa  63.2  9e-09  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  35.4 
 
 
222 aa  63.2  1e-08  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  43.21 
 
 
532 aa  61.6  3e-08  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  34.82 
 
 
605 aa  60.5  6e-08  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  42.5 
 
 
531 aa  60.5  7e-08  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2470  protein of unknown function DUF222  42.5 
 
 
437 aa  60.1  8e-08  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  47.62 
 
 
447 aa  58.5  2e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  47.62 
 
 
492 aa  58.5  2e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  36.19 
 
 
580 aa  58.9  2e-07  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  26.84 
 
 
580 aa  58.2  3e-07  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  50 
 
 
473 aa  58.5  3e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  37.36 
 
 
446 aa  58.2  3e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  49.21 
 
 
448 aa  57.8  4e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  25.85 
 
 
499 aa  57.8  4e-07  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  47.62 
 
 
444 aa  57.4  5e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  33.63 
 
 
507 aa  57.4  5e-07  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  47.62 
 
 
444 aa  57.4  5e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  47.62 
 
 
444 aa  57.4  5e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  35.24 
 
 
584 aa  57.4  6e-07  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  46.03 
 
 
493 aa  57.4  6e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  35.24 
 
 
558 aa  57  6e-07  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  46.77 
 
 
492 aa  57.4  6e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  46.77 
 
 
492 aa  57.4  6e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  35.24 
 
 
535 aa  56.6  9e-07  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4610  hypothetical protein  47.62 
 
 
448 aa  56.6  9e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  46.03 
 
 
442 aa  55.1  2e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2749  hypothetical protein  46.77 
 
 
473 aa  55.5  2e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.621595  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2793  hypothetical protein  46.77 
 
 
473 aa  55.5  2e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.925956  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  46.03 
 
 
442 aa  55.1  2e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  34.74 
 
 
518 aa  53.9  6e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  34.74 
 
 
497 aa  53.9  6e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  34.74 
 
 
464 aa  53.9  6e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3851  hypothetical protein  32.98 
 
 
513 aa  53.9  6e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.432378 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3050  hypothetical protein  32.98 
 
 
495 aa  53.9  7e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0327  hypothetical protein  44.44 
 
 
490 aa  52.8  1e-05  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01610  hypothetical protein  30.97 
 
 
538 aa  52  2e-05  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.746521  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  33.63 
 
 
556 aa  52  2e-05  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  34.69 
 
 
512 aa  50.8  5e-05  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  30.09 
 
 
585 aa  50.8  5e-05  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  33.64 
 
 
551 aa  50.4  6e-05  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  30.09 
 
 
566 aa  50.4  6e-05  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4288  protein of unknown function DUF222  24.47 
 
 
524 aa  50.4  7e-05  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.429378  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5865  hypothetical protein  37.66 
 
 
511 aa  50.1  9e-05  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563621  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>