29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0065 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0065  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  249  6e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7249  hypothetical protein  92.47 
 
 
104 aa  177  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121942  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0516  hypothetical protein  69.09 
 
 
111 aa  155  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.307623  decreased coverage  0.000464389 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0300  hypothetical protein  77.08 
 
 
98 aa  154  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.572667  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1020  hypothetical protein  75.26 
 
 
120 aa  153  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.452901  hitchhiker  0.000337165 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0428  hypothetical protein  75 
 
 
101 aa  153  9e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.621933  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1642  hypothetical protein  73.2 
 
 
135 aa  151  3e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1570  hypothetical protein  66.96 
 
 
121 aa  150  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146653  normal  0.0127829 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4929  hypothetical protein  76.34 
 
 
99 aa  150  7e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9318  hypothetical protein  72.92 
 
 
100 aa  149  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2700  hypothetical protein  70.71 
 
 
104 aa  148  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0357766  normal  0.762347 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0400  hypothetical protein  74.47 
 
 
97 aa  147  4e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.291534  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0235  hypothetical protein  75.26 
 
 
101 aa  147  4e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0701  hypothetical protein  70.71 
 
 
100 aa  146  1e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3461  hypothetical protein  67.68 
 
 
104 aa  146  1e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.886335  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3472  hypothetical protein  67.68 
 
 
104 aa  146  1e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0110001 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3524  hypothetical protein  67.68 
 
 
104 aa  146  1e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.193303  normal  0.514462 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3838  hypothetical protein  72.34 
 
 
104 aa  145  2e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12400  hypothetical protein  71.28 
 
 
105 aa  145  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04640  hypothetical protein  73.2 
 
 
98 aa  143  7e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.866148  normal  0.749762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9033  hypothetical protein  68.37 
 
 
98 aa  143  8e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2767  Transcription regulator of the Arc/MetJ class- like protein  66.36 
 
 
117 aa  142  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.07573  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3148  hypothetical protein  72.45 
 
 
98 aa  142  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.425898  hitchhiker  0.00395835 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0534  hypothetical protein  71.43 
 
 
98 aa  141  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.517904  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0564  hypothetical protein  70.21 
 
 
94 aa  138  2e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0030  hypothetical protein  68.09 
 
 
103 aa  137  5e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3164  hypothetical protein  67.71 
 
 
170 aa  134  3e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0467  hypothetical protein  68.04 
 
 
99 aa  134  3e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.35047  normal  0.201608 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0155  hypothetical protein  75 
 
 
127 aa  132  2e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0157279  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>