More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0061 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0061  zinc uptake regulator  100 
 
 
142 aa  286  7e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7263  ferric uptake regulator family protein  82.22 
 
 
175 aa  230  6e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2340  ferric uptake regulator family protein  59.68 
 
 
135 aa  159  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1536  ferric uptake regulator, Fur family  55.56 
 
 
130 aa  155  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.451133  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3230  ferric uptake regulator, Fur family  54.26 
 
 
150 aa  152  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0854036  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0856  zinc uptake regulator  57.26 
 
 
129 aa  152  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.763265  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2171  ferric uptake regulator, Fur family  59.38 
 
 
133 aa  151  3e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00854605  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3370  ferric uptake regulator, Fur family  61.9 
 
 
167 aa  151  3e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.073099  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7037  ferric uptake regulator, Fur family  58.02 
 
 
150 aa  150  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2745  ferric uptake regulator, Fur family  52.27 
 
 
138 aa  149  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3820  ferric uptake regulator family protein  58.27 
 
 
131 aa  147  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.396621  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2638  zinc uptake regulator  52.55 
 
 
154 aa  147  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1599  ferric uptake regulator, Fur family  61.11 
 
 
135 aa  147  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2717  ferric uptake regulator family protein  56.69 
 
 
134 aa  147  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3458  zinc uptake regulator  54.81 
 
 
131 aa  146  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.455544  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3447  zinc uptake regulator  54.81 
 
 
131 aa  146  8e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0819749  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3510  zinc uptake regulator  54.81 
 
 
131 aa  146  8e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11469  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  56.8 
 
 
130 aa  145  1e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2373  ferric uptake regulator, Fur family  51.82 
 
 
154 aa  144  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.16204e-08 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1179  Fur family ferric uptake regulator  53.23 
 
 
142 aa  144  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.462177  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0734  ferric uptake regulator, Fur family  55.93 
 
 
123 aa  144  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264881  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2730  ferric uptake regulator family protein  57.03 
 
 
150 aa  144  4e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2543  ferric-uptake regulator  55.91 
 
 
187 aa  144  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37741  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13670  zinc uptake regulator, Fur family  57.66 
 
 
142 aa  143  9e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07800  zinc uptake regulator, Fur family  56.39 
 
 
148 aa  142  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4538  ferric uptake regulator family protein  56.25 
 
 
134 aa  142  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148082  normal  0.344615 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2085  zinc uptake regulator  51.49 
 
 
138 aa  140  6e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1772  ferric uptake regulator, Fur family  56.1 
 
 
141 aa  139  2e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.431388  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13650  zinc uptake regulator, Fur family  54.62 
 
 
136 aa  138  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.357837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1261  ferric uptake regulator, Fur family  56.82 
 
 
141 aa  137  4e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1934  zinc uptake regulator  54.84 
 
 
135 aa  137  4e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395595  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0885  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  54.47 
 
 
142 aa  137  7e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3150  ferric-uptake regulator  52.76 
 
 
137 aa  132  2e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0066  ferric uptake regulator, Fur family  49.6 
 
 
137 aa  131  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11800  zinc uptake regulator, Fur family  50.39 
 
 
129 aa  130  4e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00894406  normal  0.765019 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17110  zinc uptake regulator, Fur family  47.66 
 
 
138 aa  130  9e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184262  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2442  ferric uptake regulator, Fur family  44.44 
 
 
131 aa  119  2e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  1.68746e-06 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1040  transcriptional regulator, Fur family  46.34 
 
 
134 aa  119  2e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  36.8 
 
 
143 aa  92  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  36 
 
 
143 aa  91.7  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.64453e-12  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  35.2 
 
 
143 aa  91.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  1.2945e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  35.2 
 
 
143 aa  90.9  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  35.2 
 
 
153 aa  89.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  4.99535e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  37.1 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  31.03 
 
 
147 aa  85.1  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  33.85 
 
 
154 aa  80.1  9e-15  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  30.77 
 
 
146 aa  79  2e-14  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  31.5 
 
 
143 aa  78.2  3e-14  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  32.8 
 
 
167 aa  77.8  4e-14  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  32.8 
 
 
167 aa  77.4  5e-14  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  32.8 
 
 
167 aa  77.4  5e-14  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  27.54 
 
 
146 aa  77.4  6e-14  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.38692e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0149  ferric uptake regulator, Fur family  33.07 
 
 
139 aa  77.4  6e-14  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  9.46287e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  28.57 
 
 
148 aa  77.4  7e-14  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4383  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 
132 aa  76.3  1e-13  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.134348 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0342  ferric uptake regulator family protein  34.78 
 
 
237 aa  76.6  1e-13  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.087099  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  29.23 
 
 
149 aa  75.5  3e-13  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0842  ferric uptake regulator, Fur family  34.09 
 
 
152 aa  75.1  3e-13  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1024  ferric uptake regulator, Fur family  34.11 
 
 
131 aa  75.1  3e-13  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.215149  hitchhiker  0.00554488 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1084  ferric uptake regulator, Fur family  31.78 
 
 
144 aa  74.3  5e-13  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.784641  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3601  ferric uptake regulator, Fur family  31.47 
 
 
144 aa  74.3  5e-13  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3535  ferric uptake regulator, Fur family  31.47 
 
 
144 aa  73.9  7e-13  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  26.95 
 
 
151 aa  73.6  8e-13  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  31.82 
 
 
154 aa  73.9  8e-13  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.54751e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4413  ferric uptake regulator, Fur family  34.85 
 
 
147 aa  73.6  8e-13  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00116957  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3508  ferric uptake regulator  32.8 
 
 
134 aa  73.6  8e-13  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0519  ferric uptake regulator family protein  34.62 
 
 
135 aa  72.8  1e-12  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.639512  normal  0.494415 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19031  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 
134 aa  73.2  1e-12  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.442263  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  27.97 
 
 
157 aa  72.8  1e-12  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11321  ferric uptake regulator family protein  33.88 
 
 
144 aa  73.6  1e-12  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.948862  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  27.97 
 
 
157 aa  72.8  1e-12  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1033  ferric uptake regulator family  33.33 
 
 
146 aa  72.8  2e-12  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08960  ferric uptake regulator, Fur family  28.03 
 
 
134 aa  72.4  2e-12  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  28.15 
 
 
152 aa  72.4  2e-12  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11321  ferric uptake regulator family protein  30.37 
 
 
144 aa  72.4  2e-12  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  31.25 
 
 
143 aa  72.4  2e-12  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  27.66 
 
 
159 aa  71.6  3e-12  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0817  ferric uptake regulator family protein  33.08 
 
 
130 aa  71.6  3e-12  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  25.56 
 
 
145 aa  72  3e-12  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.48432e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  32.52 
 
 
139 aa  72  3e-12  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  28.26 
 
 
157 aa  71.6  3e-12  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  30.28 
 
 
149 aa  71.6  4e-12  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  30.28 
 
 
149 aa  71.6  4e-12  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0101  ferric uptake regulator, Fur family  34.62 
 
 
139 aa  70.9  5e-12  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133113  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1373  ferric uptake regulator, Fur family  28.06 
 
 
135 aa  70.9  6e-12  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  5.36701e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  27.13 
 
 
144 aa  70.9  6e-12  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0603  ferric uptake regulator family protein  36.79 
 
 
138 aa  70.5  8e-12  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.401566  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2248  ferric uptake regulator, Fur family  32.52 
 
 
133 aa  70.5  8e-12  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0111232 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1279  transcriptional regulator, Fur family  31.45 
 
 
141 aa  70.5  8e-12  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  4.71651e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1041  ferric uptake regulator family protein  29.63 
 
 
144 aa  70.1  9e-12  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.213524  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
149 aa  70.1  9e-12  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4174  ferric uptake regulator, Fur family  33.06 
 
 
132 aa  69.7  1e-11  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  28.57 
 
 
147 aa  70.1  1e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  29.69 
 
 
142 aa  69.7  1e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11241  ferric uptake regulator family protein  31.75 
 
 
135 aa  70.1  1e-11  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.934792  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  29.69 
 
 
142 aa  69.7  1e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.15951e-12 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4134  ferric uptake regulator, Fur family  33.06 
 
 
132 aa  69.7  1e-11  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0135  ferric uptake regulator, Fur family  30.94 
 
 
139 aa  69.7  1e-11  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  2.97915e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4742  ferric uptake regulator, Fur family  36.67 
 
 
154 aa  70.1  1e-11  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0603  ferric uptake regulator family protein  31.25 
 
 
143 aa  68.9  2e-11  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>