More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0049 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0049  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like  100 
 
 
111 aa  219  1e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.777277  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  63.49 
 
 
324 aa  77  7e-14  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  57.81 
 
 
247 aa  77  7e-14  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  44.87 
 
 
297 aa  76.3  1e-13  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  50 
 
 
299 aa  75.9  2e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  56.45 
 
 
302 aa  75.9  2e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  55.56 
 
 
315 aa  75.1  3e-13  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  53.52 
 
 
307 aa  75.1  3e-13  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  56.06 
 
 
320 aa  73.9  6e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  52.05 
 
 
311 aa  73.2  1e-12  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  56.45 
 
 
318 aa  72.4  2e-12  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  47.62 
 
 
293 aa  72.8  2e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  53.97 
 
 
293 aa  72  2e-12  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  61.02 
 
 
305 aa  72.4  2e-12  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  53.97 
 
 
293 aa  72  3e-12  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4872  ABC transporter related  45.45 
 
 
339 aa  72  3e-12  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1987  ABC transporter, ATP-binding protein  52.38 
 
 
314 aa  71.2  4e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00134078  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  56.45 
 
 
319 aa  71.2  5e-12  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  52.46 
 
 
368 aa  70.9  5e-12  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  56.45 
 
 
306 aa  70.9  5e-12  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  58.93 
 
 
457 aa  70.9  5e-12  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2486  ATP-binding protein  52.46 
 
 
318 aa  71.2  5e-12  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  50 
 
 
309 aa  71.2  5e-12  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  43.75 
 
 
308 aa  70.9  6e-12  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  50.79 
 
 
305 aa  70.9  6e-12  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  54.84 
 
 
303 aa  70.9  6e-12  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  56.45 
 
 
304 aa  70.9  6e-12  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  50.68 
 
 
311 aa  70.5  7e-12  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  51.56 
 
 
578 aa  70.5  8e-12  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0100  ABC transporter, ATP-binding protein  46.77 
 
 
330 aa  70.5  8e-12  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.174206 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  53.23 
 
 
314 aa  70.5  8e-12  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  53.85 
 
 
339 aa  70.1  9e-12  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6186  ABC transporter related  47.44 
 
 
317 aa  70.1  9e-12  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7276  ABC transporter related  58.06 
 
 
307 aa  70.1  9e-12  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  53.23 
 
 
305 aa  70.1  9e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0809  ABC transporter-related protein  50 
 
 
308 aa  70.1  9e-12  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0407465  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  51.61 
 
 
316 aa  70.1  9e-12  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  51.61 
 
 
308 aa  70.1  1e-11  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0153  ABC transporter related  54.79 
 
 
316 aa  70.1  1e-11  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00972111  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  49.45 
 
 
339 aa  70.1  1e-11  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  51.56 
 
 
909 aa  69.7  1e-11  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  51.61 
 
 
346 aa  69.7  1e-11  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0090  ABC transporter-like protein  42.86 
 
 
312 aa  69.7  1e-11  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.101268 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  57.38 
 
 
339 aa  69.7  1e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  54.84 
 
 
313 aa  69.7  1e-11  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  53.23 
 
 
234 aa  69.7  1e-11  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1245  ABC transporter related protein  53.97 
 
 
313 aa  68.9  2e-11  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  43.08 
 
 
309 aa  68.9  2e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  43.08 
 
 
309 aa  68.9  2e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1526  ABC transporter related protein  53.23 
 
 
305 aa  68.9  2e-11  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  51.61 
 
 
368 aa  69.3  2e-11  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  54.84 
 
 
314 aa  68.9  2e-11  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  46.05 
 
 
245 aa  68.9  2e-11  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  50 
 
 
344 aa  69.3  2e-11  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  51.61 
 
 
373 aa  68.9  2e-11  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  43.55 
 
 
317 aa  69.3  2e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  53.23 
 
 
310 aa  68.6  3e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  50.79 
 
 
318 aa  68.2  3e-11  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  51.61 
 
 
317 aa  68.6  3e-11  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  51.61 
 
 
309 aa  68.6  3e-11  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  43.08 
 
 
309 aa  68.6  3e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  50 
 
 
331 aa  68.2  3e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0632  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  49.18 
 
 
318 aa  68.6  3e-11  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  42.86 
 
 
339 aa  68.2  3e-11  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  56.45 
 
 
311 aa  68.2  3e-11  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0253  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  43.08 
 
 
309 aa  68.6  3e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  42.86 
 
 
339 aa  68.2  3e-11  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  53.03 
 
 
318 aa  68.6  3e-11  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  53.23 
 
 
335 aa  68.6  3e-11  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  45.57 
 
 
316 aa  68.6  3e-11  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  53.23 
 
 
355 aa  68.6  3e-11  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  53.23 
 
 
298 aa  68.2  4e-11  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  43.08 
 
 
306 aa  68.2  4e-11  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  8.16769e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2039  ABC transporter-like protein protein  52.31 
 
 
339 aa  68.2  4e-11  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  46.25 
 
 
1171 aa  68.2  4e-11  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  54.84 
 
 
303 aa  68.2  4e-11  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  43.04 
 
 
328 aa  67.8  4e-11  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0652  ABC transporter related  46.97 
 
 
307 aa  67.8  5e-11  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.673494  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0576  ABC transporter related  47.3 
 
 
264 aa  67.8  5e-11  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.490377  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3716  ABC transporter related  40.91 
 
 
313 aa  67.8  5e-11  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0016772  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  46.77 
 
 
310 aa  67.4  6e-11  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  59.02 
 
 
245 aa  67.4  6e-11  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  46.97 
 
 
310 aa  67.4  6e-11  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  48.39 
 
 
361 aa  67.4  6e-11  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  50 
 
 
310 aa  67.4  6e-11  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  6.02484e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  46.34 
 
 
328 aa  67.4  6e-11  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1356  ABC transporter related protein  43.56 
 
 
814 aa  67.4  6e-11  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  53.97 
 
 
314 aa  67.4  6e-11  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  52 
 
 
302 aa  67.8  6e-11  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  54.1 
 
 
330 aa  67.4  7e-11  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3301  ABC transporter related protein  53.03 
 
 
306 aa  67.4  7e-11  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.377119  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  41.98 
 
 
308 aa  67  7e-11  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  52.38 
 
 
302 aa  67  7e-11  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  54.69 
 
 
325 aa  67.4  7e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1172  ABC transporter related  52.46 
 
 
243 aa  67.4  7e-11  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  50.82 
 
 
305 aa  67  7e-11  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
346 aa  67  8e-11  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  50.77 
 
 
244 aa  67  8e-11  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2148  ATPase  48.35 
 
 
340 aa  67  8e-11  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.96125  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  46.77 
 
 
240 aa  67  8e-11  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>