More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0045 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4356  glucose-6-phosphate isomerase  66.73 
 
 
543 aa  714  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05060  glucose-6-phosphate isomerase  60.61 
 
 
552 aa  686  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3080  glucose-6-phosphate isomerase  65.56 
 
 
550 aa  688  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.562717  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3272  glucose-6-phosphate isomerase  65.56 
 
 
546 aa  690  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.701393  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1334  Glucose-6-phosphate isomerase  62.16 
 
 
565 aa  652  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.994679  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3178  glucose-6-phosphate isomerase  65.74 
 
 
546 aa  693  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1857  glucose-6-phosphate isomerase  65.13 
 
 
549 aa  704  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145522  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7286  glucose-6-phosphate isomerase  78.2 
 
 
570 aa  833  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.813116  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1304  glucose-6-phosphate isomerase  65.05 
 
 
649 aa  725  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0370  Glucose-6-phosphate isomerase  61.88 
 
 
561 aa  709  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4714  glucose-6-phosphate isomerase  63.28 
 
 
554 aa  684  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4420  glucose-6-phosphate isomerase  63.1 
 
 
554 aa  684  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89705  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0710  glucose-6-phosphate isomerase  67.34 
 
 
543 aa  724  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0210645  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3177  Glucose-6-phosphate isomerase  61.75 
 
 
548 aa  672  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00158404  hitchhiker  2.07698e-06 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2589  Glucose-6-phosphate isomerase  62.25 
 
 
569 aa  676  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0431757  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3338  Glucose-6-phosphate isomerase  59.67 
 
 
554 aa  638  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0469  glucose-6-phosphate isomerase  64.01 
 
 
546 aa  677  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7561  glucose-6-phosphate isomerase  64.64 
 
 
545 aa  678  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2191  Glucose-6-phosphate isomerase  67.58 
 
 
543 aa  745  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4334  glucose-6-phosphate isomerase  63.1 
 
 
554 aa  684  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4877  glucose-6-phosphate isomerase  63.12 
 
 
553 aa  673  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0045  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 
556 aa  1125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10963  glucose-6-phosphate isomerase  62.2 
 
 
553 aa  664  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.246514 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2539  Glucose-6-phosphate isomerase  58.56 
 
 
539 aa  632  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2924  glucose-6-phosphate isomerase  58.56 
 
 
539 aa  632  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0183  Glucose-6-phosphate isomerase  58.55 
 
 
571 aa  628  1e-179  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1463  glucose-6-phosphate isomerase  58.66 
 
 
561 aa  619  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0410491 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0292  glucose-6-phosphate isomerase  58.93 
 
 
570 aa  617  1e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11040  glucose-6-phosphate isomerase  56.74 
 
 
564 aa  613  1e-174  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0493698  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0343  glucose-6-phosphate isomerase  54.82 
 
 
564 aa  613  1e-174  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1247  glucose-6-phosphate isomerase  56.25 
 
 
546 aa  612  1e-174  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237953  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3918  glucose-6-phosphate isomerase  55.8 
 
 
548 aa  608  1e-172  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588557  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0302  glucose-6-phosphate isomerase  55.8 
 
 
548 aa  608  1e-172  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.19722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0373  glucose-6-phosphate isomerase  55.8 
 
 
548 aa  608  1e-172  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0472  glucose-6-phosphate isomerase  54.68 
 
 
567 aa  601  1e-171  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  55.62 
 
 
547 aa  598  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1025  glucose-6-phosphate isomerase  54.8 
 
 
566 aa  600  1e-170  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4477  glucose-6-phosphate isomerase  55.25 
 
 
548 aa  601  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2986  Glucose-6-phosphate isomerase  58.09 
 
 
541 aa  600  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1161  glucose-6-phosphate isomerase  53.99 
 
 
552 aa  595  1e-169  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.149944  normal  0.283638 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1311  Glucose-6-phosphate isomerase  57.33 
 
 
560 aa  595  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.15279  normal  0.0112098 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1318  glucose-6-phosphate isomerase  53.26 
 
 
568 aa  589  1e-167  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.321309 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  53.36 
 
 
559 aa  588  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  2.44755e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  54.08 
 
 
549 aa  588  1e-167  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5504  glucose-6-phosphate isomerase  54.91 
 
 
549 aa  585  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0373  glucose-6-phosphate isomerase  55.07 
 
 
549 aa  587  1e-166  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  54.93 
 
 
548 aa  586  1e-166  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3768  glucose-6-phosphate isomerase  54.25 
 
 
549 aa  585  1e-166  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03857  hypothetical protein  54.91 
 
 
549 aa  585  1e-166  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03897  glucose-6-phosphate isomerase  54.91 
 
 
549 aa  585  1e-166  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3972  Glucose-6-phosphate isomerase  55.09 
 
 
549 aa  587  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4005  glucose-6-phosphate isomerase  54.91 
 
 
549 aa  585  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.684976 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4573  glucose-6-phosphate isomerase  54.61 
 
 
549 aa  585  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4530  glucose-6-phosphate isomerase  54.91 
 
 
549 aa  585  1e-166  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4264  glucose-6-phosphate isomerase  54.61 
 
 
549 aa  585  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  55.33 
 
 
560 aa  582  1e-165  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3946  glucose-6-phosphate isomerase  54.07 
 
 
549 aa  584  1e-165  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2367  glucose phosphate isomerase  53.28 
 
 
548 aa  583  1e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.94926e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4486  glucose-6-phosphate isomerase  54.73 
 
 
549 aa  583  1e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1231  Glucose-6-phosphate isomerase  53.08 
 
 
549 aa  582  1e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89106  hitchhiker  0.000628963 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4615  glucose-6-phosphate isomerase  54.36 
 
 
549 aa  580  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.267215 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4563  glucose-6-phosphate isomerase  54.36 
 
 
549 aa  580  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.963608  normal  0.872816 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4563  glucose-6-phosphate isomerase  53.89 
 
 
549 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  0.0348478 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0463  glucose-6-phosphate isomerase  55.25 
 
 
550 aa  579  1e-164  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0938  glucose-6-phosphate isomerase  52.71 
 
 
549 aa  581  1e-164  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4478  glucose-6-phosphate isomerase  53.89 
 
 
549 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4412  glucose-6-phosphate isomerase  53.89 
 
 
549 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.0629525 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  53.26 
 
 
562 aa  577  1e-163  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0230  glucose-6-phosphate isomerase  53.82 
 
 
549 aa  578  1e-163  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0355158  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0481  Glucose-6-phosphate isomerase  53.39 
 
 
552 aa  575  1e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.734703 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0385  glucose-6-phosphate isomerase  52.62 
 
 
550 aa  573  1e-162  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412831  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0280  Glucose-6-phosphate isomerase  51.9 
 
 
548 aa  571  1e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0655697  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  53.31 
 
 
548 aa  572  1e-162  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  3.8742e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0903  glucose-6-phosphate isomerase  53.48 
 
 
549 aa  573  1e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5494  Glucose-6-phosphate isomerase  52.57 
 
 
550 aa  569  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0138523 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1325  glucose-6-phosphate isomerase  53.69 
 
 
531 aa  571  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0252663  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1386  glucose-6-phosphate isomerase  55.84 
 
 
545 aa  568  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214201  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2785  glucose-6-phosphate isomerase  52.26 
 
 
550 aa  565  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0501561  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2947  glucose-6-phosphate isomerase  55.91 
 
 
547 aa  565  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3591  glucose-6-phosphate isomerase  53.61 
 
 
550 aa  567  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0324  glucose-6-phosphate isomerase  52.44 
 
 
550 aa  565  1e-159  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1339  glucose-6-phosphate isomerase  53.26 
 
 
548 aa  564  1e-159  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803183  unclonable  1.58602e-06 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002341  glucose-6-phosphate isomerase  51.18 
 
 
550 aa  558  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00012  glucose-6-phosphate isomerase  51.36 
 
 
550 aa  560  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23924  isomerase glucose-6-phosphate isomerase  50.82 
 
 
554 aa  560  1e-158  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1935  glucose-6-phosphate isomerase  53.01 
 
 
547 aa  556  1e-157  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2494  Glucose-6-phosphate isomerase  53.83 
 
 
551 aa  557  1e-157  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0974  glucose-6-phosphate isomerase  53.94 
 
 
550 aa  551  1e-156  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0649451  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3594  glucose-6-phosphate isomerase  49.82 
 
 
554 aa  551  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1879  glucose-6-phosphate isomerase  53.65 
 
 
541 aa  550  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10773  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0285  glucose-6-phosphate isomerase  54.61 
 
 
549 aa  547  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.542029  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0995  Glucose-6-phosphate isomerase  52.36 
 
 
547 aa  547  1e-154  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0012  glucose-6-phosphate isomerase  49.73 
 
 
553 aa  546  1e-154  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.350529  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0299  glucose-6-phosphate isomerase  54.61 
 
 
549 aa  547  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.921042  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0070  glucose-6-phosphate isomerase  53.05 
 
 
545 aa  543  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4700  glucose-6-phosphate isomerase  49.64 
 
 
554 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0570543  hitchhiker  0.00570528 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0732  glucose-6-phosphate isomerase  49.46 
 
 
554 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309434  hitchhiker  8.15529e-05 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04050  glucose-6-phosphate isomerase, putative  51.36 
 
 
556 aa  544  1e-153  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4018  glucose-6-phosphate isomerase  50.72 
 
 
548 aa  544  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0959  glucose-6-phosphate isomerase  49.01 
 
 
554 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>