More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0044 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
863 aa  1681  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  83.56 
 
 
892 aa  501  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  36.57 
 
 
719 aa  350  9e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  53.8 
 
 
737 aa  307  4e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6773  serine/threonine protein kinase  57.29 
 
 
518 aa  293  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117813  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  57.68 
 
 
807 aa  290  7e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  46.73 
 
 
1030 aa  268  5e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  50 
 
 
716 aa  259  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  44.68 
 
 
1351 aa  247  7e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  44.13 
 
 
1750 aa  246  1e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  50.52 
 
 
850 aa  243  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  47.54 
 
 
770 aa  238  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  46.24 
 
 
732 aa  237  8e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4910  serine/threonine protein kinase  39.61 
 
 
552 aa  236  2e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104206  decreased coverage  0.00224255 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  46.62 
 
 
772 aa  231  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1125  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  46.5 
 
 
682 aa  226  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4090  serine/threonine protein kinase  50.35 
 
 
756 aa  211  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.252638  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0242  serine/threonine protein kinase  47.17 
 
 
295 aa  201  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443533 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  39.82 
 
 
1763 aa  198  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  42.11 
 
 
623 aa  193  9e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  39.31 
 
 
963 aa  180  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  37.18 
 
 
1051 aa  178  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  40.23 
 
 
1057 aa  176  2e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.23 
 
 
645 aa  174  9e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.74 
 
 
667 aa  172  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  41.61 
 
 
439 aa  172  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  37.74 
 
 
651 aa  172  3e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0577  serine/threonine protein kinase  40.22 
 
 
520 aa  171  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.08 
 
 
641 aa  170  8e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  38.95 
 
 
951 aa  169  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.61 
 
 
520 aa  169  3e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  39.03 
 
 
620 aa  169  3e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  39.44 
 
 
468 aa  168  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  41.89 
 
 
468 aa  167  7e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  38.55 
 
 
1053 aa  167  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  37.69 
 
 
776 aa  167  9e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  37.98 
 
 
776 aa  166  2e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4235  serine/threonine protein kinase  37.89 
 
 
381 aa  165  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  35.53 
 
 
1026 aa  165  4e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3845  protein kinase  41.51 
 
 
531 aa  164  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111657  hitchhiker  0.000135014 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11292  transmembrane serine/threonine-protein kinase H pknH  33.17 
 
 
626 aa  164  6e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.74937e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2438  Serine/threonine protein kinase-like protein  39.85 
 
 
620 aa  164  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00115665 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3876  serine/threonine protein kinase  37.72 
 
 
565 aa  164  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0438  protein kinase  35.66 
 
 
457 aa  164  7e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.841838  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.5 
 
 
584 aa  164  8e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0263  serine/threonine protein kinase  37.46 
 
 
894 aa  164  8e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925108  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  40.21 
 
 
646 aa  164  9e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2219  serine/threonine protein kinase  34.67 
 
 
862 aa  163  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318627  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  38.3 
 
 
2296 aa  163  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0422  serine/threonine protein kinase  36.96 
 
 
600 aa  163  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709913  normal  0.835899 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  34.6 
 
 
625 aa  163  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  39.76 
 
 
740 aa  163  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3396  serine/threonine protein kinase  36.76 
 
 
604 aa  162  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0692149  normal  0.384469 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  37.98 
 
 
673 aa  161  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  39.38 
 
 
1018 aa  160  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  4.03487e-05 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8472  serine/threonine protein kinase  39.53 
 
 
1104 aa  160  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.748496 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1251  serine/threonine protein kinase  37.58 
 
 
568 aa  160  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272131  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  38.27 
 
 
1032 aa  160  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  38.27 
 
 
1032 aa  160  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.92 
 
 
551 aa  160  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  37.41 
 
 
2831 aa  159  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0020  serine/threonine protein kinase  38.46 
 
 
632 aa  159  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  39.62 
 
 
666 aa  159  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  40.07 
 
 
763 aa  159  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0382  serine/threonine protein kinase  37.87 
 
 
583 aa  159  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1670  protein kinase  40.78 
 
 
1073 aa  158  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.375386 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  39.23 
 
 
599 aa  158  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3104  Serine/threonine protein kinase-related protein  34.94 
 
 
659 aa  157  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.96028  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  38.32 
 
 
1034 aa  157  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  37.41 
 
 
1130 aa  157  7e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.52 
 
 
614 aa  157  7e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  37.13 
 
 
661 aa  157  8e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.14 
 
 
700 aa  157  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2578  serine/threonine protein kinase  36.59 
 
 
985 aa  157  9e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790371  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2132  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.92 
 
 
499 aa  156  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0346111  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  38.99 
 
 
623 aa  156  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1202  serine/threonine protein kinase  38.17 
 
 
655 aa  157  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.101789  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0335  serine/threonine protein kinase  34.86 
 
 
671 aa  156  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.656897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  34.36 
 
 
691 aa  156  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1995  Serine/threonine protein kinase-like protein  38.97 
 
 
682 aa  157  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.215989  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  37.45 
 
 
612 aa  155  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0201  serine/threonine protein kinase  34.66 
 
 
729 aa  155  3e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.33 
 
 
647 aa  155  3e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1389  protein kinase  40.54 
 
 
412 aa  155  3e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00892717  normal  0.37108 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4988  serine/threonine protein kinase  37.12 
 
 
773 aa  155  3e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0218503  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6755  serine/threonine protein kinase  37.23 
 
 
597 aa  155  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0496  serine/threonine protein kinase  36.3 
 
 
450 aa  154  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4605  serine/threonine protein kinase  39.25 
 
 
618 aa  154  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  2.14735e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7672  Serine/threonine protein kinase-like protein  39.07 
 
 
650 aa  154  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17007  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5408  serine/threonine protein kinase  38.71 
 
 
622 aa  154  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212471  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7673  protein kinase  37.87 
 
 
572 aa  154  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683245  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.89 
 
 
603 aa  154  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2255  serine/threonine protein kinase  38.55 
 
 
450 aa  154  7e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0020  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.63 
 
 
648 aa  154  7e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6475e-06 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.5 
 
 
579 aa  154  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  35.41 
 
 
692 aa  154  7e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1113  protein kinase  39.47 
 
 
620 aa  154  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273994  normal  0.0338435 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.34 
 
 
658 aa  153  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  37.97 
 
 
646 aa  153  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.36 
 
 
668 aa  153  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>