297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0043 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
532 aa  1057  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7289  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.97 
 
 
542 aa  538  1e-152  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0772845  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  41.78 
 
 
487 aa  360  4e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.6 
 
 
474 aa  265  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  37.01 
 
 
480 aa  231  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  9.29143e-06  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.26 
 
 
466 aa  231  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  31.6 
 
 
444 aa  227  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  31.81 
 
 
444 aa  224  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.76 
 
 
451 aa  222  1e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2404  FAD linked oxidase domain protein  37.81 
 
 
495 aa  220  6e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  hitchhiker  0.00629594 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0518  histidine kinase  33.46 
 
 
501 aa  209  8e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2448  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.52 
 
 
476 aa  205  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.370857  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  35.4 
 
 
461 aa  196  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  28.9 
 
 
448 aa  194  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  33.68 
 
 
468 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.19 
 
 
449 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.32 
 
 
492 aa  191  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  32.11 
 
 
461 aa  190  7e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3628  FAD linked oxidase domain protein  35.88 
 
 
451 aa  187  5e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.45 
 
 
461 aa  185  2e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  32.12 
 
 
479 aa  184  4e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  32.53 
 
 
479 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  32.73 
 
 
479 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  35.17 
 
 
456 aa  182  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  31.16 
 
 
463 aa  180  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.64 
 
 
490 aa  174  3e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  29.96 
 
 
461 aa  172  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.67 
 
 
479 aa  169  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0479  hypothetical protein  29.95 
 
 
328 aa  165  2e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0479005  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  30.31 
 
 
473 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  32.66 
 
 
465 aa  164  5e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.59 
 
 
472 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  30.69 
 
 
478 aa  161  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  32.52 
 
 
465 aa  161  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10062  oxidoreductase  32.46 
 
 
479 aa  159  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.761932 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.28 
 
 
490 aa  159  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  32.52 
 
 
462 aa  159  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  30.62 
 
 
477 aa  156  7e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  23.64 
 
 
448 aa  152  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  33.07 
 
 
466 aa  150  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.17 
 
 
478 aa  150  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  29.67 
 
 
473 aa  149  2e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0042  FAD linked oxidase domain protein  29.88 
 
 
545 aa  149  2e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  30.69 
 
 
477 aa  144  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.53 
 
 
464 aa  142  2e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.66 
 
 
444 aa  142  2e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  42.36 
 
 
462 aa  141  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  27.93 
 
 
465 aa  140  4e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  24.06 
 
 
448 aa  140  4e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  28.26 
 
 
602 aa  140  5e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  39.66 
 
 
499 aa  140  7e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.96481e-14 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  28.09 
 
 
462 aa  140  7e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  1.515e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  39.75 
 
 
459 aa  140  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.8 
 
 
469 aa  139  9e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  40.23 
 
 
446 aa  139  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.07 
 
 
465 aa  139  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  36.24 
 
 
463 aa  137  7e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10388  glucooligosaccharide oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14340)  31.66 
 
 
471 aa  135  1e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451589  normal  0.284571 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  36.84 
 
 
458 aa  135  2e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.3 
 
 
448 aa  134  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  31.17 
 
 
465 aa  133  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  30.14 
 
 
470 aa  133  8e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  30.18 
 
 
456 aa  130  5e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.1 
 
 
461 aa  129  1e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5613  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.48 
 
 
445 aa  129  2e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  38.06 
 
 
469 aa  127  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  31.76 
 
 
474 aa  126  8e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  32.66 
 
 
764 aa  126  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  41.18 
 
 
460 aa  125  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.86 
 
 
472 aa  125  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  38.43 
 
 
466 aa  123  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  44.83 
 
 
465 aa  122  1e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  32.32 
 
 
758 aa  122  2e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  38.46 
 
 
476 aa  122  2e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3854  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.2 
 
 
574 aa  120  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  36.71 
 
 
474 aa  120  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1510  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.23 
 
 
614 aa  120  9e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  29.37 
 
 
449 aa  120  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2842  FAD linked oxidase domain protein  31.23 
 
 
864 aa  119  1e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0215386 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1411  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.86 
 
 
891 aa  119  2e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  38.52 
 
 
456 aa  118  2e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1503  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.04 
 
 
864 aa  119  2e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1539  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.04 
 
 
864 aa  119  2e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416598  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2758  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.5 
 
 
896 aa  117  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2650  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.5 
 
 
896 aa  117  7e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2583  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.5 
 
 
896 aa  117  7e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.15241 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0639  FAD linked oxidase domain protein  33.48 
 
 
454 aa  116  9e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  28.43 
 
 
473 aa  116  1e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  30.59 
 
 
754 aa  115  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  30.09 
 
 
436 aa  114  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  31.69 
 
 
753 aa  113  8e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000469  probable oxidoreductase  29.06 
 
 
563 aa  112  2e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0940249  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1694  FAD-binding protein  32.99 
 
 
894 aa  112  2e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4665  Berberine/berberine domain protein  28.02 
 
 
529 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.293743  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0127  FAD linked oxidase domain protein  28.52 
 
 
775 aa  108  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.48716 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.69 
 
 
481 aa  108  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3700  Berberine/berberine domain protein  28.4 
 
 
508 aa  108  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  32.32 
 
 
447 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  39.41 
 
 
461 aa  107  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.78 
 
 
460 aa  107  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>