15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0039 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0039  hypothetical protein  100 
 
 
813 aa  1522  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468555  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7293  hypothetical protein  55.4 
 
 
1095 aa  410  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.35344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0163  hypothetical protein  26.13 
 
 
771 aa  57.8  8e-07  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5275  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  27.34 
 
 
698 aa  53.5  1e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  21.6 
 
 
3409 aa  54.3  1e-05  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0147  chromosome partitioning ATPase  24.52 
 
 
899 aa  52.8  2e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0073  chromosome partitioning ATPase  25.58 
 
 
619 aa  53.5  2e-05  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  30.34 
 
 
2449 aa  52.4  3e-05  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6711  chromosome partitioning ATPase  25.8 
 
 
495 aa  52  4e-05  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0077  chromosome partitioning-like ATPase  26.18 
 
 
639 aa  51.6  6e-05  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.989213  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3058  chromosome partitioning-like ATPase  26.84 
 
 
926 aa  50.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0128  chromosome partitioning ATPase  25.8 
 
 
665 aa  48.5  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1098  chromosome partitioning ATPase  25.8 
 
 
1132 aa  47  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8473  chromosome partitioning ATPase  26.91 
 
 
968 aa  45.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0137  hypothetical protein  25.66 
 
 
1519 aa  45.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>