23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0035 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0035  putative integral membrane protein  100 
 
 
500 aa  1004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7297  putative integral membrane protein  91.6 
 
 
500 aa  889  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0189864 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06750  hypothetical protein  32.59 
 
 
487 aa  233  5e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00170  putative integral membrane protein  32.93 
 
 
487 aa  227  4e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0819  hypothetical protein  31.35 
 
 
486 aa  219  8e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8940  putative integral membrane protein  36.9 
 
 
519 aa  217  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0680972  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0443  hypothetical protein  33.82 
 
 
487 aa  211  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5434  hypothetical protein  34.21 
 
 
513 aa  196  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1340  hypothetical protein  29.75 
 
 
514 aa  126  8e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8297  hypothetical protein  25.57 
 
 
509 aa  114  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0686  hypothetical protein  28.21 
 
 
503 aa  98.2  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06460  hypothetical protein  25.64 
 
 
529 aa  98.2  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.381999  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5523  hypothetical protein  25.84 
 
 
489 aa  92.8  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941713  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3323  hypothetical protein  25.74 
 
 
566 aa  88.2  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.34323  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4503  hypothetical protein  23.11 
 
 
502 aa  83.2  1e-14  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4712  hypothetical protein  24.56 
 
 
521 aa  79.7  1e-13  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.188886  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0369  hypothetical protein  25.67 
 
 
495 aa  77  7e-13  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4214  hypothetical protein  24 
 
 
502 aa  76.6  9e-13  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4558  narrowly conserved hypothetical protein  25.12 
 
 
502 aa  76.3  1e-12  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.167516 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2242  hypothetical protein  25.42 
 
 
501 aa  70.1  9e-11  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4278  hypothetical protein  23.94 
 
 
503 aa  69.7  1e-10  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1571  hypothetical protein  27.09 
 
 
502 aa  65.5  2e-09  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.321873  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0204  hypothetical protein  28.32 
 
 
399 aa  43.9  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.706683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>