257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0033 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0033  PBP family phospholipid-binding protein  100 
 
 
180 aa  361  4e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0019  PEBP family protein  72.78 
 
 
180 aa  256  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0912  PBP family phospholipid-binding protein  64.77 
 
 
178 aa  231  3e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0224568  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4114  PEBP family protein  59.09 
 
 
177 aa  212  3e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5877  PEBP family protein  59.89 
 
 
175 aa  211  6e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4535  PEBP family protein  59.66 
 
 
177 aa  208  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.460349  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2718  PEBP family protein  56.67 
 
 
181 aa  192  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2116  PBP family phospholipid-binding protein  58.96 
 
 
178 aa  191  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2599  PBP family phospholipid-binding protein  55.93 
 
 
175 aa  189  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0610588  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3288  PEBP family protein  55.75 
 
 
176 aa  188  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0439012  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3175  PBP family phospholipid-binding protein  53.45 
 
 
178 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273283  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3225  PBP family phospholipid-binding protein  53.45 
 
 
178 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127408  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3163  PBP family phospholipid-binding protein  53.45 
 
 
178 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.650541  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2196  PEBP family protein  58.76 
 
 
180 aa  186  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00567412  hitchhiker  0.00102935 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3314  PEBP family protein  54.6 
 
 
179 aa  184  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3038  PEBP family protein  54.65 
 
 
178 aa  182  2e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38600  phospholipid-binding protein, PBP family  51.11 
 
 
182 aa  182  2e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21340  phospholipid-binding protein, PBP family  53.41 
 
 
176 aa  182  2e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0437018  normal  0.157291 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6437  PEBP family protein  53.67 
 
 
171 aa  182  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0858  PEBP family protein  54.29 
 
 
174 aa  181  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2290  PEBP family protein  51.41 
 
 
175 aa  178  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.971123  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8937  PEBP family protein  54.6 
 
 
173 aa  172  2e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.995518  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1308  putative kinase inhibitor protein  55.97 
 
 
160 aa  172  2e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12170  hypothetical protein  53.14 
 
 
176 aa  172  2e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.662377 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2129  PEBP family protein  51.74 
 
 
178 aa  171  4e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3488  PEBP family protein  51.74 
 
 
178 aa  170  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274615  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4403  PEBP family protein  50.3 
 
 
174 aa  166  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5580  PEBP family protein  53.85 
 
 
173 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.759464 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2434  PEBP family protein  49.42 
 
 
181 aa  164  7e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0392819  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0942  putative kinase inhibitor protein  51.88 
 
 
158 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.770781 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  47.88 
 
 
179 aa  161  4e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0856  putative kinase inhibitor protein  51.25 
 
 
158 aa  160  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.524056  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0919  putative kinase inhibitor protein  51.25 
 
 
158 aa  160  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0887  putative kinase inhibitor protein  51.25 
 
 
158 aa  160  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0828  putative kinase inhibitor protein  51.25 
 
 
158 aa  160  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.354915  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0921  putative kinase inhibitor protein  51.25 
 
 
158 aa  160  8e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168155  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04720  phospholipid-binding protein, PBP family  47.16 
 
 
179 aa  160  9e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.583132  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00757  hypothetical protein  50.62 
 
 
158 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259899  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0836  putative kinase inhibitor protein  50.62 
 
 
158 aa  160  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.145482  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0827  putative kinase inhibitor protein  50.62 
 
 
158 aa  160  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000771777  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2870  putative kinase inhibitor protein  50.62 
 
 
158 aa  160  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0113599  normal  0.0521651 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2869  PEBP family protein  50.62 
 
 
158 aa  160  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00740  predicted kinase inhibitor  50.62 
 
 
158 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0173432  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2579  putative kinase inhibitor protein  51.25 
 
 
158 aa  159  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0939329  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0796  putative kinase inhibitor protein  50.62 
 
 
158 aa  159  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0510178  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1618  PEBP family protein  47.46 
 
 
171 aa  158  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.82166 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0693  PBP family phospholipid-binding protein  48.45 
 
 
164 aa  158  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0102847 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2615  YbhB and YbcL  48.78 
 
 
247 aa  158  4e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0671  PEBP family protein  48.45 
 
 
164 aa  158  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636068  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2043  PEBP family protein  48.59 
 
 
180 aa  158  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3239  YbhB and YbcL  47.56 
 
 
207 aa  152  3e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1145  putative kinase inhibitor protein  52.8 
 
 
163 aa  150  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4884  hypothetical protein  42.35 
 
 
186 aa  150  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1458  PEBP family protein  45.96 
 
 
184 aa  147  7e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0354948  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4564  PEBP family protein  47.06 
 
 
181 aa  147  1e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320834  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4302  PEBP family protein  47.06 
 
 
181 aa  146  2e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1992  PEBP family protein  48.48 
 
 
180 aa  146  2e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0110  PBP family phospholipid-binding protein  47.85 
 
 
180 aa  145  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1506  PBP family phospholipid-binding protein  44.1 
 
 
190 aa  142  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  5.87287e-05  hitchhiker  7.12833e-05 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1141  PEBP family protein  48.03 
 
 
167 aa  140  1e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3372  PBP family phospholipid-binding protein  48.03 
 
 
167 aa  139  2e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00311199  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3134  PEBP family protein  51.11 
 
 
206 aa  139  2e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1122  hypothetical protein  50.37 
 
 
182 aa  138  4e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  9.45628e-18 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00500  hypothetical protein  45 
 
 
183 aa  138  4e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.269505  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00495  predicted kinase inhibitor  45 
 
 
183 aa  138  4e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.325407  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1246  PEBP family protein  42.86 
 
 
175 aa  137  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1156  hypothetical protein  50.37 
 
 
182 aa  137  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.245103  normal  0.982011 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1597  PEBP family protein  41.98 
 
 
183 aa  137  8e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.82719  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0904  hypothetical protein  41.36 
 
 
167 aa  137  8e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1190  hypothetical protein  50.37 
 
 
182 aa  137  8e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1039  hypothetical protein  50.37 
 
 
182 aa  137  8e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.584639  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2035  putative kinase inhibitor  44.38 
 
 
183 aa  137  9e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3047  hypothetical protein  39.13 
 
 
185 aa  137  9e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1269  hypothetical protein  41.98 
 
 
170 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1114  phosphatidylethanolamine-binding protein  41.98 
 
 
170 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.516187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1108  hypothetical protein  41.98 
 
 
170 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1952  PBP family phospholipid-binding protein  43.48 
 
 
179 aa  137  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.028514  normal  0.707107 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0969  hypothetical protein  41.98 
 
 
170 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113679  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3014  hypothetical protein  41.98 
 
 
170 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1144  hypothetical protein  50.37 
 
 
182 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11356  normal  0.247575 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3037  hypothetical protein  41.98 
 
 
170 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.930194  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2774  PBP family phospholipid-binding protein  45.34 
 
 
169 aa  136  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.504548  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1917  PEBP family protein  43.4 
 
 
174 aa  134  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.184289 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3869  PBP family phospholipid-binding protein  44.1 
 
 
182 aa  134  5e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0607284 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1558  hypothetical protein  44.3 
 
 
154 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198245  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2475  PEBP family protein  47.85 
 
 
164 aa  134  6e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.276536 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4082  PEBP family protein  45.45 
 
 
179 aa  134  1e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3665  PBP family phospholipid-binding protein  44.1 
 
 
182 aa  133  1e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3974  PEBP family protein  45.45 
 
 
179 aa  133  1e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4169  PEBP family protein  45.45 
 
 
179 aa  133  1e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0985  PEBP family protein  48.89 
 
 
189 aa  132  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340221  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4051  PEBP family protein  45.34 
 
 
179 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12230  conserved hypothetical protein TIGR00481  45.73 
 
 
161 aa  132  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.888512  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0780  PEBP family protein  49.38 
 
 
162 aa  131  4e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06342  hypothetical protein  44.1 
 
 
177 aa  131  4e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2142  PEBP family protein  52.14 
 
 
169 aa  132  4e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485422  hitchhiker  0.000233727 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3516  PEBP family protein  41.61 
 
 
165 aa  131  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0316  phosphatidylethanolamine-binding protein  44.1 
 
 
159 aa  131  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2590  PEBP family protein  41.61 
 
 
165 aa  131  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001407  phospholipid-binding protein  44.05 
 
 
177 aa  131  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>