More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0031 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  528  1e-149  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  68.83 
 
 
363 aa  338  6e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  62.31 
 
 
237 aa  249  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  2.35996e-05 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  60.8 
 
 
237 aa  246  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  52.83 
 
 
249 aa  230  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35260  uncharacterized membrane-associated protein  52.61 
 
 
277 aa  229  3e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  53.02 
 
 
259 aa  218  7e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.16146e-09 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  51.67 
 
 
286 aa  214  1e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  50.97 
 
 
256 aa  213  3e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4065  SNARE associated Golgi protein-like protein  51.82 
 
 
240 aa  202  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4379  hypothetical protein  52.45 
 
 
234 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.76296  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  51.91 
 
 
227 aa  186  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5157  SNARE associated Golgi protein  43.26 
 
 
235 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  46.84 
 
 
221 aa  180  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0668  hypothetical protein  43.72 
 
 
232 aa  179  3e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0237  hypothetical protein  44.16 
 
 
236 aa  178  9e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0509  SNARE associated Golgi protein-related protein  46.77 
 
 
239 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  47.15 
 
 
458 aa  174  1e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4066  SNARE associated Golgi protein-like protein  47.06 
 
 
248 aa  174  1e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  48.39 
 
 
218 aa  174  2e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4180  SNARE associated Golgi protein  47.39 
 
 
246 aa  172  4e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531841  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30240  uncharacterized membrane-associated protein  46.6 
 
 
228 aa  172  6e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.397546 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  42.93 
 
 
219 aa  172  7e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  42.93 
 
 
219 aa  172  8e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  42.93 
 
 
219 aa  171  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  41.75 
 
 
219 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  41.75 
 
 
219 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  41.75 
 
 
219 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  41.75 
 
 
219 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  42.86 
 
 
219 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  43 
 
 
221 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  42.41 
 
 
219 aa  166  3e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  42.41 
 
 
219 aa  166  3e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  42.41 
 
 
219 aa  166  3e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.64425 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  42.41 
 
 
219 aa  166  3e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  42.41 
 
 
219 aa  166  3e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  42.41 
 
 
219 aa  166  3e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  41 
 
 
220 aa  166  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  43.37 
 
 
220 aa  164  1e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  44.32 
 
 
213 aa  163  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  40.88 
 
 
221 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0086  SNARE associated Golgi protein  42.13 
 
 
216 aa  162  4e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.862215  hitchhiker  0.00916794 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0208  SNARE associated Golgi protein-like protein  44.23 
 
 
226 aa  162  5e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  40.5 
 
 
221 aa  161  9e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  41.24 
 
 
219 aa  161  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0512  hypothetical protein  45.33 
 
 
231 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0501  hypothetical protein  45.33 
 
 
231 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0490  hypothetical protein  45.33 
 
 
231 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  40.8 
 
 
209 aa  160  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  39.78 
 
 
221 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  39.09 
 
 
220 aa  159  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  42.29 
 
 
220 aa  159  6e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  42.29 
 
 
220 aa  159  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0179  SNARE associated Golgi protein-related protein  45.41 
 
 
229 aa  159  6e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.843652  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  42.29 
 
 
220 aa  159  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  46.41 
 
 
222 aa  158  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  37.88 
 
 
217 aa  158  9e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  42.13 
 
 
201 aa  157  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  41.33 
 
 
232 aa  156  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  45.16 
 
 
222 aa  156  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  43.55 
 
 
230 aa  155  5e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  43.48 
 
 
219 aa  154  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  42.31 
 
 
218 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  48.43 
 
 
198 aa  154  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  46.24 
 
 
216 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  47.51 
 
 
223 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3379  SNARE associated Golgi protein-related protein  42.22 
 
 
216 aa  152  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3208  DedA protein (DSG-1 protein)  41.08 
 
 
215 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.043821  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  42.16 
 
 
244 aa  149  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8388  SNARE associated Golgi protein  41.5 
 
 
244 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  43.72 
 
 
213 aa  149  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  41.05 
 
 
219 aa  148  1e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3305  DedA protein (DSG-1 protein)  39.89 
 
 
215 aa  147  2e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25714  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4353  DedA family membrane protein  42.86 
 
 
247 aa  145  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  42.93 
 
 
220 aa  145  7e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  40.8 
 
 
202 aa  144  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1653  SNARE associated Golgi protein  45.27 
 
 
214 aa  143  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  39.67 
 
 
220 aa  143  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  43.21 
 
 
206 aa  143  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  36.99 
 
 
215 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.654254 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  38.17 
 
 
230 aa  142  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  44.62 
 
 
231 aa  142  5e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1368  integral membrane protein  35.94 
 
 
221 aa  142  7e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377957  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1543  DedA family protein  44.3 
 
 
202 aa  141  1e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.201859  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  38.34 
 
 
216 aa  140  2e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  37.7 
 
 
211 aa  140  2e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0392  DedA family protein  41.27 
 
 
241 aa  140  2e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  35.35 
 
 
245 aa  139  4e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0632  DedA family protein  43.62 
 
 
202 aa  139  4e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4994  hypothetical protein  36.81 
 
 
216 aa  139  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4069  SNARE associated Golgi protein  34.54 
 
 
219 aa  138  9e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00208186  hitchhiker  0.00137396 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  35.36 
 
 
213 aa  138  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  38.32 
 
 
218 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27115  predicted protein  41.57 
 
 
252 aa  137  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000197052  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0592  SNARE associated Golgi protein  36.78 
 
 
215 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  41.67 
 
 
237 aa  137  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4444  SNARE associated Golgi protein  36.07 
 
 
218 aa  136  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  40.32 
 
 
214 aa  135  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  37.72 
 
 
218 aa  136  5e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  38.41 
 
 
204 aa  135  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  1.22435e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>