80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0030 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0030  secretory lipase  100 
 
 
442 aa  865  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0016  secretory lipase  58.64 
 
 
367 aa  337  3e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118927  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1425  secretory lipase  36.24 
 
 
417 aa  189  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283647  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0321  Triacylglycerol lipase  34.7 
 
 
444 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3126  secretory lipase  35.82 
 
 
406 aa  159  9e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0242733  normal  0.0408746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3821  secretory lipase  31.48 
 
 
420 aa  154  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0583502  normal  0.737344 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0584  secretory lipase  33.44 
 
 
413 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4826  Triacylglycerol lipase  34.07 
 
 
392 aa  141  2e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2000  secretory lipase  34.05 
 
 
385 aa  135  2e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.524449 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38210  acetyl esterase (deacetylase)  34.98 
 
 
415 aa  129  1e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.579943  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1435  secretory lipase  25.71 
 
 
433 aa  125  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.765919  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0910  secretory lipase  32.81 
 
 
346 aa  121  2e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.307152 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2321  secretory lipase family protein  30.3 
 
 
410 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65291  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1100  putative secretory lipase  30.3 
 
 
410 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1013  putative secretory lipase  30.3 
 
 
410 aa  120  4e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1520  secretory lipase  31 
 
 
376 aa  115  1e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3995  secretory lipase  31.58 
 
 
427 aa  115  2e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0441069 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1203  secretory lipase  23.15 
 
 
434 aa  114  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3524  secretory lipase  31.58 
 
 
427 aa  113  7e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1338  triacylglycerol lipase  30.23 
 
 
433 aa  111  2e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1356  triacylglycerol lipase  30.23 
 
 
433 aa  111  2e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1374  triacylglycerol lipase  30.23 
 
 
433 aa  111  2e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141016  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0550  secretory lipase  26.36 
 
 
432 aa  110  4e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.70438  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1850  secretory lipase family protein  30.29 
 
 
377 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0883  secretory lipase family protein  30.29 
 
 
377 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.644932  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0585  secretory lipase family protein  30.29 
 
 
426 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566733  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0329  secretory lipase  28.77 
 
 
417 aa  103  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.282596 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3922  secretory lipase  31.27 
 
 
366 aa  100  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0253176  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1352  hypothetical protein  28.57 
 
 
388 aa  99  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2614  secretory lipase  31.58 
 
 
427 aa  99  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2478  secretory lipase  30.92 
 
 
379 aa  96.3  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02050  Secretory lipase  38.84 
 
 
451 aa  95.9  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0388  Triacylglycerol lipase  27.68 
 
 
422 aa  94  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0393  secretory lipase  25.07 
 
 
386 aa  93.2  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3563  secretory lipase  32.01 
 
 
383 aa  92.8  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.668389  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3330  secretory lipase  27.42 
 
 
407 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0474  secretory lipase  25.08 
 
 
376 aa  87.4  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0186  Triacylglycerol lipase  26.86 
 
 
481 aa  84  4e-15  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3161  hypothetical protein  32.18 
 
 
400 aa  83.6  6e-15  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0264  secretory lipase  28.61 
 
 
395 aa  83.6  7e-15  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3188  Triacylglycerol lipase  28.03 
 
 
464 aa  82.8  1e-14  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0920741  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0733  putative exported lipase  26.04 
 
 
397 aa  82  2e-14  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2597  secretory lipase  29.97 
 
 
405 aa  81.3  4e-14  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0972  secretory lipase  27.86 
 
 
375 aa  79.7  9e-14  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441802  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1063  secretory lipase  29.35 
 
 
409 aa  79.7  1e-13  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.108571  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1897  secretory lipase  30.36 
 
 
382 aa  77.8  4e-13  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1917  secretory lipase  30.15 
 
 
399 aa  74.7  3e-12  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.146897  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1963  secretory lipase  30.15 
 
 
399 aa  74.7  3e-12  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0465  secretory lipase  33.2 
 
 
439 aa  70.5  6e-11  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06773  conserved hypothetical protein  25.66 
 
 
448 aa  65.1  3e-09  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355363  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2256  secretory lipase  26.14 
 
 
397 aa  63.9  5e-09  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454748  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3621  triacylglycerol lipase  26.27 
 
 
450 aa  61.6  3e-08  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120078  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0763  hypothetical protein  23.7 
 
 
398 aa  60.8  5e-08  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.527561  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3087  triacylglycerol lipase  27.14 
 
 
450 aa  60.1  8e-08  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3070  triacylglycerol lipase  27.14 
 
 
450 aa  60.1  8e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3130  triacylglycerol lipase  27.14 
 
 
450 aa  60.1  8e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.648254 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01799  secretory lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00110)  23.91 
 
 
450 aa  59.3  1e-07  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0803381  normal  0.696532 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3251  hypothetical protein  27.55 
 
 
402 aa  58.5  2e-07  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.18778 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0814  secretory lipase  28.41 
 
 
444 aa  57.8  4e-07  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2796  triacylglycerol lipase  25.42 
 
 
450 aa  56.2  1e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.604768  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4975  hypothetical protein  27.69 
 
 
401 aa  55.5  2e-06  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.52355  hitchhiker  6.64128e-08 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11608  hypothetical protein  23.94 
 
 
446 aa  53.9  6e-06  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.166185  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28952  predicted protein  21.94 
 
 
482 aa  53.1  9e-06  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0716767  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0119  hypothetical protein  28.26 
 
 
215 aa  52.8  1e-05  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.564453  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1869  hypothetical protein  27.53 
 
 
422 aa  53.1  1e-05  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.931797  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1796  putative secreted lipase  25.65 
 
 
422 aa  51.2  3e-05  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0434  triacylglycerol lipase  26.64 
 
 
447 aa  50.8  4e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.601093  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0424  triacylglycerol lipase  26.64 
 
 
447 aa  50.8  4e-05  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424437  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0411  triacylglycerol lipase  26.64 
 
 
447 aa  50.8  4e-05  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.542327 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4620  triacylglycerol lipase  24.08 
 
 
440 aa  50.8  5e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102768 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5608  triacylglycerol lipase  24.08 
 
 
440 aa  50.1  7e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.440083 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5251  triacylglycerol lipase  24.08 
 
 
440 aa  50.1  7e-05  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0759  secretory lipase  26.03 
 
 
470 aa  49.7  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0085  triacylglycerol lipase  23.62 
 
 
438 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1795  putative secreted lipase  31.03 
 
 
420 aa  49.3  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325361  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02951  hypothetical protein  23.85 
 
 
426 aa  48.9  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1355  hypothetical protein  24.61 
 
 
424 aa  47.4  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.158226  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1291  putative secreted lipase  24.61 
 
 
424 aa  47.4  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2422  putative exported lipase  30.77 
 
 
201 aa  46.6  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0048  Triacylglycerol lipase  27.27 
 
 
432 aa  45.8  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>