More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0015 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0015  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 684 aa  1389    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1518  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  52.17 
 
 		 767 aa  555  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0706082  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0332  response regulator receiver protein  47.07 
 
 		 806 aa  522  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112355  normal  0.937153 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3032  glycosyl transferase family 2  46.56 
 
 		 627 aa  484  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.696996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 		 471 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  32.53 
 
 		 483 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 		 420 aa  94.7  5e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1499  glycosyl transferase family 2  31.88 
 
 		 432 aa  93.2  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824671  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1403  glycosyl transferase family 2  31.88 
 
 		 434 aa  93.2  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0691788  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  33.33 
 
 		 422 aa  92  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  25.26 
 
 		 399 aa  90.5  9e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1064  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 		 650 aa  89  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.132947 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2456  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 432 aa  88.2  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130133  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0998  glycosyl transferase family protein  29.19 
 
 		 686 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.759416  normal  0.641778 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2839  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 		 523 aa  86.7  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0886  glycosyl transferases  30.21 
 
 		 673 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  29.3 
 
 		 1101 aa  86.3  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1627  cell wall biogenesis glycosyltransferase  29.18 
 
 		 656 aa  84  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0402312  normal  0.167793 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1478  glycosyl transferase family 2  30.13 
 
 		 533 aa  84  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  24.94 
 
 		 446 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  29.15 
 
 		 423 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  25.18 
 
 		 509 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0296  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.35 
 
 		 630 aa  83.2  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  27.02 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  27.02 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 		 433 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5168  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 		 683 aa  82.4  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  33.14 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  28.57 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  27.24 
 
 		 662 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4863  glycosyl transferase family protein  29.34 
 
 		 461 aa  81.3  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907872  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  26.11 
 
 		 461 aa  80.9  0.00000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  26.91 
 
 		 633 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  24.94 
 
 		 509 aa  80.9  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  27.59 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2964  glycosyl transferase family 2  27.2 
 
 		 476 aa  80.5  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0324251  hitchhiker  0.00721921 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0424  glycosyl transferase family protein  27.81 
 
 		 652 aa  79.7  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.32532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0444  glycosyl transferase family protein  25.35 
 
 		 688 aa  80.5  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000329644 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  31.38 
 
 		 418 aa  80.1  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  27.24 
 
 		 505 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  26.4 
 
 		 433 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  30.61 
 
 		 421 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  27.02 
 
 		 433 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3769  glycosyl transferase family protein  27.53 
 
 		 632 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997629  normal  0.300264 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  29.86 
 
 		 417 aa  79.7  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.07 
 
 		 573 aa  79.3  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  28.32 
 
 		 410 aa  79.3  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  27.24 
 
 		 520 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  30.2 
 
 		 421 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2295  glycosyl transferase family protein  27.06 
 
 		 509 aa  79.3  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 		 520 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 		 520 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 		 520 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  25.86 
 
 		 476 aa  79.3  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  26.4 
 
 		 433 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  26.8 
 
 		 433 aa  79  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  26.8 
 
 		 433 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  26.8 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 		 433 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  30.2 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  27.42 
 
 		 442 aa  77.8  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2888  glycosyl transferase family 2  31.15 
 
 		 615 aa  77.8  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233699 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1675  glycosyl transferase family 2  26.21 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0705  glycosyl transferase family 2  31.43 
 
 		 501 aa  77.4  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0704  glycosyl transferase family 2  31.43 
 
 		 501 aa  77.4  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.441471  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  28.86 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_002978  WD0431  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.67 
 
 		 532 aa  76.6  0.000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.802283  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 		 395 aa  77  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  28.86 
 
 		 423 aa  77  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0714  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 		 501 aa  77  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  decreased coverage  0.00470024 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  28.86 
 
 		 423 aa  77  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0670  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 		 501 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2861  glycosyl transferase family protein  28.06 
 
 		 678 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.623061  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1372  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 		 859 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  27.1 
 
 		 442 aa  75.9  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  27 
 
 		 546 aa  75.9  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  25.67 
 
 		 475 aa  75.1  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  25.67 
 
 		 475 aa  75.1  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2388  glycosyl transferase  28.23 
 
 		 635 aa  74.7  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.445397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0014  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.41 
 
 		 656 aa  74.7  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 		 505 aa  74.3  0.000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2328  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.18 
 
 		 466 aa  74.3  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.417791  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22610  glycosyl transferase  27.14 
 
 		 497 aa  73.9  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634128  normal  0.441487 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3549  glycosyl transferase family protein  27.15 
 
 		 614 aa  73.9  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.877744 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3225  glycosyl transferase family protein  27.3 
 
 		 596 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0693647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2042  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.36 
 
 		 466 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0496  glycosyl transferase family protein  27.05 
 
 		 537 aa  73.2  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.741629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  27.8 
 
 		 425 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4425  glycosyl transferase family 2  26.71 
 
 		 476 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3420  glycosyl transferase family 2  25.99 
 
 		 616 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  27.8 
 
 		 425 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  26.77 
 
 		 428 aa  72.8  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1292  glycosyl transferase family protein  26.1 
 
 		 642 aa  72.4  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  28.29 
 
 		 451 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3421  N-glycosyltransferase  28.05 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4264  N-glycosyltransferase  28.05 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4102  N-glycosyltransferase  28.05 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0468214  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 		 502 aa  70.9  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0525  hypothetical protein  23.95 
 
 		 464 aa  70.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>