32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0013 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0013  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  383  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0009  hypothetical protein  82.54 
 
 
205 aa  283  1e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198242  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2147  hypothetical protein  67.89 
 
 
205 aa  248  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2876  hypothetical protein  60.21 
 
 
210 aa  242  2e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3661  hypothetical protein  62.3 
 
 
231 aa  238  5e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0598103  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8251  hypothetical protein  60.53 
 
 
210 aa  235  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0194223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0387  hypothetical protein  58.42 
 
 
212 aa  234  6e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5096  hypothetical protein  60 
 
 
223 aa  229  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0823672  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5184  hypothetical protein  60 
 
 
223 aa  229  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5475  hypothetical protein  60 
 
 
223 aa  229  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156291  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0569  hypothetical protein  58.73 
 
 
210 aa  221  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5715  hypothetical protein  60 
 
 
227 aa  221  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2796  hypothetical protein  60.42 
 
 
222 aa  221  7e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.551909  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1102  hypothetical protein  58.42 
 
 
224 aa  218  5e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3869  hypothetical protein  55.44 
 
 
233 aa  214  4e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3597  hypothetical protein  63.39 
 
 
235 aa  212  3e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2490  hypothetical protein  50 
 
 
204 aa  191  8e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144778  normal  0.0598589 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2009  hypothetical protein  50.27 
 
 
200 aa  179  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.567228  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2587  hypothetical protein  47.09 
 
 
204 aa  175  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3506  hypothetical protein  43.92 
 
 
209 aa  166  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.906839 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0492  hypothetical protein  42.93 
 
 
267 aa  124  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0148  hypothetical protein  32.86 
 
 
222 aa  48.1  8e-05  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.434014 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0289  hypothetical protein  31.16 
 
 
239 aa  47  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.159555  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0205  hypothetical protein  31.34 
 
 
222 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.314754 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0452  O-methyltransferase family 3  22.97 
 
 
346 aa  45.1  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1944  putative methyltransferase  25.45 
 
 
243 aa  44.3  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.197915  hitchhiker  6.42802e-05 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0073  O-methyltransferase family 3  23.24 
 
 
211 aa  43.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3689  hypothetical protein  44.74 
 
 
234 aa  42.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0358  hypothetical protein  29.11 
 
 
216 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0368  hypothetical protein  29.11 
 
 
216 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.810453  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0347  hypothetical protein  29.11 
 
 
216 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.834243 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2823  O-methyltransferase family 3  28.89 
 
 
227 aa  42  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>