More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0011 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  100 
 
 
243 aa  491  1e-138  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  75.97 
 
 
289 aa  364  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  62.71 
 
 
243 aa  319  3e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  60.17 
 
 
241 aa  318  5e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  62.71 
 
 
237 aa  314  1e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  58.51 
 
 
241 aa  307  9e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  59.75 
 
 
237 aa  304  1e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  58.9 
 
 
255 aa  303  1e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  58.05 
 
 
241 aa  297  9e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  59.32 
 
 
239 aa  292  3e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  57.63 
 
 
237 aa  291  9e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  55.79 
 
 
243 aa  284  9e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  55.79 
 
 
243 aa  284  9e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  55.79 
 
 
243 aa  284  9e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  60.49 
 
 
251 aa  274  1e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  52.85 
 
 
249 aa  265  5e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  47.7 
 
 
238 aa  229  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  44.35 
 
 
240 aa  219  4e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  48.1 
 
 
240 aa  210  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  43.22 
 
 
238 aa  199  2e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  41.98 
 
 
239 aa  189  5e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  41.45 
 
 
222 aa  147  1e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  28.99 
 
 
276 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5676  hypothetical protein  28.15 
 
 
272 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6255  methyltransferase domain-containing protein  28.68 
 
 
257 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72050  hypothetical protein  28.15 
 
 
278 aa  82.4  7e-15  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.892313  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  31.02 
 
 
293 aa  76.6  3e-13  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  29.71 
 
 
261 aa  76.6  4e-13  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  39.6 
 
 
266 aa  75.1  1e-12  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  31.35 
 
 
274 aa  74.7  1e-12  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72030  hypothetical protein  28.65 
 
 
287 aa  74.7  1e-12  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5678  hypothetical protein  28.09 
 
 
294 aa  74.3  2e-12  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.622302  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  36.63 
 
 
257 aa  71.2  1e-11  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  38 
 
 
276 aa  71.6  1e-11  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  29.63 
 
 
251 aa  70.1  3e-11  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2186  Methyltransferase type 11  35.09 
 
 
254 aa  67.8  1e-10  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  38.98 
 
 
278 aa  67.8  1e-10  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  39.23 
 
 
241 aa  67.4  2e-10  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  36.6 
 
 
254 aa  66.6  3e-10  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  36.6 
 
 
254 aa  66.6  3e-10  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  34.81 
 
 
207 aa  66.6  3e-10  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  39.13 
 
 
281 aa  66.6  4e-10  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2646  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
248 aa  66.2  4e-10  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.676764 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  30.36 
 
 
253 aa  66.2  5e-10  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  30.38 
 
 
222 aa  66.2  5e-10  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  36.31 
 
 
272 aa  65.9  5e-10  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 
237 aa  65.9  6e-10  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  34.65 
 
 
279 aa  65.9  6e-10  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  32.22 
 
 
711 aa  65.5  8e-10  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0732  methyltransferase type 11  37.01 
 
 
237 aa  65.1  9e-10  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  36.13 
 
 
261 aa  64.7  1e-09  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  36.44 
 
 
282 aa  65.1  1e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  34.4 
 
 
273 aa  64.7  1e-09  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  1.04492e-06 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.86 
 
 
258 aa  65.1  1e-09  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5881  methyltransferase type 11  37.19 
 
 
237 aa  63.9  2e-09  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4088  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 
244 aa  63.9  2e-09  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.78 
 
 
230 aa  63.9  2e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  38.94 
 
 
283 aa  63.9  2e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  29.07 
 
 
244 aa  64.3  2e-09  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  37.93 
 
 
207 aa  64.3  2e-09  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  32.59 
 
 
306 aa  63.9  2e-09  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3819  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.22 
 
 
248 aa  63.9  2e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2558  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 
288 aa  63.9  2e-09  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  32.84 
 
 
265 aa  63.5  3e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  36.28 
 
 
271 aa  63.5  3e-09  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.43 
 
 
277 aa  63.2  3e-09  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.65 
 
 
255 aa  63.5  3e-09  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  36.28 
 
 
242 aa  63.2  4e-09  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  35.29 
 
 
168 aa  62.8  5e-09  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  4.12649e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  29.33 
 
 
254 aa  62.4  6e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
710 aa  62.4  6e-09  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  28.33 
 
 
235 aa  62.4  7e-09  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  34.12 
 
 
255 aa  62.4  7e-09  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  31.06 
 
 
237 aa  62.4  7e-09  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  29.82 
 
 
254 aa  62  8e-09  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.16 
 
 
251 aa  62  9e-09  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.85 
 
 
233 aa  62  9e-09  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.18 
 
 
251 aa  61.6  1e-08  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.39 
 
 
254 aa  61.6  1e-08  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  34.17 
 
 
275 aa  61.6  1e-08  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.18 
 
 
251 aa  61.6  1e-08  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  47.01 
 
 
274 aa  61.2  1e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  38.79 
 
 
273 aa  61.2  1e-08  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  31.9 
 
 
225 aa  61.6  1e-08  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2343  methyltransferase type 11  36.75 
 
 
367 aa  61.2  1e-08  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.54 
 
 
251 aa  60.5  2e-08  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  45.76 
 
 
269 aa  60.8  2e-08  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.54 
 
 
251 aa  60.5  2e-08  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  33.33 
 
 
275 aa  60.8  2e-08  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4739  Methyltransferase type 11  43.27 
 
 
218 aa  60.8  2e-08  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.54 
 
 
251 aa  60.5  2e-08  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.25 
 
 
241 aa  60.5  2e-08  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  39.5 
 
 
208 aa  60.8  2e-08  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.54 
 
 
251 aa  60.5  2e-08  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.4 
 
 
345 aa  60.8  2e-08  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  34.71 
 
 
204 aa  61.2  2e-08  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  38.94 
 
 
272 aa  60.5  2e-08  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0147  Methyltransferase type 11  36.09 
 
 
240 aa  61.2  2e-08  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  37.82 
 
 
266 aa  60.1  3e-08  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.57 
 
 
256 aa  60.1  3e-08  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>