More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0010 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
467 aa  913  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  77.83 
 
 
458 aa  665  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2799  glycosyl transferase, group 1  55.88 
 
 
421 aa  426  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2137  glycosyl transferase group 1  55.69 
 
 
440 aa  415  1e-115  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.875323  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2873  group 1 glycosyl transferase  54.07 
 
 
421 aa  414  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0573  putative glycosyl transferase  57.14 
 
 
425 aa  405  1e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.478763  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3591  glycosyl transferase group 1  56.52 
 
 
416 aa  405  1e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8230  glycosyl transferase group 1  52.87 
 
 
414 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3658  glycosyl transferase group 1  54.18 
 
 
452 aa  395  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0710404  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0391  glycosyl transferase group 1  55.45 
 
 
457 aa  397  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.380998  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3877  glycosyl transferase group 1  51.61 
 
 
432 aa  392  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  51.2 
 
 
408 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  51.2 
 
 
408 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  51.2 
 
 
408 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5718  glycosyl transferase, group 1  50.83 
 
 
411 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1099  glycosyl transferase, group 1  50.36 
 
 
411 aa  354  2e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.593469  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  47.47 
 
 
457 aa  333  3e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  44.76 
 
 
452 aa  330  4e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  44.23 
 
 
421 aa  327  3e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0485  putative glycosyl transferase  42.38 
 
 
471 aa  325  9e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0489  glycosyl transferase group 1  48.33 
 
 
409 aa  265  1e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.610235  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2006  glycosyl transferase, group 1  40.43 
 
 
431 aa  251  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  38.08 
 
 
385 aa  122  2e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 
422 aa  118  2e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  32.88 
 
 
403 aa  119  2e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  33.59 
 
 
371 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  32.87 
 
 
394 aa  114  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  34.57 
 
 
419 aa  113  9e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 
446 aa  112  1e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  1.95577e-05 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  30.31 
 
 
406 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  33.22 
 
 
371 aa  111  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  29.64 
 
 
421 aa  111  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  30.72 
 
 
428 aa  110  4e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  35.54 
 
 
397 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  29.1 
 
 
351 aa  110  7e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  26.14 
 
 
388 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  30.58 
 
 
415 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 
369 aa  106  8e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  27.77 
 
 
423 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 
361 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0295  hypothetical protein  28.41 
 
 
413 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  33.47 
 
 
386 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  36.74 
 
 
396 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  34.77 
 
 
535 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  31.11 
 
 
443 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  39.08 
 
 
379 aa  103  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 
370 aa  103  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  33.6 
 
 
382 aa  103  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 
377 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  3.08882e-10 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  31.76 
 
 
398 aa  103  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  34.28 
 
 
384 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 
378 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  31.5 
 
 
413 aa  102  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  34.16 
 
 
400 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  31.19 
 
 
382 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  31.21 
 
 
427 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  32.8 
 
 
417 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 
434 aa  100  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  37.81 
 
 
367 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  31.4 
 
 
382 aa  100  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  29.26 
 
 
364 aa  100  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  29.23 
 
 
406 aa  100  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  38.25 
 
 
411 aa  99.8  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  26.14 
 
 
408 aa  99.8  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  34.32 
 
 
366 aa  98.6  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  40.17 
 
 
386 aa  98.6  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  6.47239e-05  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  33.62 
 
 
374 aa  98.6  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  34.98 
 
 
399 aa  99  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  38.5 
 
 
362 aa  99  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  29.45 
 
 
410 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  30.97 
 
 
336 aa  98.2  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.85845e-05 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1677  glycosyl transferase group 1  35.1 
 
 
365 aa  98.2  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  29.78 
 
 
431 aa  98.2  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 
419 aa  98.2  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2334  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 
376 aa  97.8  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0688579  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 
426 aa  97.4  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6400  glycosyl transferase group 1  38.91 
 
 
389 aa  97.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  30.04 
 
 
360 aa  97.4  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  28.28 
 
 
425 aa  97.4  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  1.63553e-09  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2183  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 
370 aa  97.1  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  28.34 
 
 
401 aa  97.1  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0722  glycosyl transferase group 1  32.31 
 
 
524 aa  96.7  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799351  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 
395 aa  96.3  9e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 
672 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  23.91 
 
 
394 aa  95.9  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
388 aa  96.3  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  32.25 
 
 
377 aa  95.9  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 
371 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  1.12819e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0330  glycosyl transferase group 1  37.2 
 
 
388 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0196896  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  38.21 
 
 
351 aa  95.5  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 
421 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 
402 aa  95.5  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 
380 aa  95.5  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 
353 aa  95.5  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.54 
 
 
388 aa  95.9  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  27.27 
 
 
375 aa  95.5  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  35.89 
 
 
471 aa  94.7  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 
437 aa  95.1  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  26.32 
 
 
375 aa  94.7  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 
437 aa  95.1  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>