248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_R0024 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_R0024  tRNA-Tyr  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000291994  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0043  tRNA-Tyr  98.85 
 
 		 87 bp  165  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000118909  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0010  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 87 bp  149  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367926  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0013  tRNA-Tyr  95.4 
 
 		 87 bp  141  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000223303  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0013  tRNA-Tyr  95.4 
 
 		 87 bp  141  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469327  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0003  tRNA-Tyr  97.78 
 
 		 86 bp  81.8  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0021  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.359257  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0047  tRNA-Tyr  90.14 
 
 		 86 bp  77.8  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0727081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0047  tRNA-Tyr  97.67 
 
 		 86 bp  77.8  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.460212  normal  0.496186 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0045  tRNA-Tyr  86.9 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000011189  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0015  tRNA-Tyr  95.35 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNATyrVIMSS1309080  tRNA-Tyr  95.35 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNATyrVIMSS1309112  tRNA-Tyr  95.35 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.722386  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNATyrVIMSS1309156  tRNA-Tyr  95.35 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0015  tRNA-Tyr  88.57 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216156  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0035  tRNA-Tyr  88.57 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283862  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0002  tRNA-Tyr  97.22 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000899619  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0046  tRNA-Tyr  95 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0063  tRNA-Tyr  88.89 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0528292  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0051  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0589159  unclonable  6.439e-24 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0020  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000168001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0068  tRNA-Tyr  97.14 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0042  tRNA-Tyr  93.02 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0035  tRNA-Tyr  93.02 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.923295  normal  0.851315 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0022  tRNA-Tyr  93.02 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0313146  normal  0.1141 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0015  tRNA-Tyr  85.9 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0010  tRNA-Tyr  85.9 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000639751  normal  0.164042 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNATyrVIMSS1309201  tRNA-Tyr  93.02 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0854141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNATyrVIMSS1309298  tRNA-Tyr  93.02 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0675624 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0020  tRNA-Tyr  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0047  tRNA-Tyr  86.67 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000137446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0008  tRNA-Tyr  85.9 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0023  tRNA-Tyr  88.06 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000280598  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0065  tRNA-Tyr  88.06 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.560905  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNATyrVIMSS1309353  tRNA-Tyr  93.02 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0034  tRNA-Tyr  93.02 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0365863  normal  0.384153 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0053  tRNA-Tyr  94.74 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798877 
 
 
-
 
NC_003295  RS05585  tRNA-Tyr  94.74 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000486194  normal  0.206056 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0058  tRNA-Tyr  94.74 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0117646  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0059  tRNA-Tyr  94.74 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0050  tRNA-Tyr  94.74 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.160697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0560  tRNA-Tyr  94.74 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000480165  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0023  tRNA-Tyr  86.36 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000432297  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0021  tRNA-Tyr  100 
 
 		 83 bp  58  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0029  tRNA-Tyr  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0007  tRNA-Tyr  100 
 
 		 83 bp  58  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0265739 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0009  tRNA-Tyr  100 
 
 		 83 bp  58  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0038  tRNA-Tyr  92.68 
 
 		 82 bp  58  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.105251 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0036  tRNA-Tyr  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.45022  normal  0.113165 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0033  tRNA-Tyr  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0028  tRNA-Tyr  100 
 
 		 83 bp  58  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0846245 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0064  tRNA-Tyr  83.91 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390421  hitchhiker  0.000177122 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0108  tRNA-Tyr  83.91 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000394419  hitchhiker  0.00222111 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00075  tRNA-Tyr  83.91 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000048411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0093  tRNA-Tyr  83.91 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000017829  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4352  tRNA-Tyr  83.91 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000588121  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Tyr-3  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000509746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5101  tRNA-Tyr  83.91 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000185347  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3797  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000392981  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0020  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000230184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0012  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000498022  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3087  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000100368  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0050  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00161887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0079  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4471  tRNA-Tyr  83.91 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0000736073  hitchhiker  0.00060065 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0065  tRNA-Tyr  83.91 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.695286  hitchhiker  0.000177122 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4718  tRNA-Tyr  83.91 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.22023e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2436  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2438  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2441  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2146  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2148  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2151  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0012  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000828702  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0059  tRNA-Tyr  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234282  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0011  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000000561505  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0059  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111463  hitchhiker  0.000000693164 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0060  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.500822  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0060  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000231954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0057  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.658819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3189  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000533959  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0025  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.578313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4474  tRNA-Tyr  83.91 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000330783  hitchhiker  0.00000000000000918445 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3765  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3827  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400436  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3458  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000255407  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0003  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0021  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000249749  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0004  tRNA-Tyr  83.91 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000458141  normal  0.383106 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4425  tRNA-Tyr  83.91 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000181979  hitchhiker  0.0000468307 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0057  tRNA-Tyr  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0012008 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0044  tRNA-Tyr  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000161525  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0009  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000816684  normal  0.0119926 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4384  tRNA-Tyr  83.91 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000011593  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0012  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000122749  normal  0.1453 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4549  tRNA-Tyr  83.91 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000359327  hitchhiker  0.00000000000121072 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5442  tRNA-Tyr  83.91 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000118281  hitchhiker  0.000431346 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0058  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4663  tRNA-Tyr  83.91 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.25071e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0072  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000172192  normal  0.224883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>