More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1727 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1727  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 454 aa  944    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000518329  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0770  alpha amylase, catalytic region  67.11 
 
 		 455 aa  653    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0568  alpha amylase catalytic region  40.26 
 
 		 441 aa  380  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.489897  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0554  alpha amylase, catalytic region  39.82 
 
 		 441 aa  374  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0002426  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  40.31 
 
 		 515 aa  300  4e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  34.46 
 
 		 499 aa  267  2e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  37.71 
 
 		 493 aa  256  6e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  34.21 
 
 		 654 aa  253  5.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  37.16 
 
 		 815 aa  249  1e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1176  alpha amylase catalytic region  36.6 
 
 		 647 aa  239  9e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  32.86 
 
 		 509 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  34.62 
 
 		 555 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  34.62 
 
 		 555 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  34.72 
 
 		 522 aa  234  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  33.64 
 
 		 541 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  35.85 
 
 		 541 aa  223  8e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  36.44 
 
 		 545 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  35.12 
 
 		 595 aa  220  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  32.91 
 
 		 593 aa  216  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4288  alpha amylase catalytic region  31.66 
 
 		 588 aa  205  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  35.88 
 
 		 583 aa  197  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  29.56 
 
 		 548 aa  196  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  31.72 
 
 		 591 aa  195  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0107  alpha-amylase family protein  29.4 
 
 		 541 aa  192  1e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0384017  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1849  alpha-amylase  31.48 
 
 		 524 aa  191  2e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2593  alpha amylase catalytic region  47.4 
 
 		 258 aa  189  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191559  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  32.99 
 
 		 553 aa  188  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3679  trehalose synthase-like  32.8 
 
 		 574 aa  188  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  29.78 
 
 		 562 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  34.44 
 
 		 532 aa  188  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  31.24 
 
 		 1093 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7974  alpha amylase catalytic region  29.68 
 
 		 547 aa  187  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  28.46 
 
 		 556 aa  186  5e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6073  trehalose synthase  31 
 
 		 604 aa  186  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.887339  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  29.55 
 
 		 1101 aa  186  6e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  32.98 
 
 		 572 aa  186  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  31.02 
 
 		 1093 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  29.47 
 
 		 529 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  29.76 
 
 		 606 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  33.64 
 
 		 575 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  29.55 
 
 		 549 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1595  alpha-D-1,4-glucosidase  28.6 
 
 		 549 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1564  alpha-D-1,4-glucosidase  28.6 
 
 		 549 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  30.74 
 
 		 1085 aa  184  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  33.07 
 
 		 538 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  29.72 
 
 		 601 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  30.09 
 
 		 1137 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  28.63 
 
 		 556 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  30.65 
 
 		 1092 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  33.07 
 
 		 540 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  30.1 
 
 		 567 aa  183  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  30.39 
 
 		 1138 aa  183  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  31 
 
 		 1130 aa  183  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  30.24 
 
 		 1109 aa  182  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  29.72 
 
 		 1136 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  28.41 
 
 		 1100 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  28.94 
 
 		 536 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  29.72 
 
 		 1137 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  30.25 
 
 		 554 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  31.74 
 
 		 551 aa  182  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  29.93 
 
 		 1088 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  29.93 
 
 		 1088 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  30.16 
 
 		 1088 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  32.81 
 
 		 538 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  29.72 
 
 		 1137 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  30.49 
 
 		 540 aa  181  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  29.87 
 
 		 1137 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  29.72 
 
 		 1137 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  28.69 
 
 		 571 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  31.93 
 
 		 542 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  32.24 
 
 		 562 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  27.87 
 
 		 1102 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4573  hypothetical protein  29.84 
 
 		 540 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2287  alpha amylase catalytic region  29.84 
 
 		 540 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  30.7 
 
 		 1061 aa  180  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  30.55 
 
 		 598 aa  180  4.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2088  alpha amylase catalytic region  29.11 
 
 		 541 aa  180  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2311  alpha amylase, catalytic region  27.98 
 
 		 540 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.679266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  31.66 
 
 		 551 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2310  trehalose synthase  30.55 
 
 		 1098 aa  180  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.178439  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2299  alpha amylase catalytic region  29.84 
 
 		 540 aa  179  7e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.823743 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  32.77 
 
 		 558 aa  179  8e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  29.06 
 
 		 1113 aa  179  8e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  29.32 
 
 		 1102 aa  179  9e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2039  alpha amylase catalytic region  29.84 
 
 		 540 aa  179  9e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  29.32 
 
 		 1102 aa  179  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2213  oligo-1,6-glucosidase  26.82 
 
 		 540 aa  179  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  32.51 
 
 		 530 aa  179  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2133  alpha amylase, catalytic region  29.01 
 
 		 540 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2209  alpha amylase, catalytic region  29.01 
 
 		 540 aa  178  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0738  trehalose synthase  32.51 
 
 		 598 aa  178  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1296  trehalose synthase  30.26 
 
 		 583 aa  177  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13842  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  33.24 
 
 		 525 aa  177  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  28.48 
 
 		 1131 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  28.48 
 
 		 1131 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  28.48 
 
 		 1131 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  28.48 
 
 		 1131 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  28.4 
 
 		 539 aa  177  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  28.48 
 
 		 1131 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2086  alpha amylase catalytic region  29.63 
 
 		 540 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>