More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1686 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1686  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 219 aa  432  1e-120  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0415019  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  41.36 
 
 		 219 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  40.09 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  39.35 
 
 		 218 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  33.68 
 
 		 207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  26.39 
 
 		 218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  28.9 
 
 		 221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  26.36 
 
 		 221 aa  98.6  6e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  28.64 
 
 		 221 aa  98.2  9e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 		 221 aa  96.3  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  26.36 
 
 		 218 aa  96.7  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  26.36 
 
 		 221 aa  95.5  6e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  28.99 
 
 		 222 aa  92.8  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  27.1 
 
 		 220 aa  91.3  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  27.4 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1489  hypothetical protein  27.44 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00984888  normal  0.0109156 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  25.49 
 
 		 231 aa  85.5  5e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  26.94 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  26.03 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  26.6 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  24.62 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  26.94 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  29.31 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  26.32 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  26.61 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  26.92 
 
 		 445 aa  81.3  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1920  TrkA domain-containing protein  26.73 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  25.13 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  25.35 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  25.69 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  25.91 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3218  potassium transporter peripheral membrane component  27.11 
 
 		 454 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.715113  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  28.71 
 
 		 445 aa  79.3  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  26.54 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  27.16 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  26.67 
 
 		 465 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  27.68 
 
 		 450 aa  78.6  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  22.87 
 
 		 620 aa  77.8  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  27.32 
 
 		 445 aa  77.8  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  26.07 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  25.88 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  26.27 
 
 		 450 aa  77  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  22.97 
 
 		 443 aa  76.3  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0699  TrkA-N domain protein  24.64 
 
 		 444 aa  75.5  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2085  TrkA-N domain protein  24.64 
 
 		 444 aa  74.7  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  23.91 
 
 		 217 aa  74.7  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0769  TrkA-N domain protein  26.15 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.601936 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1944  TrkA domain-containing protein  24.51 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.772638 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  22.94 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  22.27 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  26.19 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  26.34 
 
 		 459 aa  74.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  24.32 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1685  TrkA domain-containing protein  29.5 
 
 		 153 aa  73.9  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.124287  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  26.72 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  25.79 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1310  potassium transporter peripheral membrane component  25.22 
 
 		 444 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  27.85 
 
 		 612 aa  72.4  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  25.34 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  25.34 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  25.34 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  29.21 
 
 		 449 aa  72  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1454  TrkA-N domain protein  26.48 
 
 		 443 aa  71.6  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  25.86 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  24.55 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  23.18 
 
 		 458 aa  71.2  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0745  TrkA domain-containing protein  22.73 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1928  putative potassium transporter  23.87 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.292607  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  24.27 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0505  TrkA domain-containing protein  26.02 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  25.11 
 
 		 617 aa  69.3  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  23.04 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  24.09 
 
 		 458 aa  68.9  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  24.53 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  25.91 
 
 		 626 aa  68.6  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  23.33 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  25.45 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1209  potassium transporter peripheral membrane component  26.11 
 
 		 448 aa  68.2  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356485  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3430  potassium transporter peripheral membrane component  26.89 
 
 		 448 aa  67.4  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0375932  normal  0.146617 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  22.64 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0161  TrkA domain-containing protein  22.64 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825727 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  24.89 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12707  trk system potassium uptake protein ceoC  24.75 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.44928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  23.64 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  23.81 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5999  potassium transporter peripheral membrane component  26.2 
 
 		 485 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135992 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4544  potassium transporter peripheral membrane component  26.29 
 
 		 492 aa  67  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3673  TrkA-N domain protein  24.88 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728396  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  25.78 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  27.65 
 
 		 448 aa  66.6  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  22.97 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  27.88 
 
 		 457 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1041  TrkA domain-containing protein  22.94 
 
 		 452 aa  65.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0014  TrkA domain-containing protein  26.15 
 
 		 457 aa  65.9  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0240987 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  26.92 
 
 		 457 aa  65.9  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2455  potassium transporter peripheral membrane component  27.7 
 
 		 452 aa  65.1  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341783  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  22.52 
 
 		 253 aa  65.1  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1970  potassium transporter peripheral membrane component  24.89 
 
 		 453 aa  65.1  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.616677  normal  0.0915611 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  22.86 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  24.54 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>