289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1654 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1654  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  310  5.999999999999999e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0185  hypothetical protein  54.9 
 
 
152 aa  176  9e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  42.41 
 
 
159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  39.24 
 
 
159 aa  102  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  37.89 
 
 
156 aa  99  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 
159 aa  98.6  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 
159 aa  98.6  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2788  rRNA large subunit methyltransferase  37.58 
 
 
155 aa  97.8  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  39.38 
 
 
159 aa  98.2  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0083  hypothetical protein  38.31 
 
 
151 aa  97.8  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000837778  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0083  hypothetical protein  38.31 
 
 
151 aa  97.8  5e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0170502  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2087  rRNA large subunit methyltransferase  37.74 
 
 
157 aa  97.4  7e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  36.65 
 
 
159 aa  97.1  8e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  36.25 
 
 
159 aa  96.3  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1420  hypothetical protein  36.54 
 
 
157 aa  96.3  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  39.24 
 
 
157 aa  95.5  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  36.54 
 
 
157 aa  94.4  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  36.48 
 
 
157 aa  94  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 
159 aa  94  7e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  38.51 
 
 
159 aa  92.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  39.38 
 
 
159 aa  92.4  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  38.22 
 
 
152 aa  92.8  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  36.48 
 
 
157 aa  89.7  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1366  hypothetical protein  36.84 
 
 
155 aa  88.2  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  33.75 
 
 
159 aa  87.4  6e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  35.44 
 
 
159 aa  87  7e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2139  hypothetical protein  30.52 
 
 
154 aa  85.9  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.895316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  32.3 
 
 
154 aa  86.3  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  33.33 
 
 
159 aa  85.1  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4518  protein of unknown function DUF163  32.47 
 
 
134 aa  84.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.600852  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  84.7  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  33.94 
 
 
159 aa  84.3  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  32.05 
 
 
153 aa  84.3  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167091  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  34.42 
 
 
145 aa  83.6  9e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  34.16 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  32.48 
 
 
158 aa  83.6  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  31.68 
 
 
154 aa  82  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2126  protein of unknown function DUF163  31.17 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.933959  normal  0.0354668 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  33.12 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  30.63 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  33.74 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  31.06 
 
 
160 aa  80.1  0.000000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0377  rRNA large subunit methyltransferase  27.27 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  31.65 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  32.92 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  31.87 
 
 
160 aa  80.1  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0486  hypothetical protein  32.12 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000178654  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3293  hypothetical protein  33.75 
 
 
160 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  32.69 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0548  hypothetical protein  33.96 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  32.92 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl478  hypothetical protein  32.69 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2599  hypothetical protein  44.58 
 
 
84 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0406  hypothetical protein  29.68 
 
 
155 aa  77  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57756  normal  0.24642 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  34.78 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  34.78 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  34.78 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  34.78 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  34.78 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  31.65 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  31.65 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2393  rRNA large subunit methyltransferase  30.56 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147472  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  34.78 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  34.78 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  34.16 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  34.15 
 
 
177 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  34.16 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1809  hypothetical protein  32.37 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.454132  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1993  rRNA large subunit methyltransferase  29.87 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350093  normal  0.83098 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0845  protein of unknown function DUF163  31.82 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0190186 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  32.52 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3770  protein of unknown function DUF163  33.98 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  34.16 
 
 
167 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  34.16 
 
 
167 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2340  rRNA large subunit methyltransferase  31.54 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000321376  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  31.01 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000017339  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  34.42 
 
 
154 aa  73.9  0.0000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0780  rRNA large subunit methyltransferase  25.48 
 
 
159 aa  73.6  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329962  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1641  hypothetical protein  29.87 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.230899  normal  0.661833 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  29.38 
 
 
153 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1662  hypothetical protein  30.57 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.399666  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1077  protein of unknown function DUF163  31.58 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3630  protein of unknown function DUF163  41.38 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000133759  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2414  hypothetical protein  25.32 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000142803  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1010  rRNA large subunit methyltransferase  28.85 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  30.38 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1447  protein of unknown function DUF163  29.45 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000183222  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2291  hypothetical protein  29.68 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2439  hypothetical protein  28.57 
 
 
173 aa  70.5  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0743  rRNA large subunit methyltransferase  27.45 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000786877  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0797  rRNA large subunit methyltransferase  28.21 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1379  rRNA large subunit methyltransferase  28.21 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.588338  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0697  rRNA large subunit methyltransferase  27.45 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00566103  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  27.22 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0683  rRNA large subunit methyltransferase  27.45 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000302367  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  28.39 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0757  rRNA large subunit methyltransferase  27.45 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00922876  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2299  rRNA large subunit methyltransferase  27.15 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1226  rRNA large subunit methyltransferase  28.21 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>