More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1558 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1558  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
467 aa  960  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  3.40299e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0408  glycoside hydrolase family protein  44.38 
 
 
489 aa  417  1e-115  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0125143  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0652  glycoside hydrolase family protein  44.01 
 
 
486 aa  409  1e-113  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  7.39457e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1110  glycoside hydrolase family protein  40.32 
 
 
517 aa  372  1e-102  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1675  glycoside hydrolase family protein  41.02 
 
 
513 aa  368  1e-100  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.256832  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5030  glycoside hydrolase family protein  34.27 
 
 
885 aa  244  2e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.277971  normal  0.200228 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1722  glycoside hydrolase family protein  33.4 
 
 
934 aa  241  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.594892  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0462  Beta-glucosidase  30.08 
 
 
418 aa  204  4e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.626526  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1932  glycoside hydrolase family protein  29.19 
 
 
431 aa  199  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  hitchhiker  9.05056e-06 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2967  glycoside hydrolase family protein  29.19 
 
 
431 aa  193  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04820  Beta-glucosidase  30.21 
 
 
432 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0266886  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6082  glycoside hydrolase family 1  28.72 
 
 
436 aa  188  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  26.28 
 
 
450 aa  186  5e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  27.88 
 
 
446 aa  181  3e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  28.06 
 
 
447 aa  181  3e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  28.06 
 
 
446 aa  179  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  1.88458e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0529  glycoside hydrolase family 1  29.31 
 
 
417 aa  179  1e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  28.88 
 
 
439 aa  177  3e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4014  glycoside hydrolase family protein  28.9 
 
 
443 aa  176  8e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.92245  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1428  glycoside hydrolase family protein  27.78 
 
 
442 aa  176  8e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.574986  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  27.1 
 
 
438 aa  168  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  1.11423e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  26.11 
 
 
482 aa  168  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  26.89 
 
 
451 aa  166  6e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.25524e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  26.04 
 
 
478 aa  166  7e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  26.25 
 
 
439 aa  165  1e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  27.1 
 
 
453 aa  165  1e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  26.1 
 
 
446 aa  164  2e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  3.26763e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  25.9 
 
 
446 aa  163  5e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  26.68 
 
 
449 aa  163  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03797  beta-glucosidase  27.85 
 
 
452 aa  163  7e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  26.52 
 
 
443 aa  159  8e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  26.79 
 
 
452 aa  159  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  27.82 
 
 
457 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  26.68 
 
 
443 aa  159  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  27.41 
 
 
457 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  25.66 
 
 
444 aa  158  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  25.3 
 
 
476 aa  158  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  26.99 
 
 
451 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  26.18 
 
 
444 aa  157  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  5.31793e-05  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  26.48 
 
 
440 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  26.19 
 
 
452 aa  157  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  24.75 
 
 
470 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  25.7 
 
 
472 aa  156  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  25.96 
 
 
440 aa  156  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  26.79 
 
 
451 aa  156  9e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  26.79 
 
 
451 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  25.87 
 
 
440 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0502  6-phospho-beta-galactosidase  25.78 
 
 
475 aa  155  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  26.92 
 
 
443 aa  155  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1937  glycoside hydrolase family protein  26.14 
 
 
427 aa  154  3e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.607025  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  24.8 
 
 
478 aa  154  3e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  26.88 
 
 
451 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3309  Beta-glucosidase  25.71 
 
 
444 aa  154  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.581632  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1944  Beta-glucosidase  26.3 
 
 
433 aa  152  9e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.781532  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  27.2 
 
 
458 aa  152  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  1.80548e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 
478 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  24.54 
 
 
443 aa  150  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  28.69 
 
 
446 aa  150  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  24.95 
 
 
459 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  24.85 
 
 
474 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  24.04 
 
 
463 aa  149  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  24.15 
 
 
470 aa  149  1e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  26.47 
 
 
452 aa  148  2e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  7.53308e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  24.46 
 
 
485 aa  148  2e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  24.9 
 
 
453 aa  148  2e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  25.45 
 
 
463 aa  148  2e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  23.93 
 
 
448 aa  147  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  25.71 
 
 
456 aa  147  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  26.3 
 
 
447 aa  146  9e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0153  Beta-glucosidase  26.85 
 
 
457 aa  145  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1537  glycoside hydrolase family protein  27.19 
 
 
399 aa  145  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37521  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  24.28 
 
 
491 aa  145  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  24.6 
 
 
472 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1882  glycosy hydrolase family protein  24.06 
 
 
427 aa  144  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.31737  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  25.71 
 
 
436 aa  144  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  23.93 
 
 
437 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  26.46 
 
 
471 aa  144  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  23.76 
 
 
479 aa  143  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  23.35 
 
 
448 aa  143  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  24.19 
 
 
488 aa  143  8e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  24.69 
 
 
465 aa  143  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0808  beta-galactosidase  25.87 
 
 
466 aa  142  1e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1146  Beta-glucosidase  25.31 
 
 
440 aa  141  2e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1838  beta-galactosidase  26.73 
 
 
451 aa  142  2e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  24.54 
 
 
458 aa  141  2e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4660  glycoside hydrolase family protein  25.73 
 
 
413 aa  141  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  23.75 
 
 
472 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  24.56 
 
 
494 aa  141  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  25.47 
 
 
474 aa  140  4e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  2.77167e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  25.21 
 
 
470 aa  140  4e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  23.12 
 
 
487 aa  139  9e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  26.67 
 
 
447 aa  139  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3603  TonB-like  24.5 
 
 
461 aa  139  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.70293  hitchhiker  0.00573623 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0789  glycoside hydrolase family protein  25.93 
 
 
443 aa  139  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0245888  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1654  beta-glucosidase A  25.05 
 
 
435 aa  139  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.484784  hitchhiker  3.45699e-05 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0344  6-phospho-beta-galactosidase  25.74 
 
 
484 aa  138  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  2.15907e-05  hitchhiker  0.000984044 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4320  beta-galactosidase  23.61 
 
 
460 aa  139  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  27.59 
 
 
468 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  25.31 
 
 
462 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  25.73 
 
 
453 aa  138  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>