More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1520 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 324 aa  632  1e-180  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  38.63 
 
 		 339 aa  216  5e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  34.8 
 
 		 332 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  33.86 
 
 		 332 aa  211  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  35.47 
 
 		 346 aa  179  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  30.31 
 
 		 330 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  30.21 
 
 		 350 aa  160  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  29.47 
 
 		 330 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  32.12 
 
 		 355 aa  157  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  29.47 
 
 		 334 aa  155  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  29.15 
 
 		 330 aa  155  9e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  29.15 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  28.53 
 
 		 350 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  29.47 
 
 		 330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  27.95 
 
 		 347 aa  152  7e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  28.53 
 
 		 330 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  26.1 
 
 		 350 aa  149  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  29.78 
 
 		 325 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  28.83 
 
 		 337 aa  149  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  27.36 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  27.33 
 
 		 346 aa  146  5e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  26.99 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  26.98 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  29.63 
 
 		 331 aa  143  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  30.86 
 
 		 335 aa  143  4e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  28.16 
 
 		 351 aa  143  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  27.08 
 
 		 346 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  26.77 
 
 		 333 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  25.69 
 
 		 350 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  25.69 
 
 		 350 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  28.88 
 
 		 335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  27.04 
 
 		 355 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  29.48 
 
 		 335 aa  136  5e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  29.23 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  25.93 
 
 		 354 aa  135  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  26.32 
 
 		 384 aa  134  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  26.25 
 
 		 371 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  27.22 
 
 		 356 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  26.84 
 
 		 357 aa  132  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  26.58 
 
 		 356 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  25.08 
 
 		 332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  25.79 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  27.02 
 
 		 341 aa  129  9.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  26.3 
 
 		 336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  29.64 
 
 		 368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  26.18 
 
 		 341 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  25 
 
 		 362 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  28.53 
 
 		 335 aa  126  6e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  25.49 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  25.39 
 
 		 352 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  25 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  23.44 
 
 		 351 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  23.44 
 
 		 351 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  23.44 
 
 		 351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  30.51 
 
 		 347 aa  109  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  30.66 
 
 		 345 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  28.67 
 
 		 346 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1601  hypothetical protein  26.51 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  23.78 
 
 		 351 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  24.62 
 
 		 359 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  27.96 
 
 		 346 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  23.77 
 
 		 352 aa  102  6e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  26.47 
 
 		 395 aa  100  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  25.16 
 
 		 352 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  25.26 
 
 		 346 aa  98.6  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  21.99 
 
 		 509 aa  94.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  23.85 
 
 		 351 aa  93.2  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0771  hypothetical protein  23.17 
 
 		 376 aa  92  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.94547  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  25.51 
 
 		 388 aa  90.9  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  26.16 
 
 		 393 aa  90.9  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5246  potassium channel protein, N-terminus  34.15 
 
 		 146 aa  90.1  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0630714  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1030  conserved hypothetical protein (TrkA domain protein)  22.63 
 
 		 375 aa  89.4  7e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.583921  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  23.24 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  30.84 
 
 		 341 aa  87  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  26.94 
 
 		 395 aa  87.4  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13223  transmembrane cation transporter  27.49 
 
 		 355 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  24.03 
 
 		 366 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0242  TrkA domain-containing protein  32.07 
 
 		 668 aa  83.2  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  24.3 
 
 		 531 aa  82.8  0.000000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  23.77 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  22.06 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1968  TrkA-N domain protein  22.61 
 
 		 544 aa  80.1  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0623944 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0283  TrkA domain-containing protein  36.49 
 
 		 639 aa  80.1  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244298  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  22.55 
 
 		 335 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  22.7 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  24.51 
 
 		 542 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  29.63 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  29.63 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  29.63 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  29.63 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  29.63 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  29.63 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0139159 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  29.63 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0391  voltage-gated potassium channel  30.95 
 
 		 416 aa  77.8  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131379  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  29.63 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0055  TrkA-N domain protein  26.46 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  29.1 
 
 		 417 aa  75.5  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3336  TrkA domain-containing protein  38.69 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.819763  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  21.83 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0419  TrkA-N domain protein  22.74 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>