139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1459 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1459  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  497  1e-140  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000468004  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1830  hypothetical protein  61.02 
 
 
238 aa  210  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00424727  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1787  hypothetical protein  60.45 
 
 
238 aa  207  1e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000129243  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0291  hypothetical protein  51.14 
 
 
265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1186  hypothetical protein  45.45 
 
 
258 aa  156  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0460603  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0875  protein of unknown function DUF477  42.13 
 
 
264 aa  148  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000594367  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0034  protein of unknown function DUF477  35.59 
 
 
286 aa  138  7e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2913  hypothetical protein  36.98 
 
 
297 aa  123  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00131763  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3604  protein of unknown function DUF477  41.98 
 
 
259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0639  hypothetical protein  46.76 
 
 
343 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06980  hypothetical protein  47.45 
 
 
341 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1903  putative glycine rich membrane protein  32.5 
 
 
285 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1517  hypothetical protein  41.22 
 
 
263 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413483  normal  0.437621 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1478  hypothetical protein  38.27 
 
 
299 aa  108  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507898  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2277  hypothetical protein  38.69 
 
 
235 aa  108  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000559255  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2118  hypothetical protein  39.86 
 
 
336 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2019  hypothetical protein  49.18 
 
 
261 aa  105  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2296  protein of unknown function DUF477  49.18 
 
 
261 aa  105  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00760531 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1419  protein of unknown function DUF477  39.44 
 
 
315 aa  105  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2422  protein of unknown function DUF477  37.95 
 
 
287 aa  105  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1401  protein of unknown function DUF477  41.35 
 
 
264 aa  105  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3392  hypothetical protein  36.55 
 
 
277 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.261896  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3876  glycine rich protein  43.8 
 
 
440 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5849  protein of unknown function DUF477  39.86 
 
 
282 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.522543 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2527  hypothetical protein  39.61 
 
 
256 aa  103  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00024916  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3702  hypothetical protein  36.17 
 
 
266 aa  103  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83448  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2026  protein of unknown function DUF477  37.66 
 
 
260 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.903181 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6688  hypothetical protein  38.36 
 
 
295 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0102145  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1981  protein of unknown function DUF477  47.54 
 
 
262 aa  103  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45700  hypothetical protein  42.98 
 
 
453 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1773  hypothetical protein  36.89 
 
 
256 aa  102  8e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.61154  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47040  hypothetical protein  40 
 
 
237 aa  102  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0812  hypothetical protein  35.67 
 
 
260 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1795  protein of unknown function DUF477  36.75 
 
 
288 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.039663 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1259  protein of unknown function DUF477  39.52 
 
 
315 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.642039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3401  hypothetical protein  38.26 
 
 
288 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4545  hypothetical protein  34.9 
 
 
286 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127077  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2693  hypothetical protein  33.53 
 
 
301 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3877  hypothetical protein  46.09 
 
 
422 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0956  hypothetical protein  31.22 
 
 
264 aa  99.8  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0897  hypothetical protein  32.72 
 
 
284 aa  99.8  4e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.803851  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0011  hypothetical protein  36.43 
 
 
266 aa  99.8  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496053  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1372  hypothetical protein  37.74 
 
 
290 aa  99.4  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740234  hitchhiker  0.000166638 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3955  hypothetical protein  37.01 
 
 
302 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2033  hypothetical protein  38.97 
 
 
285 aa  99  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04652  glycine rich protein  41.79 
 
 
288 aa  99  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00734388  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1228  protein of unknown function DUF477  36.24 
 
 
315 aa  98.6  8e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1823  protein of unknown function DUF477  34.55 
 
 
250 aa  98.6  8e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0387884  normal  0.867329 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1189  hypothetical protein  40 
 
 
281 aa  98.6  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0659  protein of unknown function DUF477  37.23 
 
 
295 aa  98.6  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6199  hypothetical protein  32.16 
 
 
283 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0664  hypothetical protein  29.72 
 
 
274 aa  98.2  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45710  hypothetical protein  43.48 
 
 
419 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0509  putative lipoprotein  33.78 
 
 
282 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1299  hypothetical protein  38.06 
 
 
250 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0218065  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1762  protein of unknown function DUF477  43.22 
 
 
307 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.485399  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1288  hypothetical protein  37.4 
 
 
423 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103511  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0285  putative lipoprotein  32.08 
 
 
284 aa  97.1  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562494  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0416  hypothetical protein  38.52 
 
 
287 aa  97.8  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2160  hypothetical protein  34.09 
 
 
284 aa  97.4  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0998  protein of unknown function DUF477  32.42 
 
 
276 aa  97.4  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3371  putative lipoprotein  34 
 
 
282 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4334  protein of unknown function DUF477  34.55 
 
 
260 aa  97.1  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.82734 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3041  putative lipoprotein  34 
 
 
282 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2051  putative lipoprotein  34 
 
 
282 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0314  putative lipoprotein  37.3 
 
 
282 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2233  putative lipoprotein  34 
 
 
282 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2047  hypothetical protein  34.59 
 
 
283 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.976247  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0327  putative lipoprotein  34 
 
 
282 aa  95.9  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3713  hypothetical protein  43.22 
 
 
301 aa  95.9  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0394  hypothetical protein  35.57 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.729327  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2021  hypothetical protein  39.85 
 
 
229 aa  94.7  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000021885  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1230  protein of unknown function DUF477  34 
 
 
294 aa  94.7  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0298184 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2915  hypothetical protein  32.85 
 
 
294 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0386021  normal  0.901055 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1510  hypothetical protein  39.37 
 
 
292 aa  94  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.402719  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4038  hypothetical protein  33.53 
 
 
301 aa  94  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000052611  normal  0.949055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0424  hypothetical protein  34.81 
 
 
290 aa  94.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0414  protein of unknown function DUF477  35.85 
 
 
246 aa  94  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2363  protein of unknown function DUF477  33.33 
 
 
246 aa  93.6  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.116241  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0410  hypothetical protein  35.71 
 
 
386 aa  92.4  6e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00804923 
 
 
-
 
NC_004310  BR1821  hypothetical protein  41.53 
 
 
267 aa  91.3  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1334  hypothetical protein  37.41 
 
 
290 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1753  hypothetical protein  41.53 
 
 
266 aa  91.3  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3875  hypothetical protein  35.71 
 
 
270 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.063736 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2627  hypothetical protein  27.78 
 
 
288 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0454  hypothetical protein  38.15 
 
 
389 aa  90.5  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3227  hypothetical protein  37.5 
 
 
277 aa  90.5  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1720  hypothetical protein  34.03 
 
 
320 aa  89.7  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5308  protein of unknown function DUF477  30.29 
 
 
293 aa  89.7  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.16736  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1696  protein of unknown function DUF477  30.29 
 
 
286 aa  89.7  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.973781  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0606  protein of unknown function DUF477  27.54 
 
 
287 aa  89  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1255  protein of unknown function DUF477  33.79 
 
 
302 aa  89  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0178341  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3082  hypothetical protein  31.65 
 
 
290 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000317552  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02623  hypothetical protein  32.28 
 
 
290 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000105105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0910  protein of unknown function DUF477  32.28 
 
 
290 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203504  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02585  hypothetical protein  32.28 
 
 
290 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000156395  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2920  hypothetical protein  32.28 
 
 
242 aa  87  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.83358e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1821  protein of unknown function DUF477  38.46 
 
 
271 aa  86.3  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.367248  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1082  hypothetical protein  39.83 
 
 
299 aa  86.3  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0934  hypothetical protein  31.01 
 
 
290 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000566742  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>