More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1427 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_005945  BAS2542  pullulanase  41.06 
 
 		 852 aa  637    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  41.18 
 
 		 852 aa  641    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  41.06 
 
 		 850 aa  638    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0978  pullulanase, type I  68.97 
 
 		 843 aa  1186    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.912818  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0061  pullulanase, type I  51.89 
 
 		 899 aa  825    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0459  pullulanase, type I  67.7 
 
 		 842 aa  1215    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.712908  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  41.06 
 
 		 852 aa  637    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0959  pullulanase, type I  68.61 
 
 		 843 aa  1180    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.557051  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1427  pullulanase, type I  100 
 
 		 841 aa  1726    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.671793  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  41.18 
 
 		 848 aa  633  1e-180  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  41.18 
 
 		 852 aa  633  1e-180  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2416  pullulanase, type I  41.48 
 
 		 856 aa  622  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00697767  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2761  pullulanase, putative  40.6 
 
 		 848 aa  615  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00586404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2552  putative pullulanase  40.83 
 
 		 852 aa  609  1e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000407246  decreased coverage  0.0000000000706623 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  40.83 
 
 		 852 aa  610  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  38.49 
 
 		 2638 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13880  pullulanase, type I  45.71 
 
 		 640 aa  529  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2304  pullulanase, type I  38.47 
 
 		 1043 aa  520  1e-146  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0609  pullulanase, type I  42.88 
 
 		 1136 aa  498  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2331  pullulanase, type I  42.15 
 
 		 647 aa  491  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1803  pullulanase, type I  41.07 
 
 		 655 aa  487  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1522  pullulanase precursor  41.32 
 
 		 655 aa  482  1e-134  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0360874  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19550  pullulanase, type I  34.4 
 
 		 874 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  40.64 
 
 		 713 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  40.64 
 
 		 713 aa  458  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  40.64 
 
 		 713 aa  456  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  40.64 
 
 		 713 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  40.64 
 
 		 713 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  40.4 
 
 		 713 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  40.55 
 
 		 713 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  40.33 
 
 		 713 aa  451  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4814  putative pullulanase  40.09 
 
 		 713 aa  451  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0681  pullulanase, type I  39.69 
 
 		 718 aa  450  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  35.59 
 
 		 1064 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1839  putative pullulanase  35.25 
 
 		 1064 aa  439  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  39.79 
 
 		 713 aa  435  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  37.6 
 
 		 712 aa  426  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  33.73 
 
 		 1888 aa  413  1e-114  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0448  pullulanase, type I  40.26 
 
 		 825 aa  415  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0057  pullulanase, type I  34.12 
 
 		 928 aa  409  1.0000000000000001e-112  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0872  pullulanase, type I  39.79 
 
 		 640 aa  396  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  32.85 
 
 		 601 aa  352  2e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.85 
 
 		 1117 aa  338  1.9999999999999998e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1298  pullulanase, type I  33.86 
 
 		 669 aa  327  7e-88  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0852  pullulanase, putative  33.28 
 
 		 766 aa  304  4.0000000000000003e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.865256  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2329  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  26.63 
 
 		 991 aa  286  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0783894  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2488  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.81 
 
 		 1176 aa  277  5e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.331345 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.41 
 
 		 2156 aa  266  1e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0096  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.18 
 
 		 891 aa  264  4.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380747  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1694  putative pullulanase  29.05 
 
 		 1429 aa  254  6e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  26.44 
 
 		 1942 aa  253  7e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39745  predicted protein  27.3 
 
 		 1062 aa  251  3e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0560  putative pullulanase precursor  27.52 
 
 		 1432 aa  243  7e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.594398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3767  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  28.59 
 
 		 1025 aa  243  7e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0868  pullulanase, extracellular  27.63 
 
 		 776 aa  242  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.97 
 
 		 1855 aa  236  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1216  pullulanase, putative  24.86 
 
 		 1252 aa  236  2.0000000000000002e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0305928  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1941  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  29.27 
 
 		 1450 aa  231  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001089  putative pullulanase precursor  29.3 
 
 		 1329 aa  231  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01882  putative pullulanase  30.34 
 
 		 1472 aa  231  4e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3074  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.85 
 
 		 1440 aa  231  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000101349 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1316  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.85 
 
 		 1440 aa  231  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0748066 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04828  pullulanase  28.82 
 
 		 1328 aa  227  6e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.77 
 
 		 1331 aa  227  7e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4105  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  24.46 
 
 		 1035 aa  224  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3061  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.25 
 
 		 946 aa  224  4.9999999999999996e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0996  alpha amylase family protein  26.11 
 
 		 998 aa  224  6e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.7 
 
 		 1891 aa  213  9e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.92 
 
 		 1975 aa  201  5e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06650  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.11 
 
 		 1248 aa  199  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.16 
 
 		 2068 aa  197  7e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0287  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  30.84 
 
 		 1441 aa  195  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5150  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.84 
 
 		 1124 aa  192  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910447  normal  0.74946 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  28.33 
 
 		 706 aa  187  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  28 
 
 		 708 aa  182  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  30.52 
 
 		 718 aa  182  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  27.43 
 
 		 693 aa  181  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2956  glycogen debranching enzyme GlgX  26.35 
 
 		 697 aa  177  7e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.490165 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0296  glycogen debranching enzyme GlgX  24.85 
 
 		 724 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76134  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  28.03 
 
 		 729 aa  177  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0312  glycosyl hydrolase family protein  30.65 
 
 		 666 aa  172  2e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0426975  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  27.33 
 
 		 711 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  26.46 
 
 		 712 aa  172  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  29.14 
 
 		 774 aa  171  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  25.46 
 
 		 706 aa  171  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  27.33 
 
 		 711 aa  171  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  27.99 
 
 		 721 aa  171  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  25.98 
 
 		 694 aa  170  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4442  glycogen debranching enzyme GlgX  28.21 
 
 		 723 aa  169  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1247  glycoside hydrolase family 13 protein  27.74 
 
 		 703 aa  169  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3520  alpha amylase catalytic region  25.22 
 
 		 671 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  27.92 
 
 		 696 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0815  glycogen debranching protein GlgX  26.74 
 
 		 721 aa  166  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104975 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  24.37 
 
 		 720 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  29.3 
 
 		 706 aa  166  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3828  glycoside hydrolase family 13 protein  28.41 
 
 		 817 aa  166  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535052 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0759  glycogen debranching enzyme GlgX  25.79 
 
 		 708 aa  165  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2859  glycogen debranching enzyme GlgX  27.23 
 
 		 690 aa  165  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0827  glycogen debranching enzyme GlgX  27.26 
 
 		 705 aa  164  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125239  normal  0.0549007 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  25.57 
 
 		 707 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>