More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1407 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  100 
 
 		 196 aa  404  1.0000000000000001e-112  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  43.59 
 
 		 192 aa  171  9e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  44.97 
 
 		 195 aa  167  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  41.97 
 
 		 192 aa  160  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  41.45 
 
 		 202 aa  153  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  41.24 
 
 		 222 aa  151  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  37.89 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  42.56 
 
 		 1287 aa  149  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  33.68 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  33.68 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1089  hypothetical protein  36.22 
 
 		 193 aa  128  6e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1131  hypothetical protein  35.71 
 
 		 193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 		 195 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 		 195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  32.84 
 
 		 208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  34.2 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  41.56 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  34.92 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  34.69 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  41.29 
 
 		 199 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  34.21 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  39.22 
 
 		 200 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  31.79 
 
 		 213 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  36.2 
 
 		 199 aa  107  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  29.1 
 
 		 200 aa  101  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  31.28 
 
 		 207 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  30.77 
 
 		 218 aa  97.8  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  30.77 
 
 		 207 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  30.81 
 
 		 211 aa  95.5  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  30.26 
 
 		 208 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  29.59 
 
 		 209 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0183  methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 199 aa  91.3  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0947468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  29.84 
 
 		 222 aa  90.5  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 208 aa  89.4  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  29.08 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  28.43 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  31.01 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 364 aa  86.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  30 
 
 		 575 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0572  methyltransferase type 11  29.7 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0503  methyltransferase type 11  26.38 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2337  methyltransferase type 12  27.96 
 
 		 440 aa  79.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  33.08 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  32.58 
 
 		 250 aa  71.2  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0687  Methyltransferase type 12  26.52 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.557107 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2925  methyltransferase type 11  26.54 
 
 		 585 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0361  Methyltransferase type 12  25.5 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.83 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  30.33 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00128  Methyltransferase type 11  26.14 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000851543  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1113  methyltransferase type 11  24.86 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  27.39 
 
 		 551 aa  64.3  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1909  methyltransferase type 11  28.08 
 
 		 560 aa  63.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  26.06 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  27.65 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1512  methyltransferase type 11  35.9 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.358179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  26.76 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0899  methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0872  methyltransferase type 12  28.97 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140268  normal  0.160573 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  25.75 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  35.19 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0609  Methyltransferase type 12  31.54 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.763515  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  27.85 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  36.52 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  26.06 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  25.61 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  34.55 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  27.53 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5435  Methyltransferase type 12  29.13 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0879885  hitchhiker  0.0072084 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  25 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1627  methyltransferase type 12  29.93 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00198  methyltransferase  29.2 
 
 		 280 aa  54.7  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.524751  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.97 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2887  SAM-binding motif-containing protein  27.94 
 
 		 237 aa  53.9  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.015318 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  26.06 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004080  hypothetical protein  28.83 
 
 		 522 aa  54.3  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.21 
 
 		 259 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.09 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 209 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1725  tellurite resistance protein TehB  27.72 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1722  tellurite resistance protein TehB  27.72 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1786  tellurite resistance protein TehB  27.72 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1734  tellurite resistance protein TehB  27.72 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2535  Methyltransferase type 11  34.74 
 
 		 225 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01393  hypothetical protein  27.97 
 
 		 535 aa  52.8  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 252 aa  52.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  34.02 
 
 		 251 aa  52.8  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  24.28 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5472  hypothetical protein  28.47 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  24.7 
 
 		 217 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  35.04 
 
 		 277 aa  52.8  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1975  tellurite resistance protein TehB  28.87 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.940413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2004  methyltransferase type 11  25.15 
 
 		 236 aa  52.4  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.388226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  31.08 
 
 		 235 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>