63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1372 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1372  putative ATP binding protein  100 
 
 
213 aa  432  1e-120  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0716  putative ATP binding protein  57.01 
 
 
210 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1771  putative ATP binding protein  48.39 
 
 
219 aa  181  1e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00331125 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0139  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  45.83 
 
 
196 aa  152  4e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1118  hypothetical protein  38.86 
 
 
217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.391916  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1299  hypothetical protein  38.86 
 
 
217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118621  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3339  hypothetical protein  36.98 
 
 
223 aa  128  8.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.90487  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0726  hypothetical protein  38.25 
 
 
227 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0713  hypothetical protein  39.35 
 
 
232 aa  125  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2929  putative ATP binding protein  37 
 
 
274 aa  121  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177336  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0238  hypothetical protein  38.81 
 
 
250 aa  121  8e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.864712  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_80  PP-loop ATPase  37.31 
 
 
250 aa  118  6e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0285  putative ATP binding protein  34.74 
 
 
242 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5795  ATP binding protein  38 
 
 
244 aa  115  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0894168 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1335  PP-loop ATPase  34.74 
 
 
242 aa  115  6e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_95  PP-loop ATPase  34.74 
 
 
242 aa  115  6e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0019  ATP binding protein  35.94 
 
 
223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1360  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  34.4 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1853  ATP binding protein  33.66 
 
 
222 aa  105  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1100  hypothetical protein  33.5 
 
 
217 aa  102  5e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1384  PP-loop ATPase  33.33 
 
 
245 aa  95.9  4e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0105  putative ATP binding protein  30.43 
 
 
288 aa  95.1  8e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0110  putative ATP binding protein  30.09 
 
 
248 aa  94.4  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1767  ATPase  32.99 
 
 
244 aa  94  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0219688  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11968  hypothetical protein  32.85 
 
 
240 aa  90.9  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2428  ATPase  29.68 
 
 
222 aa  87  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0064  hypothetical protein  29.28 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.677678  normal  0.181447 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4520  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  29.82 
 
 
224 aa  81.3  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.397498  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0072  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  27.19 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1634  putative ATP binding protein  30.73 
 
 
226 aa  75.5  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3648  protein of unknown function DUF71, ATPase  27.45 
 
 
226 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.224253  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1093  ATP binding protein  32.14 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000290259  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1107  putative ATP binding protein  32.32 
 
 
229 aa  72  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0530  putative ATP binding protein  31.86 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1584  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  32 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1352  putative ATP binding protein  29.36 
 
 
238 aa  67  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.426698  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0933  tryptophan synthase  32.32 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.93899  normal  0.081197 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2825  ATP binding protein  27.7 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0951589  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2709  ATP binding protein  28.5 
 
 
242 aa  64.3  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0466  hypothetical protein  26 
 
 
231 aa  64.3  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.460863  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1353  putative ATP binding protein  28.28 
 
 
222 aa  62  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1253  putative ATP binding protein  27.27 
 
 
224 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0992  putative ATP binding protein  28.79 
 
 
226 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.100611 
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  26.32 
 
 
572 aa  59.7  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2904  hypothetical protein  29.15 
 
 
223 aa  58.5  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.449464  hitchhiker  0.000871155 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1086  ATP binding protein  27.01 
 
 
218 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00130947  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0609  ATP binding protein  29.65 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1344  putative ATP binding protein  29.65 
 
 
223 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.324314  normal  0.0449354 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1331  putative ATP binding protein  29.65 
 
 
223 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2025  putative ATP binding protein  28.64 
 
 
222 aa  55.8  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.307354  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1530  putative ATP binding protein  26.19 
 
 
234 aa  54.7  0.0000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1736  ATP binding protein  30.59 
 
 
222 aa  53.9  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2610  ATP binding protein  29.49 
 
 
245 aa  52.4  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0801  ATP binding protein  27.98 
 
 
238 aa  51.2  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.789554  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2885  hypothetical protein  25.25 
 
 
223 aa  48.1  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118092  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43636  predicted protein  31.3 
 
 
652 aa  47  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1875  putative ATP binding protein  26.53 
 
 
258 aa  46.2  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1353  ATP binding protein  27.31 
 
 
241 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6853  predicted protein  32.98 
 
 
215 aa  45.8  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.077341  normal  0.470395 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1245  ATP binding protein  26.11 
 
 
235 aa  44.3  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_35058  predicted protein  26.2 
 
 
672 aa  44.3  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1010  putative ATP binding protein  22.06 
 
 
244 aa  42.7  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02960  cytoplasm protein, putative  27.27 
 
 
669 aa  42.4  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0491922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>