205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1356 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  100 
 
 		 1121 aa  2285    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1440  RAP domain protein  35.51 
 
 		 1081 aa  627  1e-178  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.112962  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  31.91 
 
 		 905 aa  178  6e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  30.63 
 
 		 907 aa  176  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  32.11 
 
 		 905 aa  174  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  31.32 
 
 		 905 aa  174  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  30.14 
 
 		 908 aa  171  8e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  31.23 
 
 		 905 aa  170  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  31.23 
 
 		 905 aa  170  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  30 
 
 		 900 aa  169  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  28.45 
 
 		 903 aa  162  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  30.61 
 
 		 906 aa  159  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1974  DNA helicase, putative  30.72 
 
 		 1649 aa  139  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.915196 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0834  hypothetical protein  27.7 
 
 		 1474 aa  126  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.551019  hitchhiker  0.0000399315 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3166  hypothetical protein  27.58 
 
 		 1652 aa  124  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  23.67 
 
 		 946 aa  122  4.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0591  DNA helicase, putative  27.88 
 
 		 1629 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1574  superfamily I DNA/RNA helicase  27 
 
 		 1575 aa  117  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173807  normal  0.305759 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0577  superfamily I DNA and RNA helicase subunits-like protein  26.84 
 
 		 1630 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44767  predicted protein  29.62 
 
 		 1557 aa  116  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3050  superfamily I DNA/RNA helicase  25.56 
 
 		 1790 aa  116  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.266706 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.01 
 
 		 1196 aa  111  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2521  DNA helicase, putative  26.33 
 
 		 1697 aa  110  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1551  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  25.05 
 
 		 1403 aa  108  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0920  superfamily I DNA/RNA helicase  24.8 
 
 		 1622 aa  107  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  23.29 
 
 		 932 aa  106  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  27.11 
 
 		 1489 aa  104  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2528  hypothetical protein  25 
 
 		 2098 aa  104  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1455  hypothetical protein  23.5 
 
 		 758 aa  103  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28895  hypothetical protein  25 
 
 		 2098 aa  102  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.8357  hitchhiker  0.0000000156251 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  28.19 
 
 		 1363 aa  102  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2845  DNA helicase, putative  23.25 
 
 		 1523 aa  101  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.914274 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  26.1 
 
 		 1959 aa  101  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1991  superfamily I DNA/RNA helicase  24.33 
 
 		 1387 aa  100  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  26.83 
 
 		 1490 aa  100  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  24.12 
 
 		 1973 aa  100  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2421  hypothetical protein  24.27 
 
 		 1724 aa  98.6  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220469  normal  0.974769 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3040  DNA helicase related protein  26.05 
 
 		 2222 aa  97.8  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  25.46 
 
 		 1983 aa  97.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  27.1 
 
 		 1980 aa  96.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4582  superfamily I DNA helicase  28.04 
 
 		 1328 aa  95.5  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0432  viral phosphatase  23.85 
 
 		 1285 aa  95.5  5e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  24.29 
 
 		 928 aa  94.4  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  25.1 
 
 		 1986 aa  94.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  28.89 
 
 		 1296 aa  93.6  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  26.33 
 
 		 1991 aa  93.6  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.455109 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3784  DNA helicase related protein  24.75 
 
 		 2197 aa  92.8  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  24.55 
 
 		 2204 aa  92  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5700  serine/threonine protein kinase  24.65 
 
 		 2104 aa  91.7  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.919762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  24.9 
 
 		 1622 aa  90.9  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  25.89 
 
 		 2198 aa  89.4  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0861  putative DNA helicase  24.03 
 
 		 1958 aa  89.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  29.93 
 
 		 916 aa  88.6  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3745  superfamily I DNA/RNA helicase  25.75 
 
 		 1694 aa  87.8  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  23.58 
 
 		 1950 aa  87.8  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  23.27 
 
 		 1958 aa  87.4  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1416  serine/threonine protein kinase  23.45 
 
 		 2101 aa  85.9  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284923  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7073  serine/threonine protein kinase  23.84 
 
 		 2098 aa  85.9  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.305625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6413  serine/threonine protein kinase  23.45 
 
 		 2101 aa  85.9  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266578  normal  0.65163 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  23.09 
 
 		 1822 aa  85.1  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  24.39 
 
 		 2016 aa  85.5  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0240  putative DNA helicase  23.07 
 
 		 1754 aa  84.7  0.000000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0774  ATP-binding protein  23.21 
 
 		 904 aa  84.3  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00601607  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  24.43 
 
 		 1803 aa  83.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1108  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  23.9 
 
 		 1867 aa  84  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  27.04 
 
 		 2125 aa  82  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  27.04 
 
 		 2125 aa  82  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6903  putative DNA helicase related protein  23.82 
 
 		 1593 aa  82  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130907  normal  0.263192 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  23.9 
 
 		 2207 aa  82  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  24.74 
 
 		 1888 aa  80.9  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.32 
 
 		 1203 aa  80.1  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  28.04 
 
 		 922 aa  80.5  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  31.65 
 
 		 925 aa  80.1  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1306  DNA helicase  25.56 
 
 		 1410 aa  80.1  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1133  superfamily I DNA/RNA helicase  28.25 
 
 		 914 aa  80.5  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  21.76 
 
 		 1838 aa  79.3  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  23.78 
 
 		 1822 aa  79.7  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  22.15 
 
 		 1945 aa  79.3  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0444969 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  25 
 
 		 1823 aa  78.2  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  25.58 
 
 		 1861 aa  76.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0829  putative DNA helicase related protein  23.6 
 
 		 1571 aa  77  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0753  DNA/RNA helicase  22.46 
 
 		 1559 aa  77  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  25.09 
 
 		 606 aa  76.6  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0693  superfamily protein I DNA/RNA helicase  25.18 
 
 		 934 aa  76.3  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1970  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  23.82 
 
 		 1853 aa  76.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.525095 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  22.83 
 
 		 2002 aa  75.1  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  24.54 
 
 		 2759 aa  75.1  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  25 
 
 		 2013 aa  73.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1952  superfamily I DNA/RNA helicase  24.44 
 
 		 2096 aa  73.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.447363 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  27.48 
 
 		 629 aa  73.2  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  25.09 
 
 		 1196 aa  73.6  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3679  hypothetical protein  24.4 
 
 		 1328 aa  73.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4744  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  24 
 
 		 1877 aa  72.4  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.994907 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1438  hypothetical protein  24.2 
 
 		 1572 aa  72  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.241805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  23.84 
 
 		 1722 aa  71.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0991  superfamily I DNA/RNA helicase  24.12 
 
 		 2622 aa  72  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0671  viral phosphatase  24.6 
 
 		 1367 aa  71.2  0.00000000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0990  putative DNA helicase related protein  24.03 
 
 		 1559 aa  70.9  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.649093 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0996  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  26.46 
 
 		 1312 aa  70.9  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22960  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1062 aa  70.1  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.0614628 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>