98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1264 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1264  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  553  1e-156  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  4.72011e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1742  hypothetical protein  48.51 
 
 
262 aa  257  1e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0420236  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1088  hypothetical protein  46.44 
 
 
274 aa  248  9e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0860  hypothetical protein  40.43 
 
 
277 aa  223  3e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.671091  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0837  hypothetical protein  40.29 
 
 
277 aa  221  1e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.543815  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1046  protein of unknown function DUF52  41.22 
 
 
284 aa  207  1e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2139  hypothetical protein  40 
 
 
282 aa  204  1e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000979295  hitchhiker  7.10104e-05 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0062  hypothetical protein  40.22 
 
 
281 aa  201  1e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.853485  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0632  hypothetical protein  39.79 
 
 
284 aa  198  9e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.339724 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1105  hypothetical protein  40.43 
 
 
281 aa  194  9e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0028  hypothetical protein  38.49 
 
 
281 aa  192  3e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0191  hypothetical protein  38.73 
 
 
284 aa  192  6e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.528017  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0059  hypothetical protein  37.09 
 
 
282 aa  191  9e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0213251 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1422  hypothetical protein  40.36 
 
 
265 aa  189  3e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00741798 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1286  hypothetical protein  38.73 
 
 
284 aa  188  9e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3359  hypothetical protein  38.38 
 
 
271 aa  187  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0215  hypothetical protein  40.07 
 
 
275 aa  186  4e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1383  hypothetical protein  39.86 
 
 
284 aa  182  3e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0273  hypothetical protein  38.27 
 
 
287 aa  182  6e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2394  hypothetical protein  38.97 
 
 
264 aa  182  7e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00099938  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1651  dioxygenase  35.04 
 
 
267 aa  178  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  9.23672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1590  hypothetical protein  36.69 
 
 
282 aa  176  4e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1268  hypothetical protein  36.69 
 
 
265 aa  174  1e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0697  hypothetical protein  37.89 
 
 
284 aa  174  1e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1509  protein of unknown function DUF52  37.27 
 
 
269 aa  174  1e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1691  hypothetical protein  37.55 
 
 
267 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2994  protein of unknown function DUF52  32.97 
 
 
283 aa  171  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.255109  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2247  hypothetical protein  35.77 
 
 
267 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2961  hypothetical protein  32.86 
 
 
298 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1957  hypothetical protein  34.55 
 
 
267 aa  166  3e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0594008  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1928  protein of unknown function DUF52  34.8 
 
 
266 aa  165  6e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1301  protein of unknown function DUF52  39.03 
 
 
271 aa  165  8e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0694479  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1313  hypothetical protein  32.97 
 
 
438 aa  164  1e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1094  hypothetical protein  32.6 
 
 
438 aa  164  2e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0208  protein of unknown function DUF52  32.6 
 
 
268 aa  163  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2295  protein of unknown function DUF52  34.43 
 
 
266 aa  162  4e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1868  protein of unknown function DUF52  33.9 
 
 
298 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0477  hypothetical protein  35.84 
 
 
269 aa  160  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1885  protein of unknown function DUF52  35.88 
 
 
267 aa  158  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00286837  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1811  hypothetical protein  35.93 
 
 
262 aa  157  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1122  hypothetical protein  31.5 
 
 
438 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0933  protein of unknown function DUF52  38.01 
 
 
262 aa  156  3e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  8.7287e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1326  protein of unknown function DUF52  36.73 
 
 
282 aa  156  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0115608 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5677  protein of unknown function DUF52  37.82 
 
 
275 aa  155  5e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0901572 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1830  hypothetical protein  32.95 
 
 
267 aa  147  1e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0469  hypothetical protein  36.75 
 
 
329 aa  147  2e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49668  normal  0.0956688 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2214  hypothetical protein  32.35 
 
 
262 aa  146  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2891  hypothetical protein  33.96 
 
 
264 aa  142  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00545053  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3224  protein of unknown function DUF52  34.55 
 
 
270 aa  142  7e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1996  AMMECR1 domain-containing protein  32 
 
 
522 aa  135  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2377  protein of unknown function DUF52  31.85 
 
 
262 aa  135  8e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0146872  normal  0.265283 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0680  hypothetical protein  30.15 
 
 
279 aa  129  7e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2594  hypothetical protein  34.23 
 
 
265 aa  128  1e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1355  protein of unknown function DUF52  33.08 
 
 
265 aa  127  2e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.235879  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2620  hypothetical protein  31.23 
 
 
282 aa  127  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.568978 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1004  hypothetical protein  28.26 
 
 
270 aa  126  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1971  hypothetical protein  30.97 
 
 
267 aa  125  6e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.307446 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1586  hypothetical protein  29.48 
 
 
464 aa  125  8e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.251003  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1298  hypothetical protein  26.94 
 
 
276 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495257  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1254  protein of unknown function DUF52  32.69 
 
 
265 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.286029  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0307  protein of unknown function DUF52  33.21 
 
 
265 aa  120  2e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  3.24759e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1171  hypothetical protein  34.34 
 
 
447 aa  119  7e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1177  hypothetical protein  33.84 
 
 
447 aa  117  2e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1871  hypothetical protein  27.47 
 
 
268 aa  117  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3068  hypothetical protein  28.57 
 
 
277 aa  115  8e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.27957  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0931  hypothetical protein  28.16 
 
 
266 aa  113  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0398  hypothetical protein  28.89 
 
 
274 aa  112  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2152  hypothetical protein  26.74 
 
 
481 aa  111  1e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2429  hypothetical protein  30.94 
 
 
484 aa  111  1e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  6.52798e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0072  hypothetical protein  30.26 
 
 
267 aa  110  2e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1057  hypothetical protein  27.54 
 
 
268 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2409  hypothetical protein  28.73 
 
 
284 aa  108  7e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156274  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0726  protein of unknown function DUF52  27.37 
 
 
282 aa  108  8e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14688  hitchhiker  2.54524e-07 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0272  protein of unknown function DUF52  27.11 
 
 
287 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00648873  hitchhiker  0.000150956 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0897  hypothetical protein  26.26 
 
 
278 aa  106  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0572  hypothetical protein  27.27 
 
 
264 aa  102  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.277433  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2683  hypothetical protein  31.16 
 
 
274 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.235336  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1848  hypothetical protein  30.37 
 
 
262 aa  99.8  4e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2215  protein of unknown function DUF52  27.41 
 
 
274 aa  99  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0448  hypothetical protein  25.47 
 
 
282 aa  97.4  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0033  protein of unknown function DUF52  29.56 
 
 
263 aa  95.9  7e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6306  hypothetical protein  27.01 
 
 
254 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0180  protein of unknown function DUF52  29.55 
 
 
285 aa  92  8e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.578209  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2556  protein of unknown function DUF52  27.07 
 
 
268 aa  92  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.323501  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0299  hypothetical protein  29.26 
 
 
282 aa  91.3  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3293  protein of unknown function DUF52  28.84 
 
 
274 aa  85.1  1e-15  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3955  hypothetical protein  25.18 
 
 
405 aa  73.9  3e-12  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.841682  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3629  hypothetical protein  24.09 
 
 
405 aa  73.2  4e-12  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01140  conserved hypothetical protein  30.46 
 
 
346 aa  68.9  9e-11  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599641  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0526  dioxygenase-like protein  26.44 
 
 
225 aa  64.3  2e-09  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.579832  normal  0.413841 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46220  predicted protein  22.46 
 
 
356 aa  63.9  3e-09  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0715961  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0075  hypothetical protein  24.58 
 
 
414 aa  63.5  3e-09  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235956 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36516  predicted protein  23.78 
 
 
345 aa  61.6  1e-08  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3451  protein of unknown function DUF52  24.5 
 
 
299 aa  57.4  2e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3308  hypothetical protein  22.3 
 
 
301 aa  54.7  1e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03789  DUF52 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03970)  28.57 
 
 
366 aa  53.5  4e-06  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2539  hypothetical protein  27.21 
 
 
294 aa  44.3  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3387  protein of unknown function DUF52  24.68 
 
 
299 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>