163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1262 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1262  hypothetical protein  100 
 
 
61 aa  124  5e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  3.95651e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0316  large conductance mechanosensitive channel protein  52.27 
 
 
149 aa  53.9  8e-07  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000219825  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0109  large conductance mechanosensitive channel protein  51.11 
 
 
153 aa  53.1  1e-06  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1330  large conductance mechanosensitive channel protein  50 
 
 
139 aa  50.4  9e-06  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1991  large conductance mechanosensitive channel protein  39.66 
 
 
133 aa  50.1  1e-05  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.595696  normal  0.288973 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2555  large conductance mechanosensitive channel protein  41.07 
 
 
135 aa  49.7  1e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09820  large conductance mechanosensitive channel protein  50 
 
 
132 aa  50.1  1e-05  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.390629 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2600  large-conductance mechanosensitive channel-like protein  60.98 
 
 
101 aa  50.1  1e-05  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1671  large conductance mechanosensitive channel protein  58.54 
 
 
150 aa  50.1  1e-05  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0394869  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06660  large conductance mechanosensitive channel protein  47.73 
 
 
146 aa  49.3  2e-05  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00600968  normal  0.0734515 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0134  large conductance mechanosensitive channel protein  54.76 
 
 
140 aa  48.5  3e-05  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.172297 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  53.66 
 
 
155 aa  48.5  3e-05  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3260  large conductance mechanosensitive channel protein  47.83 
 
 
151 aa  48.1  4e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2860  large conductance mechanosensitive channel protein  47.83 
 
 
151 aa  48.1  4e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1490  large-conductance mechanosensitive channel-like protein  53.33 
 
 
125 aa  48.1  4e-05  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.105065 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1428  large conductance mechanosensitive channel protein  44.9 
 
 
125 aa  48.1  4e-05  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  4.61871e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0124  large conductance mechanosensitive channel protein  54.76 
 
 
140 aa  47.8  5e-05  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.533935  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2389  large-conductance mechanosensitive channel  53.66 
 
 
150 aa  47.4  6e-05  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000367491  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2522  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 
145 aa  47.4  6e-05  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  5.15588e-09  normal  0.121482 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  51.22 
 
 
131 aa  47  8e-05  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  3.47005e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  48.78 
 
 
152 aa  47  8e-05  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  51.22 
 
 
143 aa  47.4  8e-05  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0756  large conductance mechanosensitive channel protein  45.24 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  51.16 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5504  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 
142 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.215904 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 
159 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  48.78 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0031  large-conductance mechanosensitive channel-like protein  51.16 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.840685  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  48.78 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2005  large conductance mechanosensitive channel protein  47.83 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323319  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1956  large conductance mechanosensitive channel protein  37.25 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  48.84 
 
 
143 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3697  large-conductance mechanosensitive channel  51.22 
 
 
143 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1319  large conductance mechanosensitive channel protein  38 
 
 
126 aa  45.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0035  large conductance mechanosensitive channel protein  48.78 
 
 
108 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.262039  normal  0.835133 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  42.11 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2194  large conductance mechanosensitive channel protein  48.78 
 
 
129 aa  45.1  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.166081  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4515  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 
138 aa  45.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00658327  hitchhiker  5.31483e-06 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1538  large conductance mechanosensitive channel protein  45.28 
 
 
143 aa  44.7  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.580363  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0225  large-conductance mechanosensitive channel  45.61 
 
 
145 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0037  large-conductance mechanosensitive channel  48.78 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1425  large conductance mechanosensitive channel protein  45.45 
 
 
137 aa  44.3  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2277  large-conductive mechanosensitive channel  42.55 
 
 
109 aa  44.7  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.589434  normal  0.616343 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0871  large conductance mechanosensitive channel protein  45.65 
 
 
137 aa  44.7  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  45.61 
 
 
145 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0554  large-conductance mechanosensitive channel  48.84 
 
 
136 aa  44.3  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000110723  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0788  large-conductance mechanosensitive channel  51.22 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.112062 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0751  large-conductance mechanosensitive channel  51.22 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  52.38 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  48.84 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0386  large conductance mechanosensitive channel protein  46.51 
 
 
143 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.242536 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  48.84 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  48.84 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  48.84 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  48.84 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  48.84 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  48.84 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5262  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 
143 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0455479  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3339  large-conductance mechanosensitive channel  48.84 
 
 
136 aa  43.9  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  43.86 
 
 
138 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3094  large-conductance mechanosensitive channel  52.38 
 
 
144 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.350384  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1843  large conductance mechanosensitive channel protein  46.55 
 
 
126 aa  43.9  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.130997  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1750  large conductance mechanosensitive channel protein  47.62 
 
 
133 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1975  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0443039 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1865  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.568071  hitchhiker  0.00372648 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2860  large-conductance mechanosensitive channel  48.84 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.219386 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1951  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6128  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.316261  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1938  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13070  large conductance mechanosensitive channel protein  47.62 
 
 
151 aa  43.5  0.0009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00812185  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  47.5 
 
 
134 aa  43.5  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1961  mechanosensitive channel  46.51 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.171648 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3207  large-conductance mechanosensitive channel  48.84 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2963  large conductance mechanosensitive channel protein  47.62 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3679  large-conductance mechanosensitive channel  46.34 
 
 
137 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3714  large-conductance mechanosensitive channel  46.34 
 
 
137 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.401904 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3607  large-conductance mechanosensitive channel  46.34 
 
 
137 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.256612 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0387  large conductance mechanosensitive channel protein  45.24 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376217  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3606  large-conductance mechanosensitive channel  46.34 
 
 
137 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0494582  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  45.24 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1288  large conductance mechanosensitive channel protein  44.19 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  47.62 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0624  large conductance mechanosensitive channel protein  48.78 
 
 
176 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.29249  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  47.62 
 
 
199 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  47.62 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  46.51 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3777  large-conductance mechanosensitive channel  46.34 
 
 
137 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  46.51 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1318  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212571  hitchhiker  0.00243459 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0055  large conductance mechanosensitive channel protein  42.11 
 
 
140 aa  42.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  47.62 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1549  large-conductance mechanosensitive channel  43.9 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.406526  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  45.24 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0848  large-conductance mechanosensitive channel  48.84 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.231503  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  47.62 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  47.62 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  47.62 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  47.62 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  45.24 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>