199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1261 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0035  ISCpe7, transposase  100 
 
 
316 aa  650  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.800546  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0745  ISCpe7, transposase  100 
 
 
316 aa  650  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  8.15737e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0315  ISCpe7, transposase  100 
 
 
316 aa  650  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00611234  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1412  ISCpe7, transposase  100 
 
 
316 aa  650  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  6.18416e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1078  ISCpe7, transposase  100 
 
 
316 aa  650  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  1.01857e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1261  ISCpe7, transposase  100 
 
 
316 aa  650  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  1.18886e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1574  ISCpe7, transposase  57.73 
 
 
312 aa  362  5e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0509  ISCpe7, transposase  57.73 
 
 
312 aa  362  5e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0030  insertion element protein  57.41 
 
 
312 aa  362  6e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  8.55614e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1361  ISCpe7, transposase  57.41 
 
 
312 aa  361  7e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0203024  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1581  ISCpe7, transposase  57.41 
 
 
312 aa  361  7e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0556  ISCpe7, transposase  57.41 
 
 
312 aa  361  7e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00138013  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0727  insertion element protein  57.41 
 
 
312 aa  361  7e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0799  ISCpe7, transposase  57.41 
 
 
312 aa  361  7e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0903  ISCpe7, transposase  57.41 
 
 
312 aa  361  7e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  5.97662e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1164  ISCpe7, transposase  57.41 
 
 
312 aa  361  7e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0422  insertion element protein  57.41 
 
 
312 aa  361  7e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0078  ISCpe7, transposase  57.41 
 
 
312 aa  360  1e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.516266  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0337  ISCpe7, transposase  57.41 
 
 
312 aa  360  1e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.500965  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1196  ISCpe7, transposase  57.41 
 
 
312 aa  360  1e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0386  hypothetical protein  47.15 
 
 
261 aa  267  2e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0115  hypothetical protein  46.52 
 
 
261 aa  256  3e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  1.60092e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0802  ISCpe7, transposase  31.46 
 
 
340 aa  142  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0691516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0681  ISCpe7, transposase  31.46 
 
 
340 aa  142  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0947  ISCpe7, transposase  30.42 
 
 
340 aa  142  8e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0680749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0809  ISCpe7, transposase  31.46 
 
 
340 aa  141  1e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.313897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0784  ISCpe7, transposase  31.15 
 
 
340 aa  140  2e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.653929  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1313  ISCpe7, transposase  30.84 
 
 
340 aa  140  2e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0190357  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0982  ISCpe7, transposase  30.84 
 
 
340 aa  140  2e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  5.45032e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2640  Integrase catalytic region  32.71 
 
 
353 aa  139  5e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0674  Integrase catalytic region  32.71 
 
 
353 aa  139  5e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1944  Integrase catalytic region  32.71 
 
 
353 aa  139  5e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.704589  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2422  Integrase catalytic region  32.71 
 
 
353 aa  139  5e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0755  integrase catalytic subunit  32.92 
 
 
343 aa  136  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.47635e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1537  ISCpe7, transposase  29.52 
 
 
340 aa  134  1e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.10688  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2243  Integrase catalytic region  32.09 
 
 
353 aa  134  2e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.781166 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2179  Integrase catalytic region  32.09 
 
 
353 aa  134  2e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  5.21095e-09  hitchhiker  1.88153e-16 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0243  Integrase catalytic region  32.09 
 
 
353 aa  134  2e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0037  Integrase catalytic region  32.09 
 
 
353 aa  134  2e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1912  Integrase catalytic region  32.09 
 
 
353 aa  134  2e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2409  Integrase catalytic region  32.09 
 
 
353 aa  134  2e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1065  Integrase catalytic region  32.09 
 
 
353 aa  134  2e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.106559 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1473  ISCpe7, transposase  33.2 
 
 
253 aa  130  2e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.804077  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1621  hypothetical protein  33.44 
 
 
334 aa  114  2e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0635  ISCpe7, transposase  31.52 
 
 
186 aa  79  9e-14  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0929  ISCpe7, transposase  31.52 
 
 
186 aa  78.6  1e-13  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0298408  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4107  integrase  26.07 
 
 
236 aa  68.6  1e-10  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1190  ISCpe7, transposase  31.78 
 
 
137 aa  65.9  9e-10  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0283879  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1189  ISCpe7, transposase  30.92 
 
 
152 aa  63.2  6e-09  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238866  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4081  putative transposase  23.76 
 
 
224 aa  61.6  1e-08  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  25.12 
 
 
236 aa  62  1e-08  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0634  ISCpe7, transposase  30.65 
 
 
156 aa  62  1e-08  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0930  ISCpe7, transposase  30.23 
 
 
156 aa  61.6  2e-08  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00303612  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  25.98 
 
 
237 aa  60.5  3e-08  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  25.49 
 
 
236 aa  60.5  3e-08  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2913  transposase  25.85 
 
 
237 aa  60.1  5e-08  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3074  transposase  25.85 
 
 
237 aa  60.1  5e-08  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2997  transposase  25.85 
 
 
237 aa  60.1  5e-08  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3012  transposase  25.85 
 
 
237 aa  60.1  5e-08  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3086  transposase  25.85 
 
 
237 aa  60.1  5e-08  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3017  transposase  25.85 
 
 
237 aa  60.1  5e-08  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2945  transposase  25.85 
 
 
237 aa  60.1  5e-08  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7148  transposase  27.06 
 
 
232 aa  59.7  7e-08  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3408  integrase catalytic region  23.76 
 
 
262 aa  57.8  2e-07  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  25.49 
 
 
237 aa  57.8  2e-07  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4149  integrase  25.52 
 
 
213 aa  57.4  3e-07  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2874  integrase catalytic region  23.44 
 
 
213 aa  56.2  7e-07  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4519  putative transposase  25.13 
 
 
233 aa  55.5  1e-06  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00999598  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9039  transposase  23.23 
 
 
243 aa  54.7  2e-06  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8473  putative transposase  21.43 
 
 
233 aa  55.1  2e-06  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396806  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0175  transposase  24.74 
 
 
232 aa  54.7  2e-06  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2782  integrase catalytic subunit  23.96 
 
 
231 aa  54.3  3e-06  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0856154  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0170  integrase catalytic subunit  21.26 
 
 
319 aa  54.3  3e-06  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0337001  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3268  integrase catalytic region  24.48 
 
 
212 aa  53.9  4e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  27.5 
 
 
302 aa  53.5  4e-06  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4618  putative transposase  25.13 
 
 
233 aa  53.5  4e-06  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0617811  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3886  putative insertion sequence transposase-like protein  26.2 
 
 
227 aa  53.5  5e-06  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.829291  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1506  transposase  23.62 
 
 
238 aa  53.1  5e-06  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4725  transposase  22.71 
 
 
237 aa  53.1  5e-06  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393822  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0219  integrase catalytic subunit  27.52 
 
 
231 aa  53.1  6e-06  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.465023  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4459  putative transposase  25.13 
 
 
233 aa  53.1  7e-06  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  27.5 
 
 
235 aa  53.1  7e-06  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4457  putative transposase  25.13 
 
 
233 aa  53.1  7e-06  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4632  putative transposase  25.13 
 
 
233 aa  53.1  7e-06  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223023  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8044  transposase  26 
 
 
238 aa  52.8  8e-06  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5033  hypothetical protein  25.23 
 
 
250 aa  52.8  8e-06  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9135  transposase  25.45 
 
 
180 aa  52.4  9e-06  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0658372  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0319  transposase  22.59 
 
 
470 aa  52.4  1e-05  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9042  transposase  26 
 
 
238 aa  52.4  1e-05  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1485  transposase  23.81 
 
 
238 aa  52  1e-05  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  24.53 
 
 
250 aa  52  1e-05  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4360  transposase  24.14 
 
 
237 aa  52  1e-05  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.017545  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1495  transposase  23.81 
 
 
238 aa  52  1e-05  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7074  transposase  22.73 
 
 
238 aa  52  1e-05  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1481  transposase  23.81 
 
 
238 aa  52  1e-05  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.84376  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.88 
 
 
346 aa  52.4  1e-05  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  24.64 
 
 
250 aa  51.2  2e-05  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8070  transposase  24.83 
 
 
346 aa  51.2  2e-05  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.837659  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  25.36 
 
 
250 aa  50.8  3e-05  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  24.15 
 
 
250 aa  50.8  3e-05  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>