135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1253 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1253  hydroxypyruvate reductase  100 
 
 
412 aa  829  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  3.56699e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1207  hydroxypyruvate reductase  64.36 
 
 
417 aa  535  1e-151  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103634  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1248  hydroxypyruvate reductase  64.36 
 
 
417 aa  535  1e-151  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0534  hydroxypyruvate reductase  61.41 
 
 
415 aa  510  1e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0143531  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0085  hydroxypyruvate reductase  54.13 
 
 
403 aa  436  1e-121  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.145768  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2103  hydroxypyruvate reductase  52.78 
 
 
410 aa  410  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0207  hydroxypyruvate reductase  43.97 
 
 
459 aa  351  1e-95  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0099  Hydroxypyruvate reductase  43.91 
 
 
443 aa  337  3e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3915  MOFRL domain-containing protein  42.31 
 
 
443 aa  333  3e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1233  glycerate 2-kinase  42.86 
 
 
441 aa  306  3e-82  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.273528 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3389  Hydroxypyruvate reductase  43.22 
 
 
453 aa  292  8e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.911945  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2854  glycerate 2-kinase  42.52 
 
 
428 aa  288  1e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0472  hydroxypyruvate reductase  43.26 
 
 
442 aa  288  2e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.488589  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1573  hydroxypyruvate reductase  41.67 
 
 
452 aa  285  1e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0993833  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1644  Hydroxypyruvate reductase  39.14 
 
 
421 aa  284  2e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1997  hydroxypyruvate reductase  42.07 
 
 
458 aa  282  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.05256 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0372  putative hydroxypyruvate reductase  37.32 
 
 
448 aa  274  2e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.236389  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0944  Hydroxypyruvate reductase  40.05 
 
 
439 aa  274  2e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0451317  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0355  hydroxypyruvate reductase, putative  37.32 
 
 
428 aa  273  4e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3272  hydroxypyruvate reductase  43.77 
 
 
458 aa  272  9e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.571627 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0461  hydroxypyruvate reductase  40.72 
 
 
424 aa  271  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38588  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2751  glycerate 2-kinase  36.16 
 
 
486 aa  268  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1461  Hydroxypyruvate reductase  37.44 
 
 
424 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012769  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4311  hydroxypyruvate reductase  36.28 
 
 
422 aa  259  6e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2329  hydroxypyruvate reductase  34.69 
 
 
432 aa  259  7e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162481  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1595  glycerate 2-kinase  39.11 
 
 
424 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618023  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3833  hypothetical protein  39.39 
 
 
421 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3294  glycerate 2-kinase  40.5 
 
 
435 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805027  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3263  glycerate 2-kinase  36.14 
 
 
420 aa  257  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1721  hydroxypyruvate reductase  37.91 
 
 
447 aa  256  7e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374264  normal  0.0199208 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45030  hypothetical protein  39.11 
 
 
421 aa  255  1e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1018  hydroxypyruvate reductase  38.04 
 
 
448 aa  254  2e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3481  Hydroxypyruvate reductase  38.61 
 
 
439 aa  254  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.866282  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1267  hydroxypyruvate reductase  40.78 
 
 
422 aa  253  4e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315917  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1449  hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  33.97 
 
 
446 aa  253  4e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.618251  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3865  hydroxypyruvate reductase  38.66 
 
 
424 aa  253  4e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2309  hydroxypyruvate reductase  39.78 
 
 
426 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.866459  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3154  Hydroxypyruvate reductase  38.61 
 
 
439 aa  252  8e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1569  hydroxypyruvate reductase  38.66 
 
 
424 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305775  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2205  hydroxypyruvate reductase  36.61 
 
 
454 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.870447 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4300  hydroxypyruvate reductase  38.66 
 
 
424 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2115  hydroxypyruvate reductase  35.93 
 
 
440 aa  250  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0122606 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3625  hydroxypyruvate reductase  38.38 
 
 
424 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1319  hydroxypyruvate reductase  37.2 
 
 
422 aa  249  6e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136183  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1434  hydroxypyruvate reductase  34.35 
 
 
438 aa  249  7e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9119  hydroxypyruvate reductase  39.33 
 
 
411 aa  249  8e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3451  glycerate 2-kinase  39.39 
 
 
443 aa  249  9e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1122  hydroxypyruvate reductase  36.18 
 
 
440 aa  249  9e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.468975  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2839  MOFRL  35.73 
 
 
421 aa  248  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0976  hydroxypyruvate reductase  36.01 
 
 
429 aa  248  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0906913  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1042  Hydroxypyruvate reductase  36.18 
 
 
440 aa  248  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1502  Hydroxypyruvate reductase  38.27 
 
 
446 aa  246  6e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2421  Hydroxypyruvate reductase  37.87 
 
 
454 aa  246  7e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3104  hydroxypyruvate reductase  36.08 
 
 
418 aa  244  2e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561288  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3717  Hydroxypyruvate reductase  33.81 
 
 
420 aa  244  2e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3163  hydroxypyruvate reductase  37.03 
 
 
423 aa  244  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0816  hydroxypyruvate reductase  35.02 
 
 
445 aa  243  4e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3177  hydroxypyruvate reductase  35.31 
 
 
428 aa  243  4e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5562  hydroxypyruvate reductase  36.23 
 
 
404 aa  243  4e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912561  normal  0.104542 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2801  Hydroxypyruvate reductase  37.39 
 
 
452 aa  242  9e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2118  glycerate 2-kinase  34.05 
 
 
426 aa  242  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3609  MOFRL domain protein  33.09 
 
 
419 aa  241  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0806  Hydroxypyruvate reductase  36.88 
 
 
496 aa  241  2e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0477  hydroxypyruvate reductase  37.33 
 
 
374 aa  240  4e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3921  Hydroxypyruvate reductase  33.41 
 
 
446 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3413  Hydroxypyruvate reductase  37.92 
 
 
443 aa  236  5e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.691767  normal  0.696405 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4629  hydroxypyruvate reductase  38.72 
 
 
440 aa  235  1e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3775  MOFRL domain-containing protein  38.37 
 
 
413 aa  234  2e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.801472  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2615  hydroxypyruvate reductase  36.52 
 
 
422 aa  233  5e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2974  Hydroxypyruvate reductase  38.69 
 
 
437 aa  232  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.845005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2747  hydroxypyruvate reductase  38.69 
 
 
437 aa  231  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279736  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1113  hydroxypyruvate reductase  33.02 
 
 
448 aa  231  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1715  Hydroxypyruvate reductase  38.55 
 
 
421 aa  230  3e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.497663 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2209  hydroxypyruvate reductase  34.29 
 
 
444 aa  230  4e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1160  hydroxypyruvate reductase  35.64 
 
 
439 aa  229  5e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.370064  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2464  hydroxypyruvate reductase  37.15 
 
 
421 aa  227  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1425  Hydroxypyruvate reductase  35.58 
 
 
424 aa  228  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0336  hydroxypyruvate reductase  36.43 
 
 
412 aa  224  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2869  Hydroxypyruvate reductase  38.69 
 
 
437 aa  223  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2454  Hydroxypyruvate reductase  34.29 
 
 
439 aa  223  5e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0126  hydroxypyruvate reductase  38.79 
 
 
439 aa  223  7e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.448884 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3471  hydroxypyruvate reductase  37.47 
 
 
420 aa  222  7e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.500752  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2772  glycerate 2-kinase  38.1 
 
 
424 aa  221  1e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569344  normal  0.431109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0928  hydroxypyruvate reductase  35.87 
 
 
460 aa  222  1e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0377  Hydroxypyruvate reductase  33.5 
 
 
432 aa  221  2e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1889  hydroxypyruvate reductase  36.91 
 
 
450 aa  221  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  3.03684e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2230  hydroxypyruvate reductase  38.48 
 
 
451 aa  219  6e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3926  hydroxypyruvate reductase  38.01 
 
 
407 aa  219  6e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0380  MOFRL domain protein  36.31 
 
 
504 aa  219  8e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.328441  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5683  Hydroxypyruvate reductase  36.66 
 
 
428 aa  217  3e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0405  MOFRL  35.12 
 
 
432 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0774334 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0362  Hydroxypyruvate reductase  34.23 
 
 
432 aa  216  6e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.228357  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1132  hydroxypyruvate reductase  35.32 
 
 
435 aa  214  2e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3906  hypothetical protein  35.57 
 
 
427 aa  214  2e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.394161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4659  Hydroxypyruvate reductase  34.9 
 
 
419 aa  214  2e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4591  hydroxypyruvate reductase  32.6 
 
 
472 aa  213  4e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.606287  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5964  MOFRL domain protein  37.78 
 
 
434 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0654  MOFRL domain protein  34.82 
 
 
419 aa  212  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3046  Hydroxypyruvate reductase  37.23 
 
 
415 aa  211  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418895  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0463  hydroxypyruvate reductase  35.77 
 
 
437 aa  211  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00870475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>