More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1243 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1243  GrpE protein  100 
 
 
194 aa  382  1e-105  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.847683  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  47.17 
 
 
172 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  46.54 
 
 
172 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0088  GrpE protein  46.2 
 
 
183 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.141966  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  37.57 
 
 
210 aa  115  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  35 
 
 
207 aa  99  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  33.33 
 
 
213 aa  96.7  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  34.78 
 
 
225 aa  95.1  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0621  GrpE protein  34.44 
 
 
189 aa  93.2  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000112666  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  31.08 
 
 
213 aa  90.9  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 
209 aa  90.5  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  31.67 
 
 
194 aa  89.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  36.91 
 
 
179 aa  89.4  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  31.82 
 
 
208 aa  87.8  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1614  GrpE protein  36.9 
 
 
175 aa  87.4  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.245406  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  29.48 
 
 
192 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  32.24 
 
 
201 aa  87  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  29.95 
 
 
188 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  29.95 
 
 
188 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  29.19 
 
 
188 aa  85.5  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  29.95 
 
 
188 aa  85.5  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  29.95 
 
 
188 aa  85.5  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  29.95 
 
 
188 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  29.95 
 
 
188 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  29.95 
 
 
188 aa  85.5  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1579  GrpE protein  33.55 
 
 
184 aa  85.1  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  36.36 
 
 
195 aa  84.7  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  33.33 
 
 
231 aa  84  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  30.67 
 
 
192 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  38.28 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  31.52 
 
 
192 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  35.33 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  31.33 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  25.5 
 
 
195 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  28.57 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  30.95 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  30.95 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 
194 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  29.73 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  29.63 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  32.11 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  31.02 
 
 
239 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0674  grpE protein  31.35 
 
 
190 aa  79.3  0.00000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.04297  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  29.21 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  32.22 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  27.53 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  33.09 
 
 
247 aa  79.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0564  GrpE protein  27.27 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  28.5 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  31.82 
 
 
246 aa  78.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  32.74 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0427  GrpE protein  30.99 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0102412 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  33.83 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  34.75 
 
 
206 aa  77.8  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_002950  PG1775  grpE protein  29.17 
 
 
194 aa  77.4  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3094  heat shock protein GrpE  33.76 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000190441  normal  0.118238 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1605  GrpE protein  33.95 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0303276  normal  0.370472 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  29.74 
 
 
211 aa  77  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  29.14 
 
 
181 aa  77  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  32.9 
 
 
248 aa  76.3  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2045  co-chaperone GrpE  31.55 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  32.12 
 
 
194 aa  75.9  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  30.41 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  30.41 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  34.85 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1583  GrpE protein  32.28 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.852741  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  30.11 
 
 
274 aa  75.5  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  29.84 
 
 
192 aa  75.1  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  33.15 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1423  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)-like  31.29 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  29.84 
 
 
192 aa  75.1  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  29.84 
 
 
192 aa  75.1  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  27.1 
 
 
224 aa  74.7  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  31.97 
 
 
217 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  31.06 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  31.06 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.948871 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  33.12 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  32.24 
 
 
198 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  32.48 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  32.48 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  32.48 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  32.48 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  32.48 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  32.48 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1120  co-chaperone GrpE  30.95 
 
 
194 aa  72.8  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0675757  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  28.38 
 
 
239 aa  72.8  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  32.48 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  32.48 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  27.8 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  28.57 
 
 
198 aa  72  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  28.57 
 
 
187 aa  72  0.000000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  28.21 
 
 
190 aa  72  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  28.31 
 
 
237 aa  71.6  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  27.67 
 
 
206 aa  71.6  0.000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  27.46 
 
 
208 aa  71.2  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3590  GrpE protein  25.53 
 
 
177 aa  71.2  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00352283  normal  0.0900367 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  30.37 
 
 
196 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  30.37 
 
 
196 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  32.03 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>