35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1240 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1240  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 465 aa  951    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000394663  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0295  extracellular solute-binding protein  72.99 
 
 		 464 aa  695    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0090  extracellular solute-binding protein family 1  21.52 
 
 		 489 aa  70.5  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2303  extracellular solute-binding protein family 1  26.75 
 
 		 480 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.316955  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2870  extracellular solute-binding protein  30.54 
 
 		 447 aa  54.3  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0437  extracellular solute-binding protein family 1  24.57 
 
 		 424 aa  54.7  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000010114  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  29.05 
 
 		 439 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0091  ABC sorbitol/mannitol transporter, periplasmic binding protein  25.79 
 
 		 436 aa  50.1  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.126585  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1727  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 436 aa  50.1  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  26.56 
 
 		 441 aa  49.3  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1597  extracellular solute-binding protein family 1  30.19 
 
 		 456 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  22.8 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0854  extracellular solute-binding protein family 1  27.33 
 
 		 398 aa  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.124504  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1681  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 		 436 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.901925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  29.61 
 
 		 419 aa  47  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 415 aa  46.6  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  24.71 
 
 		 443 aa  47  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  23.97 
 
 		 441 aa  47  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.02 
 
 		 416 aa  46.6  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  22.4 
 
 		 435 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  21.51 
 
 		 436 aa  46.2  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 		 410 aa  46.6  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0503  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 443 aa  46.2  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000478191  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  23.17 
 
 		 439 aa  45.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  35.34 
 
 		 431 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 		 408 aa  45.1  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27400  periplasmic mannitol-binding protein of mannitol ABC transporter  24.23 
 
 		 438 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7516  extracellular solute-binding protein family 1  29.29 
 
 		 452 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2041  extracellular solute-binding protein  26 
 
 		 436 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 		 420 aa  45.1  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0753  extracellular solute-binding protein  22.6 
 
 		 437 aa  45.1  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2112  extracellular solute-binding protein family 1  41.27 
 
 		 449 aa  44.3  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0884714  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2440  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 440 aa  43.5  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0811647  decreased coverage  0.000336324 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  38.24 
 
 		 418 aa  43.1  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1094  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 439 aa  43.5  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.962008  normal  0.028756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>