More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1228 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
192 aa  387  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.73 
 
 
160 aa  125  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  32.32 
 
 
183 aa  114  6e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0986  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
244 aa  96.7  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.354559 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2205  flavin reductase-like, FMN-binding  33.33 
 
 
162 aa  93.6  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.361259  normal  0.347764 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.61 
 
 
197 aa  90.9  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.14 
 
 
225 aa  89.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.14 
 
 
193 aa  89.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4078  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
204 aa  89  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.93 
 
 
185 aa  89  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  31.08 
 
 
216 aa  88.6  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  7.09652e-06 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  31.85 
 
 
209 aa  88.6  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  31.85 
 
 
195 aa  88.2  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.11 
 
 
194 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  27.97 
 
 
199 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.29 
 
 
186 aa  85.5  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.41 
 
 
186 aa  84  1e-15  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.29 
 
 
186 aa  84.3  1e-15  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  4.89831e-08 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1226  flavin reductase domain-containing protein  33.78 
 
 
248 aa  83.6  2e-15  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.384707 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  28.67 
 
 
205 aa  83.6  2e-15  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.54 
 
 
189 aa  82.4  4e-15  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  33.57 
 
 
186 aa  81.6  6e-15  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14951  hypothetical protein  29.32 
 
 
168 aa  79.7  2e-14  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.431741 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.46 
 
 
186 aa  80.1  2e-14  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  27.97 
 
 
208 aa  80.1  2e-14  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2046  hypothetical protein  28.47 
 
 
194 aa  80.1  2e-14  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179971  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.03 
 
 
215 aa  79.7  3e-14  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  29.86 
 
 
189 aa  79.7  3e-14  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.87 
 
 
215 aa  79.3  3e-14  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  29.77 
 
 
185 aa  79.3  3e-14  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  28.76 
 
 
189 aa  78.6  5e-14  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  28.24 
 
 
184 aa  78.6  5e-14  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  4.40007e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  28.08 
 
 
202 aa  78.2  6e-14  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1327  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.48 
 
 
192 aa  78.2  7e-14  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.67 
 
 
186 aa  77  1e-13  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  27.21 
 
 
177 aa  77.4  1e-13  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  30.6 
 
 
192 aa  77  2e-13  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  30.6 
 
 
192 aa  77  2e-13  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2731  flavin reductase-like domain-containing protein  32.06 
 
 
164 aa  77  2e-13  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.066131  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1253  flavin reductase-like, FMN-binding protein  29.2 
 
 
164 aa  76.3  3e-13  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.516374  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  30.15 
 
 
181 aa  75.9  3e-13  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  28.29 
 
 
189 aa  75.9  3e-13  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0792  flavin reductase domain-containing protein  30.33 
 
 
149 aa  75.5  4e-13  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.67 
 
 
215 aa  75.9  4e-13  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0769  flavin reductase domain-containing protein  30.33 
 
 
149 aa  75.5  5e-13  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2072  flavin reductase domain-containing protein  31.2 
 
 
190 aa  75.1  6e-13  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1850  hypothetical protein  31.3 
 
 
180 aa  75.1  6e-13  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.147622 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  29.14 
 
 
189 aa  75.1  7e-13  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4577  flavin reductase domain-containing protein  28.26 
 
 
189 aa  74.7  9e-13  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1712  flavin reductase domain-containing protein  34 
 
 
189 aa  74.3  9e-13  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.0473113 
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  30.15 
 
 
195 aa  74.3  1e-12  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2602  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.63 
 
 
160 aa  74.3  1e-12  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  26.97 
 
 
188 aa  73.9  1e-12  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0160  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.04 
 
 
159 aa  73.2  2e-12  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3504  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.89 
 
 
160 aa  73.6  2e-12  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.507811  normal  0.0756522 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.61 
 
 
195 aa  73.2  2e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09651  hypothetical protein  32.31 
 
 
162 aa  72.8  3e-12  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  29.6 
 
 
189 aa  72.8  3e-12  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  29.6 
 
 
189 aa  72.8  3e-12  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  29.6 
 
 
189 aa  72.8  3e-12  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  27.48 
 
 
178 aa  72.8  3e-12  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  24.43 
 
 
178 aa  72.4  4e-12  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2194  flavin reductase domain-containing protein  29.6 
 
 
189 aa  72  5e-12  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1364  hypothetical protein  29.85 
 
 
160 aa  72  5e-12  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1546  flavin reductase domain-containing protein  29.6 
 
 
189 aa  71.6  6e-12  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.917994  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  30 
 
 
189 aa  71.2  8e-12  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2185  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.37 
 
 
189 aa  71.2  9e-12  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00717772  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1034  flavin reductase domain-containing protein  25.36 
 
 
164 aa  70.9  1e-11  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1255  flavin reductase domain-containing protein  32.82 
 
 
216 aa  70.5  1e-11  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1230  flavin reductase domain-containing protein  34.85 
 
 
177 aa  70.5  1e-11  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.407466  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09761  hypothetical protein  31.54 
 
 
162 aa  70.5  2e-11  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.432138  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0401  flavin reductase domain-containing protein  29.08 
 
 
186 aa  69.7  2e-11  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181273 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  31.15 
 
 
152 aa  70.1  2e-11  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09781  hypothetical protein  31.54 
 
 
162 aa  70.5  2e-11  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1114  hypothetical protein  29.85 
 
 
160 aa  70.5  2e-11  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  29.22 
 
 
188 aa  70.1  2e-11  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0917  hypothetical protein  31.54 
 
 
162 aa  70.5  2e-11  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00504908  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.47 
 
 
194 aa  70.1  2e-11  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  27.86 
 
 
189 aa  69.3  3e-11  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3170  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.24 
 
 
160 aa  69.7  3e-11  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  26.12 
 
 
200 aa  68.9  4e-11  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  31.54 
 
 
202 aa  68.9  5e-11  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1555  flavin reductase domain-containing protein  30.15 
 
 
186 aa  67.8  8e-11  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0980  flavin reductase domain-containing protein  27.27 
 
 
194 aa  67.8  8e-11  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  26.62 
 
 
186 aa  67.4  1e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0643  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.54 
 
 
159 aa  66.6  2e-10  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0543494  normal  0.644181 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2008  hypothetical protein  29.01 
 
 
160 aa  66.6  2e-10  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0687  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.24 
 
 
192 aa  66.6  2e-10  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.21 
 
 
189 aa  66.6  2e-10  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0388  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  25.87 
 
 
159 aa  66.6  2e-10  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5217  flavin reductase domain-containing protein  24.87 
 
 
182 aa  67  2e-10  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1931  flavin reductase domain-containing protein  26.09 
 
 
197 aa  66.2  3e-10  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0605182 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0162  flavin reductase-like protein  29.23 
 
 
167 aa  65.9  3e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1242  flavin reductase domain-containing protein  27.66 
 
 
192 aa  66.2  3e-10  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.877507  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.15 
 
 
190 aa  66.2  3e-10  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3891  flavin reductase domain-containing protein  26.09 
 
 
194 aa  65.9  4e-10  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824714  normal  0.0240386 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0327  hypothetical protein  27.61 
 
 
160 aa  65.5  4e-10  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217088  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10001  hypothetical protein  27.61 
 
 
160 aa  65.5  4e-10  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.537095  normal  0.391839 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2155  flavin reductase domain-containing protein  26.95 
 
 
192 aa  65.9  4e-10  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4508  flavin reductase-like, FMN-binding  26.95 
 
 
194 aa  65.5  4e-10  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.372543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>