119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1198 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1198  GTP-binding protein HSR1-related  100 
 
 		 376 aa  763    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0079  GTP-binding protein HSR1-related  46.43 
 
 		 363 aa  352  5e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00226262  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0079  GTP-binding protein, HSR1-related  46.15 
 
 		 363 aa  351  1e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000212587  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0797  GTP-binding protein, HSR1-related  42.82 
 
 		 357 aa  306  6e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0841  hypothetical protein  37.81 
 
 		 365 aa  249  4e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1822  GTP-binding protein HSR1-related protein  35.34 
 
 		 379 aa  219  7.999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1664  GTP-binding protein YqeH  30.65 
 
 		 372 aa  179  7e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00606929  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1585  GTP-binding protein YqeH  30.91 
 
 		 372 aa  175  9e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.595212  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1740  GTP-binding protein YqeH  28.84 
 
 		 379 aa  166  6.9999999999999995e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0992  GTP-binding protein YqeH  29.3 
 
 		 369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2459  GTP-binding protein YqeH  28.76 
 
 		 370 aa  159  6e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019503  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0226  GTP-binding protein YqeH  27.18 
 
 		 401 aa  159  7e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0436  GTP-binding protein HSR1-related protein  30.08 
 
 		 391 aa  159  8e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1237  GTP-binding protein YqeH  27.75 
 
 		 375 aa  159  9e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000896118  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1164  GTP-binding protein YqeH  28.88 
 
 		 366 aa  158  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914946  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4186  GTP-binding protein YqeH  27.69 
 
 		 368 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4416  GTP-binding protein YqeH  27.51 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4233  GTP-binding protein YqeH  27.51 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4071  GTP-binding protein YqeH  27.51 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0184971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4081  GTP-binding protein YqeH  27.51 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4562  GTP-binding protein YqeH  27.51 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1654  GTP-binding protein YqeH  30.75 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1689  GTP-binding protein YqeH  30.75 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4357  GTP-binding protein YqeH  27.51 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.701648 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4468  GTP-binding protein YqeH  27.51 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0923529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4455  GTP-binding protein YqeH  27.51 
 
 		 368 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3061  GTP-binding protein YqeH  27.15 
 
 		 368 aa  150  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.844402  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0782  GTP-binding protein YqeH  27.25 
 
 		 368 aa  149  9e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0185086  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0424  hypothetical protein  30.62 
 
 		 367 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.00290695  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2017  ribosome biogenesis GTPase YqeH  25.13 
 
 		 396 aa  145  9e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl351  GTPase  31.05 
 
 		 365 aa  144  3e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.213e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0906  GTP-binding protein YqeH  29.37 
 
 		 385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.346468  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1404  GTP-binding protein YqeH  27.69 
 
 		 369 aa  138  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000143151  hitchhiker  2.51031e-26 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49745  predicted protein  25.26 
 
 		 604 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.814694  normal  0.848329 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40200  predicted protein  23.9 
 
 		 710 aa  113  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00209699  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0525  ribosome biogenesis GTPase YqeH  27.08 
 
 		 361 aa  109  8.000000000000001e-23  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.642642  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37471  predicted protein  24.41 
 
 		 401 aa  67.8  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0357188  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1194  GTP-binding protein HSR1-related  35.29 
 
 		 379 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0579  GTP-binding protein HSR1-related  36.24 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1339  GTP-binding protein HSR1-related  36.24 
 
 		 374 aa  59.7  0.00000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0259  GTP-binding protein YlqF  34.9 
 
 		 384 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30716  nuclear/nucleolar GTP-binding protein 2  31.79 
 
 		 534 aa  54.3  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0409155  normal  0.593065 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0645  GTP-binding protein HSR1-related  37.3 
 
 		 374 aa  54.3  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.112449  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0391  small GTP-binding protein  46.43 
 
 		 334 aa  53.5  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2182  predicted protein  27.49 
 
 		 360 aa  53.5  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28889  predicted protein  29.5 
 
 		 521 aa  53.1  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.691875  normal  0.346364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1586  ribosomal biogenesis GTPase  26.92 
 
 		 281 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0128264 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01666  nucleolar GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08930)  30.72 
 
 		 560 aa  53.1  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0824  GTP-binding protein, HSR1-related  33.09 
 
 		 261 aa  52.4  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0763  GTP-binding protein YlqF  30.56 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000221052  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0160  GTP-binding protein, HSR1-related  31.65 
 
 		 262 aa  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.210718  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0158  GTP-binding protein HSR1-related  31.65 
 
 		 262 aa  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0483  GTP-binding protein, HSR1-related  28.23 
 
 		 258 aa  51.2  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4089  ribosomal biogenesis GTPase  24.7 
 
 		 281 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05640  conserved hypothetical protein  26.24 
 
 		 717 aa  48.9  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35887  predicted protein  39.29 
 
 		 664 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0716  GTP1/OBG protein  28.14 
 
 		 292 aa  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00781144  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0973  GTP-binding protein HSR1-related protein  29.44 
 
 		 282 aa  47.8  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000015477  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01215  Myosin-related protein homolog MlpA Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC7]  29.67 
 
 		 544 aa  47.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00107626  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0661  Fe2+ transport system protein B-like protein  45.45 
 
 		 601 aa  47.4  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4128  ribosomal biogenesis GTPase  24.7 
 
 		 281 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0895  GTP-binding protein Obg/CgtA  40 
 
 		 453 aa  47.4  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000142797  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2401  GTP-binding protein HSR1-related  27.41 
 
 		 292 aa  47.4  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00457359  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0017  GTP-binding protein HSR1-related  29.63 
 
 		 259 aa  47.4  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2164  GTP-binding protein  32.43 
 
 		 333 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.311194  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33865  predicted protein  23.17 
 
 		 369 aa  47  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.837548 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01210  conserved hypothetical protein  25.38 
 
 		 669 aa  46.6  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3681  ferrous iron transport protein B  46.43 
 
 		 664 aa  46.6  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.10548  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25133  predicted protein  28.76 
 
 		 562 aa  46.6  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01880  nucleolar GTP-binding protein 1, putative  40 
 
 		 666 aa  45.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0543  GTPase family protein  30.15 
 
 		 316 aa  45.4  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2161  GTP-binding protein, HSR1-related  27.65 
 
 		 268 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1409  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  28.68 
 
 		 271 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.421311  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  38.46 
 
 		 434 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1075  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.86 
 
 		 206 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.550394 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0536  putative GTP-binding protein EngA  28.21 
 
 		 473 aa  45.1  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0135  small GTP-binding protein  45.28 
 
 		 369 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42327  predicted protein  26.26 
 
 		 443 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0021  GTP-binding protein, HSR1-related  30.82 
 
 		 261 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2084  tRNA modification GTPase TrmE  22.37 
 
 		 457 aa  45.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.103263  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0020  small GTP-binding protein  41.51 
 
 		 347 aa  45.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0688  small GTP-binding protein  45.28 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.629301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1230  small GTP-binding protein  45.28 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0469  GTP-binding protein Obg/CgtA  40 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30365  predicted protein  40 
 
 		 677 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.660335  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05865  nucleolar GTP-binding protein (Nog1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11510)  41.07 
 
 		 656 aa  44.3  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.181849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2226  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.95 
 
 		 416 aa  44.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00929863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2933  GTP-binding protein, HSR1-related  35.71 
 
 		 324 aa  44.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000336633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0300  GTP-binding protein  33.87 
 
 		 207 aa  44.7  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0801  small GTP-binding protein  41.51 
 
 		 338 aa  44.7  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.911521  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1688  GTP-binding protein HSR1-related  26.09 
 
 		 341 aa  44.3  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.161371  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1703  ribosomal biogenesis GTPase  29.85 
 
 		 310 aa  43.9  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0958  small GTP-binding protein  44.44 
 
 		 365 aa  44.3  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0186  GTP-binding protein HSR1-related protein  29.58 
 
 		 285 aa  44.3  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3374  ribosomal biogenesis GTPase  26.28 
 
 		 285 aa  43.9  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  34.09 
 
 		 435 aa  44.3  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0600  GTP-binding protein  34.78 
 
 		 230 aa  43.9  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.358533  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  34.09 
 
 		 435 aa  43.9  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  36.26 
 
 		 415 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  38.89 
 
 		 345 aa  43.9  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>