More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1149 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1149  methyltransferase type 12  100 
 
 		 245 aa  493  9.999999999999999e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1581  methyltransferase type 11  37.18 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000326286  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  33.73 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  32.94 
 
 		 248 aa  119  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  29.41 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  30.14 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  27.45 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  27.45 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  28.08 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  27.45 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0740  smtA protein  30.43 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  27.45 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  26.8 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1519  Methyltransferase type 11  29.84 
 
 		 274 aa  65.1  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07260  SAM dependent methyltransferase  26.14 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  27.45 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1384  methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0223759 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0406  methyltransferase type 11  27.15 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.678901 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  25.52 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  29.73 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1722  methyltransferase type 11  26.55 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0192579  decreased coverage  0.00000164865 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  29.05 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  27.14 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  27.14 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  27.14 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  26.43 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  26.43 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0378  methyltransferase type 11  26.77 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  24.14 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  29.56 
 
 		 246 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1329  methyltransferase type 11  27.08 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  26.43 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  26.43 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 341 aa  53.5  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  30.66 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  26.06 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.85 
 
 		 234 aa  53.1  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.87 
 
 		 236 aa  53.1  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.85 
 
 		 243 aa  53.1  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.59 
 
 		 258 aa  53.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.83 
 
 		 238 aa  52.8  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  25.69 
 
 		 251 aa  52.4  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  25.71 
 
 		 249 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  30.21 
 
 		 235 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  29.93 
 
 		 259 aa  52.4  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0911  SAM-dependent methyltransferase  23.61 
 
 		 246 aa  52.4  0.000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000033737  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  28.08 
 
 		 269 aa  52  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0260  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 267 aa  52  0.000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00488037  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0079  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.71 
 
 		 253 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0762202 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  25.71 
 
 		 249 aa  52  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  26.62 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  32.29 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.79 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  28.07 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1306  Methyltransferase type 11  24.38 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0474  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.47 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3753  methyltransferase type 12  24.8 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  25.18 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  27.4 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  33.91 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  25.35 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9984  predicted protein  24.21 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0507609  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  28.06 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.21 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02124  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.47 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.369264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  28.38 
 
 		 269 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  28.38 
 
 		 269 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  28.38 
 
 		 269 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  28.38 
 
 		 269 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  25.38 
 
 		 298 aa  50.1  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1102  methyltransferase type 11  23.53 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0178  methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 265 aa  50.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  32 
 
 		 286 aa  50.1  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  21.46 
 
 		 312 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  28.38 
 
 		 269 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  28.3 
 
 		 268 aa  49.3  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0100  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.82 
 
 		 253 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  29.75 
 
 		 275 aa  49.7  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0515  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.76 
 
 		 254 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0440194 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2071  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.42 
 
 		 236 aa  49.3  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000425101  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  24.34 
 
 		 258 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1311  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.97 
 
 		 242 aa  48.9  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1638  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.72 
 
 		 235 aa  48.9  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0381  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.49 
 
 		 261 aa  48.9  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.111253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0134  Methyltransferase type 11  26.26 
 
 		 225 aa  48.9  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0559128  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2847  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.97 
 
 		 242 aa  48.9  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.170371  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  25.23 
 
 		 283 aa  48.9  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.97 
 
 		 242 aa  48.9  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.167435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0957  methyltransferase type 11  29.66 
 
 		 290 aa  48.9  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.29 
 
 		 234 aa  48.9  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  21.62 
 
 		 266 aa  48.9  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 243 aa  48.9  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2066  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.86 
 
 		 236 aa  48.9  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2061  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.42 
 
 		 236 aa  48.5  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000216259  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2288  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.42 
 
 		 236 aa  48.5  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434685  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2405  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.42 
 
 		 236 aa  48.5  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0031453  unclonable  0.0000107222 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 252 aa  48.5  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>