More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1140 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  77.75 
 
 		 397 aa  634    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1290  elongation factor Tu  87 
 
 		 400 aa  717    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000272484  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1140  elongation factor Tu  100 
 
 		 400 aa  814    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000019246  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0792  elongation factor Tu  81.75 
 
 		 399 aa  682    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.640379  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1396  elongation factor Tu  87 
 
 		 400 aa  717    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.147055  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  77.75 
 
 		 397 aa  634    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0951  elongation factor Tu  86 
 
 		 400 aa  716    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000082206  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  76.5 
 
 		 396 aa  627  1e-179  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  76.5 
 
 		 396 aa  627  1e-179  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  73.32 
 
 		 400 aa  624  1e-178  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1827  translation elongation factor Tu  72.32 
 
 		 400 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0713  translation elongation factor Tu  72.32 
 
 		 400 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0263  elongation factor Tu  74.26 
 
 		 405 aa  609  1e-173  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516793  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  72.5 
 
 		 396 aa  607  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  72.66 
 
 		 405 aa  610  1e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  72.66 
 
 		 405 aa  610  1e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0250  elongation factor Tu  74.26 
 
 		 405 aa  609  1e-173  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000581742  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  72.5 
 
 		 396 aa  607  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  72.82 
 
 		 400 aa  598  1e-170  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  72.82 
 
 		 400 aa  598  1e-170  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  71 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0207  elongation factor Tu  71.57 
 
 		 399 aa  595  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000266697  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0223  elongation factor Tu  71.57 
 
 		 400 aa  594  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.834398  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  71 
 
 		 397 aa  596  1e-169  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  71 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  71 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  71.75 
 
 		 397 aa  596  1e-169  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  71.75 
 
 		 397 aa  596  1e-169  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  71 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  72.07 
 
 		 400 aa  592  1e-168  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  70.75 
 
 		 397 aa  592  1e-168  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  72.57 
 
 		 400 aa  591  1e-168  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  72.57 
 
 		 400 aa  592  1e-168  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4028  elongation factor Tu  74.13 
 
 		 401 aa  588  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  hitchhiker  0.00000974612 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  70.75 
 
 		 395 aa  589  1e-167  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  70.57 
 
 		 400 aa  590  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  70.57 
 
 		 400 aa  590  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1856  elongation factor Tu  70 
 
 		 397 aa  587  1e-166  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000358768  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1479  elongation factor Tu  73.13 
 
 		 401 aa  586  1e-166  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.008881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0335  elongation factor Tu  70 
 
 		 397 aa  587  1e-166  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000334885  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0319  elongation factor Tu  70 
 
 		 397 aa  587  1e-166  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000467982  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1187  elongation factor Tu  73.13 
 
 		 401 aa  585  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.294431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3026  elongation factor Tu  73.13 
 
 		 401 aa  586  1e-166  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1870  elongation factor Tu  70 
 
 		 397 aa  587  1e-166  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000816391  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  70.75 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  70.75 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1553  elongation factor Tu  72.75 
 
 		 397 aa  580  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000482346  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2909  translation elongation factor Tu  71.39 
 
 		 405 aa  578  1e-164  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.124736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2690  translation elongation factor Tu  71.39 
 
 		 405 aa  578  1e-164  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000740208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1541  elongation factor Tu  72.75 
 
 		 397 aa  580  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.161942  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0118  elongation factor Tu  70.75 
 
 		 400 aa  575  1.0000000000000001e-163  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0332354  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  68.75 
 
 		 396 aa  574  1.0000000000000001e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  68.75 
 
 		 396 aa  574  1.0000000000000001e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  69.83 
 
 		 400 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4323  elongation factor Tu  73.38 
 
 		 401 aa  576  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0230065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4913  elongation factor Tu  70.75 
 
 		 400 aa  575  1.0000000000000001e-163  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00837266  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0309  translation elongation factor Tu  69 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000161177  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  69.92 
 
 		 400 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  68.75 
 
 		 396 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  68.25 
 
 		 396 aa  574  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  68.25 
 
 		 396 aa  574  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06090  elongation factor Tu  68 
 
 		 397 aa  575  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.878067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06230  elongation factor Tu  68 
 
 		 397 aa  575  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141067  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0321  translation elongation factor Tu  69 
 
 		 396 aa  576  1.0000000000000001e-163  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000705932  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  68.25 
 
 		 396 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  68.25 
 
 		 396 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  70.15 
 
 		 397 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  68 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  68 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  68 
 
 		 396 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  69.35 
 
 		 396 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  67.75 
 
 		 396 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  67.84 
 
 		 396 aa  571  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  70.32 
 
 		 396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  70.32 
 
 		 396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3323  elongation factor Tu  72.14 
 
 		 401 aa  571  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000360341  normal  0.122485 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2621  translation elongation factor Tu  70.42 
 
 		 405 aa  573  1.0000000000000001e-162  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  68.5 
 
 		 396 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1184  translation elongation factor Tu  70.42 
 
 		 405 aa  573  1.0000000000000001e-162  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000189456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  69.35 
 
 		 396 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  67.75 
 
 		 396 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0387  elongation factor Tu  67.5 
 
 		 395 aa  567  1e-161  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  68.75 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  68.75 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0706  elongation factor Tu  72.5 
 
 		 397 aa  570  1e-161  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000240692  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0695  elongation factor Tu  72.5 
 
 		 397 aa  570  1e-161  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000151586  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0320  elongation factor Tu  68.32 
 
 		 399 aa  570  1e-161  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.716365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  68.09 
 
 		 396 aa  569  1e-161  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  68.75 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  70.5 
 
 		 395 aa  568  1e-161  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  70.5 
 
 		 395 aa  568  1e-161  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  68.75 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  68.25 
 
 		 394 aa  568  1e-161  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0792  elongation factor Tu  69.95 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.476652  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1948  elongation factor Tu  68.34 
 
 		 395 aa  565  1e-160  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3923  elongation factor Tu  67.83 
 
 		 397 aa  566  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.375909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3911  elongation factor Tu  67.83 
 
 		 397 aa  566  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0156728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0318  elongation factor Tu  66.58 
 
 		 400 aa  566  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000823048  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08680  elongation factor Tu  67.25 
 
 		 397 aa  566  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000467002  hitchhiker  0.000980752 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08830  elongation factor Tu  67.25 
 
 		 397 aa  566  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0517061  normal  0.0282238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>