More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1137 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  100 
 
 
223 aa  452  1e-126  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  8.24266e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  76.92 
 
 
221 aa  348  4e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  1.11144e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  63.8 
 
 
221 aa  305  3e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1293  50S ribosomal protein L4  65.33 
 
 
235 aa  287  7e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  8.03665e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1393  50S ribosomal protein L4  65.33 
 
 
235 aa  287  7e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000162338  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  49.1 
 
 
207 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.23482e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  48.2 
 
 
207 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  47.75 
 
 
206 aa  197  8e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  6.85593e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  46.64 
 
 
209 aa  196  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  47.75 
 
 
206 aa  195  4e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  3.20704e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  45.95 
 
 
207 aa  195  5e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  45.95 
 
 
207 aa  195  5e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.63463e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  45.95 
 
 
207 aa  195  5e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  8.34057e-10  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  45.95 
 
 
207 aa  195  5e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  45.95 
 
 
207 aa  195  5e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  9.00585e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  45.95 
 
 
207 aa  195  5e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.04823e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  45.95 
 
 
207 aa  195  5e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  2.56275e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  45.95 
 
 
207 aa  195  5e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.36863e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  45.95 
 
 
207 aa  195  5e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  5.72324e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  45.95 
 
 
207 aa  195  5e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  6.90155e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  45.95 
 
 
207 aa  195  6e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  5.44936e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  45.95 
 
 
208 aa  193  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  8.79055e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  47.3 
 
 
206 aa  192  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  45.05 
 
 
207 aa  192  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  46.61 
 
 
207 aa  192  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  1.34967e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  46.61 
 
 
207 aa  192  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  9.811e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  44.59 
 
 
207 aa  190  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  8.47375e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  46.85 
 
 
208 aa  189  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  3.18286e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  44.59 
 
 
207 aa  186  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  46.15 
 
 
207 aa  186  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  44.29 
 
 
223 aa  185  6e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  44.59 
 
 
206 aa  185  6e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  3.05367e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  43.05 
 
 
208 aa  182  3e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  5.99505e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  44.14 
 
 
207 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.03712e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  42.99 
 
 
207 aa  180  2e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  4.75036e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  46.08 
 
 
214 aa  179  4e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  43.24 
 
 
207 aa  178  5e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  5.66858e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  45.05 
 
 
206 aa  177  8e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  2.54915e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3023  ribosomal protein L4/L1e  41.1 
 
 
222 aa  177  8e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443321  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  42.08 
 
 
209 aa  177  9e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  43.05 
 
 
209 aa  177  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  44.34 
 
 
207 aa  176  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  1.46284e-08 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0290  ribosomal protein L4/L1e  44.34 
 
 
208 aa  176  3e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00437959  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  42.34 
 
 
205 aa  174  1e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  4.72593e-05  unclonable  1.97161e-28 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  43.89 
 
 
208 aa  173  2e-42  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  6.04234e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  42.34 
 
 
207 aa  172  4e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  43.24 
 
 
207 aa  171  6e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  43.5 
 
 
212 aa  171  7e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  43.44 
 
 
208 aa  170  2e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4025  ribosomal protein L4/L1e  42.99 
 
 
221 aa  169  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  7.17748e-06 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  42.99 
 
 
206 aa  169  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.69503e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1184  ribosomal protein L4/L1e  44.02 
 
 
223 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  43.24 
 
 
204 aa  166  3e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  43.24 
 
 
204 aa  166  3e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  40.54 
 
 
207 aa  164  1e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  43.56 
 
 
210 aa  164  1e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  39.19 
 
 
207 aa  161  7e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  9.84788e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  40.37 
 
 
207 aa  161  8e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  42.79 
 
 
207 aa  160  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  4.03747e-05  hitchhiker  2.67396e-11 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  39.64 
 
 
208 aa  160  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  3.6372e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  42.08 
 
 
207 aa  160  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  7.91532e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1148  50S ribosomal protein L4  40.54 
 
 
209 aa  160  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  6.71055e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  40.44 
 
 
211 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0248  50S ribosomal protein L4  40.44 
 
 
211 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.890563  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1160  ribosomal protein L4/L1e  36.94 
 
 
208 aa  160  2e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  7.38717e-07  hitchhiker  5.90673e-07 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2773  50S ribosomal protein L4  39.82 
 
 
206 aa  159  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0187174  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  40.09 
 
 
207 aa  159  3e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  3.35339e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3994  ribosomal protein L4/L1e  42.48 
 
 
212 aa  159  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  42.22 
 
 
210 aa  158  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  39.37 
 
 
207 aa  158  8e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  41.18 
 
 
206 aa  157  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  1.29639e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  39.37 
 
 
206 aa  157  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  3.84651e-12  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0681  50S ribosomal protein L4  37.22 
 
 
207 aa  157  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.486374  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  39.37 
 
 
206 aa  156  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0848  50S ribosomal protein L4P  38.74 
 
 
207 aa  156  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  3.92239e-05  decreased coverage  1.22182e-05 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2645  50S ribosomal protein L4  41.59 
 
 
222 aa  154  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264538  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  42.34 
 
 
207 aa  154  1e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  4.5126e-06  hitchhiker  1.48432e-09 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  38.18 
 
 
208 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0627  50S ribosomal protein L4  38.46 
 
 
220 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  5.30014e-06  hitchhiker  3.1805e-13 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05720  50S ribosomal protein L4  40.27 
 
 
208 aa  152  4e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.316206  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  39.37 
 
 
206 aa  152  5e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  39.46 
 
 
210 aa  151  6e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0603  ribosomal protein L4/L1e  38.29 
 
 
209 aa  151  6e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2228  50S ribosomal protein L4  37.73 
 
 
208 aa  151  7e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.69782e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1306  50S ribosomal protein L4  42.79 
 
 
219 aa  151  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265076  normal  0.163333 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0692  50S ribosomal protein L4  41.7 
 
 
210 aa  151  8e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000477042  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2856  50S ribosomal protein L4  40.72 
 
 
207 aa  151  8e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400345  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2063  50S ribosomal protein L4  38.01 
 
 
208 aa  150  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  3.40203e-05  normal  0.385687 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5125  ribosomal protein L4/L1e  41.31 
 
 
223 aa  149  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2019  50S ribosomal protein L4  38.84 
 
 
206 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1068  50S ribosomal protein L4  38.46 
 
 
207 aa  149  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.51414e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0628  ribosomal protein L4/L1e  40.85 
 
 
232 aa  149  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1837  ribosomal protein L4/L1e  39.27 
 
 
215 aa  149  4e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00300997  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1417  ribosomal protein L4/L1e  35.45 
 
 
211 aa  148  6e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.977567  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1912  50S ribosomal protein L4  39.19 
 
 
206 aa  148  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.224726 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0396  50S ribosomal protein L4  39.19 
 
 
209 aa  147  1e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1031  50S ribosomal protein L4  41.29 
 
 
219 aa  147  1e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1014  50S ribosomal protein L4  41.29 
 
 
219 aa  147  1e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2295  50S ribosomal protein L4  40 
 
 
208 aa  147  1e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0333756  hitchhiker  0.00351228 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0080  50S ribosomal protein L4  40.27 
 
 
206 aa  147  1e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.186923 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>