More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1134 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1134  30S ribosomal protein S19  100 
 
 		 95 aa  192  1e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000887938  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0957  30S ribosomal protein S19  86.32 
 
 		 95 aa  174  4e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000875114  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1296  30S ribosomal protein S19  82.35 
 
 		 95 aa  152  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1390  30S ribosomal protein S19  82.35 
 
 		 95 aa  152  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000262881  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0786  30S ribosomal protein S19  75.79 
 
 		 97 aa  151  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.314347  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0985  30S ribosomal protein S19  74.47 
 
 		 94 aa  143  6e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0719  ribosomal protein S19  65.96 
 
 		 94 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0871  30S ribosomal protein S19  74.12 
 
 		 93 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000215821  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1520  30S ribosomal protein S19  72.29 
 
 		 94 aa  133  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.914288  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0219  ribosomal protein S19  67.42 
 
 		 94 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075195  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1741  30S ribosomal protein S19  64.89 
 
 		 94 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745132  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2907  30S ribosomal protein S19  65.96 
 
 		 94 aa  131  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.761008  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01210  ribosomal protein S19  72.29 
 
 		 94 aa  130  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.441353  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2174  ribosomal protein S19  65.56 
 
 		 91 aa  130  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.765738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0115  30S ribosomal protein S19  68.54 
 
 		 92 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000709655  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1180  ribosomal protein S19  63.95 
 
 		 93 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119264  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09960  SSU ribosomal protein S19P  68.6 
 
 		 86 aa  130  7.999999999999999e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.328032  hitchhiker  0.00000140006 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1230  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 		 96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000825354 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1181  30S ribosomal protein S19  64.21 
 
 		 95 aa  129  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538373 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3020  30S ribosomal protein S19  65.26 
 
 		 95 aa  127  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00609436  hitchhiker  0.00770845 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2329  ribosomal protein S19  60.64 
 
 		 94 aa  128  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000239943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0111  30S ribosomal protein S19  67.42 
 
 		 92 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3707  30S ribosomal protein S19  67.03 
 
 		 92 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2710  30S ribosomal protein S19  69.88 
 
 		 93 aa  127  6e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2395  30S ribosomal protein S19  69.88 
 
 		 93 aa  127  6e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2228  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 		 91 aa  127  7.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2903  ribosomal protein S19  65.26 
 
 		 94 aa  127  7.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4022  30S ribosomal protein S19  63.16 
 
 		 95 aa  127  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717988  hitchhiker  0.00000485262 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  67.78 
 
 		 92 aa  126  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0248  30S ribosomal protein S19  67.78 
 
 		 92 aa  126  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23430  SSU ribosomal protein S19P  66.67 
 
 		 85 aa  126  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000187491  hitchhiker  0.0000000975507 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1157  ribosomal protein S19  67.44 
 
 		 86 aa  126  1.0000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000321544  hitchhiker  0.000000515171 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2456  30S ribosomal protein S19  63.83 
 
 		 94 aa  126  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0781906 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04020  SSU ribosomal protein S19P  65.17 
 
 		 93 aa  125  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.904114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6610  ribosomal protein S19  64.04 
 
 		 93 aa  125  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0290  ribosomal protein S19  59.57 
 
 		 94 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00533936  normal  0.0406093 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0108  30S ribosomal protein S19  64.04 
 
 		 92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000257453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0114  30S ribosomal protein S19  62.92 
 
 		 92 aa  124  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0114  30S ribosomal protein S19  62.92 
 
 		 92 aa  124  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000383993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0110  30S ribosomal protein S19  62.92 
 
 		 92 aa  124  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.16547e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0108  30S ribosomal protein S19  62.92 
 
 		 92 aa  124  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000559577  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0126  30S ribosomal protein S19  62.92 
 
 		 92 aa  124  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1296  30S ribosomal protein S19  65.48 
 
 		 92 aa  124  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00413729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2615  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 		 92 aa  124  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00302204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0114  30S ribosomal protein S19  62.92 
 
 		 92 aa  124  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000118397  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0145  30S ribosomal protein S19  62.92 
 
 		 92 aa  124  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000029175  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  63.16 
 
 		 95 aa  124  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1570  ribosomal protein S19  65.17 
 
 		 95 aa  124  5e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000162931  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0762  30S ribosomal protein S19  67.86 
 
 		 93 aa  124  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000324039  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0846  ribosomal protein S19  65.22 
 
 		 94 aa  123  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0198  SSU ribosomal protein S19P  58.51 
 
 		 94 aa  123  9e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0174859  normal  0.0509464 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4311  30S ribosomal protein S19  61.8 
 
 		 93 aa  122  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3919  30S ribosomal protein S19  61.8 
 
 		 93 aa  122  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2151  SSU ribosomal protein S19P  61.96 
 
 		 93 aa  122  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.152821  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0193  hypothetical protein  65.56 
 
 		 91 aa  122  1e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.305188 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0229  30S ribosomal protein S19  56.38 
 
 		 94 aa  122  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3663  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 		 92 aa  122  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230775  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0402  ribosomal protein S19  62.79 
 
 		 93 aa  122  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  66.67 
 
 		 93 aa  122  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2292  30S ribosomal protein S19  62.64 
 
 		 98 aa  121  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00274383  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 		 91 aa  121  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0323  30S ribosomal protein S19  65.93 
 
 		 91 aa  120  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000170652  unclonable  0.0000000367695 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0426  30S ribosomal protein S19  58.24 
 
 		 93 aa  120  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0022508  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6045  30S ribosomal protein S19  59.14 
 
 		 93 aa  120  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.852276  normal  0.340402 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2225  30S ribosomal protein S19  62.64 
 
 		 98 aa  120  8e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000482989  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3293  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 		 91 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000043477  hitchhiker  0.00000613779 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0695  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 		 92 aa  119  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0586  30S ribosomal protein S19  60.67 
 
 		 93 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2946  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 		 91 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0382693  decreased coverage  0.000000116532 
 
 
-
 
NC_002950  PG1934  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0287  30S ribosomal protein S19  68.67 
 
 		 99 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0589679  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4503  ribosomal protein S19  58.06 
 
 		 93 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5128  ribosomal protein S19  61.8 
 
 		 92 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2419  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 		 98 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000264449  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5783  ribosomal protein S19  62.92 
 
 		 92 aa  119  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1928  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 		 91 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000295141  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3742  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 		 91 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000490611  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0280  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 		 91 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442981  normal  0.0699946 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2836  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 		 91 aa  118  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000453521  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3640  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 		 91 aa  118  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000927803  hitchhiker  0.0000000000150693 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2628  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 		 91 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00158971  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3772  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 		 91 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000265315  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3754  ribosomal protein S19  59.55 
 
 		 93 aa  118  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396407  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3451  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 		 91 aa  118  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000490482  decreased coverage  0.00387887 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0185  30S ribosomal protein S19  60.44 
 
 		 98 aa  118  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000106246  normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1847  30S ribosomal protein S19  59.34 
 
 		 98 aa  118  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.23074  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3064  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 		 91 aa  118  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000207611  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0331  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 		 91 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000218247  normal  0.0337389 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3165  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 		 91 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403295  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0318  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 		 91 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000548079  decreased coverage  0.00231518 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3800  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 		 91 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238183  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2755  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 		 91 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000407777  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1344  ribosomal protein S19  57.78 
 
 		 90 aa  118  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0253  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 		 91 aa  118  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000113028  normal  0.0178687 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0271  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 		 91 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00149939  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1127  ribosomal protein S19  58.06 
 
 		 93 aa  118  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.831563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3431  ribosomal protein S19  58.7 
 
 		 93 aa  118  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0352  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 		 91 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000694495  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3482  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 		 91 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000804319  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0310  30S ribosomal protein S19  60.22 
 
 		 93 aa  118  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>