More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1118 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1118  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 
428 aa  848    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.348488  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0973  preprotein translocase subunit SecY  76.64 
 
 
428 aa  685    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1374  preprotein translocase subunit SecY  65.28 
 
 
431 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0289241  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1312  preprotein translocase subunit SecY  65.51 
 
 
431 aa  571  1e-161  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000457849  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0770  preprotein translocase subunit SecY  61.31 
 
 
426 aa  485  1e-136  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  48.95 
 
 
420 aa  408  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  48.25 
 
 
418 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  46.99 
 
 
419 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  48.38 
 
 
421 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  46.26 
 
 
424 aa  385  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  47.24 
 
 
421 aa  378  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  45.09 
 
 
419 aa  372  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  46.42 
 
 
419 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  43.42 
 
 
429 aa  369  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  46.3 
 
 
447 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  46.3 
 
 
447 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  44.72 
 
 
429 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  42.14 
 
 
435 aa  365  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  48.42 
 
 
435 aa  364  1e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01360  preprotein translocase, SecY subunit  44.86 
 
 
422 aa  362  5.0000000000000005e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000700723  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  42.76 
 
 
437 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  43.88 
 
 
445 aa  362  7.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  41 
 
 
435 aa  360  3e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  45.83 
 
 
447 aa  360  4e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  43.82 
 
 
448 aa  358  7e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  41 
 
 
435 aa  358  9e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  42.09 
 
 
446 aa  357  2.9999999999999997e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  42.23 
 
 
446 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  40.91 
 
 
435 aa  356  5e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  41.69 
 
 
435 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  41.14 
 
 
435 aa  354  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  43.32 
 
 
442 aa  353  2.9999999999999997e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  41.72 
 
 
443 aa  352  8.999999999999999e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0214  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  44.16 
 
 
419 aa  349  5e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.32801  normal  0.494063 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  40.26 
 
 
463 aa  349  6e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  41.78 
 
 
436 aa  348  8e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1450  preprotein translocase subunit SecY  41.63 
 
 
446 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337945  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  42.26 
 
 
446 aa  347  3e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1352  preprotein translocase subunit SecY  43.39 
 
 
446 aa  347  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0023208  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  41.44 
 
 
436 aa  346  4e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  41.01 
 
 
437 aa  346  5e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  42.26 
 
 
446 aa  346  6e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2668  preprotein translocase subunit SecY  42.07 
 
 
447 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  42.26 
 
 
446 aa  345  1e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  44.39 
 
 
430 aa  343  2e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  41.11 
 
 
432 aa  343  4e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  40.93 
 
 
443 aa  342  5e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2599  preprotein translocase subunit SecY  44.12 
 
 
440 aa  342  5.999999999999999e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0785292  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  40.7 
 
 
443 aa  342  5.999999999999999e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  41.93 
 
 
446 aa  342  5.999999999999999e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  42.01 
 
 
435 aa  341  1e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  39.39 
 
 
444 aa  341  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1165  preprotein translocase, SecY subunit  42.01 
 
 
450 aa  340  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000330141  normal  0.11389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1106  protein translocase subunit SecY/sec61 alpha  40.81 
 
 
438 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  40.72 
 
 
443 aa  340  4e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  43.16 
 
 
428 aa  340  4e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  41.26 
 
 
444 aa  339  5e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000420552 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2144  preprotein translocase, SecY subunit  42.59 
 
 
447 aa  339  7e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2633  preprotein translocase, SecY subunit  40.77 
 
 
431 aa  339  7e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4006  preprotein translocase, SecY subunit  41.19 
 
 
450 aa  338  8e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000605815  hitchhiker  0.000026914 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  42.19 
 
 
448 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  41.49 
 
 
448 aa  338  9.999999999999999e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  42.37 
 
 
431 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2459  preprotein translocase, SecY subunit  42.03 
 
 
447 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  40.41 
 
 
443 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  40.41 
 
 
443 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2181  preprotein translocase, SecY subunit  42.03 
 
 
447 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  40.91 
 
 
435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  41.82 
 
 
442 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  41.04 
 
 
437 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  40.27 
 
 
443 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000211329  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  41.03 
 
 
448 aa  336  3.9999999999999995e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  41.49 
 
 
437 aa  336  5e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  39.16 
 
 
443 aa  335  7e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  41.19 
 
 
438 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2887  preprotein translocase, SecY subunit  41.27 
 
 
441 aa  335  9e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0626195  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  39.27 
 
 
437 aa  335  1e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  40.77 
 
 
437 aa  335  1e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1634  preprotein translocase subunit SecY  40.83 
 
 
452 aa  334  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0116955  normal  0.0410443 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  40.36 
 
 
441 aa  334  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000725785  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  40.84 
 
 
445 aa  333  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  39.91 
 
 
443 aa  333  3e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2044  preprotein translocase subunit SecY  41.5 
 
 
441 aa  332  6e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113194  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  41.59 
 
 
423 aa  332  7.000000000000001e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1658  preprotein translocase subunit SecY  42.82 
 
 
446 aa  332  7.000000000000001e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.398859  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0647  preprotein translocase, SecY subunit  40.87 
 
 
432 aa  332  9e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  40.37 
 
 
453 aa  331  1e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  38.69 
 
 
443 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3164  preprotein translocase subunit SecY  39.16 
 
 
443 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0194839  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2403  preprotein translocase subunit SecY  40.14 
 
 
443 aa  332  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0193161  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0780  preprotein translocase subunit SecY  41.76 
 
 
457 aa  332  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  40.94 
 
 
440 aa  331  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  38.8 
 
 
429 aa  331  2e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3428  preprotein translocase subunit SecY  40.23 
 
 
443 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452831  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  41.61 
 
 
445 aa  331  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  39.77 
 
 
442 aa  331  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5144  preprotein translocase, SecY subunit  39.23 
 
 
437 aa  331  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.552257 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  39.77 
 
 
442 aa  331  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.224184 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1374  preprotein translocase, SecY subunit  40.32 
 
 
444 aa  330  3e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285774  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  39.95 
 
 
430 aa  330  3e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.175346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>