More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1112 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1112  30S ribosomal protein S11  100 
 
 
130 aa  263  5e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  1.69024e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1368  30S ribosomal protein S11  72.31 
 
 
130 aa  203  7e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  6.07304e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1318  30S ribosomal protein S11  72.31 
 
 
130 aa  203  7e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  5.13052e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0979  30S ribosomal protein S11  74.22 
 
 
129 aa  203  8e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0952453  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  62.9 
 
 
131 aa  171  3e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0291  30S ribosomal protein S11  64.12 
 
 
130 aa  167  4e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  6.93018e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1157  ribosomal protein S11  63.85 
 
 
130 aa  164  4e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000562813  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1006  30S ribosomal protein S11  65.65 
 
 
131 aa  162  2e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  1.09839e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  55.38 
 
 
129 aa  162  2e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  55.38 
 
 
129 aa  162  2e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1498  30S ribosomal protein S11  63.49 
 
 
128 aa  162  2e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2685  30S ribosomal protein S11  66.4 
 
 
138 aa  161  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000312441  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  55.38 
 
 
129 aa  161  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  59.65 
 
 
131 aa  160  6e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1434  30S ribosomal protein S11  64.84 
 
 
137 aa  160  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1116  ribosomal protein S11  63.49 
 
 
134 aa  160  8e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625499  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4972  30S ribosomal protein S11  64.84 
 
 
136 aa  159  8e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0608  30S ribosomal protein S11  63.57 
 
 
134 aa  159  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  59.35 
 
 
128 aa  159  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  7.06792e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0764  ribosomal protein S11  58.59 
 
 
129 aa  158  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2619  30S ribosomal protein S11  64.57 
 
 
134 aa  158  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  59.65 
 
 
131 aa  158  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1111  30S ribosomal protein S11  64.57 
 
 
138 aa  157  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1128  30S ribosomal protein S11  64.57 
 
 
138 aa  157  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469294  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1140  30S ribosomal protein S11  64.57 
 
 
138 aa  157  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3384  30S ribosomal protein S11  64.34 
 
 
137 aa  157  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5151  30S ribosomal protein S11  64.29 
 
 
134 aa  156  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.589824 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0312  30S ribosomal protein S11  63.49 
 
 
129 aa  156  9e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.830269  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4292  ribosomal protein S11  62.7 
 
 
133 aa  156  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  55.28 
 
 
129 aa  156  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0893  30S ribosomal protein S11  63.49 
 
 
130 aa  156  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  4.94342e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4481  30S ribosomal protein S11  65.04 
 
 
135 aa  155  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.401787  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  54.62 
 
 
129 aa  155  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  60.53 
 
 
131 aa  156  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  4.56607e-06 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3897  30S ribosomal protein S11  64.23 
 
 
135 aa  155  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  54.62 
 
 
129 aa  155  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4288  30S ribosomal protein S11  64.23 
 
 
135 aa  155  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000331944 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0251  ribosomal protein S11  61.9 
 
 
128 aa  155  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  1.18892e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3671  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 
135 aa  154  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6024  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 
134 aa  154  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0332  30S ribosomal protein S11  61.9 
 
 
135 aa  154  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.147865  hitchhiker  0.000897065 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  57.89 
 
 
130 aa  154  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3877  30S ribosomal protein S11  61.24 
 
 
135 aa  154  5e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04250  SSU ribosomal protein S11P  63.2 
 
 
135 aa  154  5e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.333159  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  56.2 
 
 
131 aa  153  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  2.83991e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0591  30S ribosomal protein S11  65.79 
 
 
136 aa  154  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.648378  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0172  30S ribosomal protein S11  55.81 
 
 
130 aa  153  8e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.183798 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0714  30S ribosomal protein S11  64.29 
 
 
135 aa  153  8e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.119408 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  53.08 
 
 
129 aa  153  9e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0276  30S ribosomal protein S11  61.24 
 
 
132 aa  152  1e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  52.67 
 
 
131 aa  152  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  9.18972e-09  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1215  30S ribosomal protein S11  63.78 
 
 
132 aa  152  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0134437 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0448  30S ribosomal protein S11  61.11 
 
 
129 aa  153  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0770716  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01430  SSU ribosomal protein S11P  62.9 
 
 
132 aa  152  1e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.42719  normal  0.725515 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  53.85 
 
 
129 aa  152  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0962  ribosomal protein S11  62.02 
 
 
136 aa  152  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.837228 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13496  30S ribosomal protein S11  62.5 
 
 
139 aa  152  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.2344e-17  normal  0.330141 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  52.31 
 
 
130 aa  152  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001719  SSU ribosomal protein S11p (S14e)  54.62 
 
 
129 aa  152  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.59501e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2151  30S ribosomal protein S11  54.62 
 
 
129 aa  152  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  5.7735e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00752  30S ribosomal protein S11  54.62 
 
 
129 aa  152  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29470  SSU ribosomal protein S11P  65.87 
 
 
135 aa  152  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.0093892  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2204  30S ribosomal protein S11  53.6 
 
 
127 aa  152  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  7.33078e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4001  30S ribosomal protein S11  57.89 
 
 
138 aa  152  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000341479  hitchhiker  0.000619325 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0612  ribosomal protein S11  64.29 
 
 
135 aa  151  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0624  30S ribosomal protein S11  58.06 
 
 
129 aa  152  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000665656  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0481  30S ribosomal protein S11  55.73 
 
 
130 aa  151  3e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0241  30S ribosomal protein S11  62.7 
 
 
129 aa  151  3e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  53.08 
 
 
129 aa  151  3e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2806  ribosomal protein S11  63.71 
 
 
132 aa  151  3e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  3.65846e-09  decreased coverage  4.90593e-09 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  52.31 
 
 
130 aa  151  3e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1170  ribosomal protein S11  64.23 
 
 
136 aa  151  3e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  53.08 
 
 
129 aa  151  3e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  53.08 
 
 
129 aa  151  3e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  57.89 
 
 
137 aa  151  3e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  1.18735e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0131  30S ribosomal protein S11  59.23 
 
 
129 aa  151  3e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  1.08519e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6585  30S ribosomal protein S11  65.79 
 
 
135 aa  151  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.713261  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1549  ribosomal protein S11  60.61 
 
 
131 aa  150  4e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  53.08 
 
 
129 aa  150  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17441  30S ribosomal protein S11  61.9 
 
 
130 aa  150  4e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.809321  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  52.31 
 
 
129 aa  150  4e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0278  30S ribosomal protein S11  55.65 
 
 
129 aa  151  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  0.618273 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1012  30S ribosomal protein S11  53.85 
 
 
130 aa  151  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00012191  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0444  30S ribosomal protein S11  56.15 
 
 
128 aa  150  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.535193  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2656  30S ribosomal protein S11  64.29 
 
 
133 aa  150  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17281  30S ribosomal protein S11  61.9 
 
 
130 aa  150  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2941  30S ribosomal protein S11  64.29 
 
 
133 aa  150  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113794  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2210  30S ribosomal protein S11  58.46 
 
 
130 aa  150  6e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0424  ribosomal protein S11  57.39 
 
 
132 aa  150  6e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2271  30S ribosomal protein S11  52 
 
 
127 aa  150  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0715573  hitchhiker  0.00306589 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1160  30S ribosomal protein S11  59.35 
 
 
139 aa  150  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  2.71221e-05  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2306  30S ribosomal protein S11  62.31 
 
 
130 aa  150  7e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00552164  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0342  30S ribosomal protein S11  54.62 
 
 
129 aa  149  8e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00110784  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1629  30S ribosomal protein S11  61.11 
 
 
130 aa  150  8e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2301  30S ribosomal protein S11  54.03 
 
 
129 aa  149  8e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.598814  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  53.08 
 
 
129 aa  150  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2999  30S ribosomal protein S11  60.98 
 
 
137 aa  149  9e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00737948 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1315  ribosomal protein S11  60.32 
 
 
132 aa  149  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.515443  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  51.54 
 
 
129 aa  149  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3138  30S ribosomal protein S11  58.56 
 
 
135 aa  149  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0205896  normal  0.555314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>