More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1090 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1090  ABC transporter related  100 
 
 
259 aa  522  1e-147  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1310  ABC transporter related  48.03 
 
 
254 aa  258  6e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0846  ABC transporter related  38.8 
 
 
256 aa  202  4e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0869  ABC transporter related  38.8 
 
 
256 aa  202  4e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  38.52 
 
 
260 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  35.39 
 
 
490 aa  189  5e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5102  ABC transporter  34.36 
 
 
259 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0040  ABC transporter related  39.37 
 
 
256 aa  186  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.134157  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  33.33 
 
 
419 aa  185  5e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  31.6 
 
 
414 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  34.75 
 
 
266 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  33.74 
 
 
536 aa  181  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0867  ABC transporter related  32.28 
 
 
261 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1348  ABC transporter related  32.28 
 
 
261 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893482  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1330  ABC transporter related  32.28 
 
 
261 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5561  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.59 
 
 
259 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2210  protein of unknown function DUF105  37.25 
 
 
494 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.62 
 
 
253 aa  177  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  34.78 
 
 
490 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4490  ABC transporter, ATPase subunit  31.75 
 
 
265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0876356  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4566  ABC transporter related  32.27 
 
 
280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1829  ABC transporter related  35.42 
 
 
257 aa  172  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  31.76 
 
 
286 aa  172  6.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2061  ABC transporter related  33.06 
 
 
277 aa  171  9e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.948125 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2394  iron ABC transporter, ATP-binding protein  35.47 
 
 
290 aa  171  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2963  ABC transporter related  32.56 
 
 
293 aa  170  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  29.2 
 
 
424 aa  170  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  36.78 
 
 
409 aa  170  2e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  32.02 
 
 
263 aa  169  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1413  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  31.23 
 
 
295 aa  169  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3252  ABC transporter related  36 
 
 
259 aa  169  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000102185  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1172  iron ABC transporter, ATP-binding protein  35.32 
 
 
259 aa  169  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4240  ABC transporter related  32.43 
 
 
285 aa  169  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  32 
 
 
267 aa  169  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0593  ABC transporter-like  36.25 
 
 
262 aa  169  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835078  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  34.84 
 
 
261 aa  168  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  36.64 
 
 
268 aa  168  8e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  36.61 
 
 
262 aa  168  9e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0584  ABC transporter related protein  36.14 
 
 
259 aa  167  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2035  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  30.83 
 
 
263 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3192  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  30.83 
 
 
265 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1898  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  30.83 
 
 
265 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303699  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  30.8 
 
 
264 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0878  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  30.83 
 
 
265 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.382345  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2712  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  30.83 
 
 
265 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203934  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3153  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  30.83 
 
 
263 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  33.61 
 
 
268 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2164  ABC transporter related  32.27 
 
 
270 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1472  ABC transporter related  36.29 
 
 
280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.140058  normal  0.304695 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  35.86 
 
 
259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1448  ABC transporter related protein  31.47 
 
 
264 aa  166  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.425565  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.73 
 
 
264 aa  166  4e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0760  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.54 
 
 
271 aa  166  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  32.41 
 
 
424 aa  166  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3299  ABC transporter related  28.96 
 
 
265 aa  165  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1033  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.3 
 
 
285 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  32.53 
 
 
274 aa  165  5.9999999999999996e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0975  ABC transporter related  31.78 
 
 
297 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0997  ABC transporter related  31.78 
 
 
297 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1009  ABC transporter related  31.78 
 
 
297 aa  165  8e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  33.33 
 
 
384 aa  165  8e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3280  ABC transporter related  31.78 
 
 
326 aa  165  8e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3366  ABC transporter related  31.78 
 
 
297 aa  164  9e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.73 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  33.33 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  32.63 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1809  ABC transporter related  30.89 
 
 
274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  31.95 
 
 
266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  29.57 
 
 
290 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3182  ABC transporter related  31.4 
 
 
321 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0840  ABC transporter related  31.4 
 
 
321 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  32.54 
 
 
266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  35 
 
 
269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  29.5 
 
 
269 aa  162  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3914  ABC transporter related  35.34 
 
 
264 aa  161  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291945  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2731  ABC transporter related  30.24 
 
 
255 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0874  ABC transporter related  36.44 
 
 
269 aa  160  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26400  putative ATP-binding component of ABC transporter  32.8 
 
 
257 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.749781  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1543  enterochelin ABC transporter, ATP-binding protein  38.75 
 
 
251 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  32.41 
 
 
258 aa  160  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  34.69 
 
 
258 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1120  ABC transporter related  34.44 
 
 
260 aa  160  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000857475  hitchhiker  0.000000000136926 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  35.56 
 
 
262 aa  159  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0136  ABC transporter related  30.56 
 
 
272 aa  159  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3013  ABC transporter related  32.24 
 
 
259 aa  159  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1285  ABC transporter related  30.04 
 
 
255 aa  159  4e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0279038  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0404  ABC transporter related  32.66 
 
 
283 aa  159  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  31.35 
 
 
255 aa  159  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0712  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 
324 aa  159  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  27.78 
 
 
254 aa  159  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4828  ABC transporter related  34.78 
 
 
258 aa  159  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169592  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  30.31 
 
 
255 aa  158  7e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  30.31 
 
 
255 aa  158  7e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  30.31 
 
 
255 aa  158  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  31.23 
 
 
268 aa  158  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  30.31 
 
 
255 aa  158  7e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 
256 aa  158  8e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3382  ABC transporter related  32.54 
 
 
308 aa  158  9e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1762  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  35.39 
 
 
258 aa  158  9e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4222  ABC transporter related  30.31 
 
 
254 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>