84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1026 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1026  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
327 aa  662    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0667  metal dependent phosphohydrolase  53.05 
 
 
336 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0691  metal dependent phosphohydrolase  52.13 
 
 
344 aa  350  2e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000585513  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1025  metal dependent phosphohydrolase  53.15 
 
 
336 aa  348  9e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1645  metal dependent phosphohydrolase  41.12 
 
 
352 aa  226  5.0000000000000005e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2548  metal dependent phosphohydrolase  36.84 
 
 
386 aa  207  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98451e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2929  metal dependent phosphohydrolase  36.51 
 
 
366 aa  205  7e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.220477  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1122  HD domain-containing protein  36.3 
 
 
375 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1665  metal dependent phosphohydrolase  36.51 
 
 
388 aa  202  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0157  metal dependent phosphohydrolase  36.72 
 
 
348 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1796  metal dependent phosphohydrolase  36.79 
 
 
315 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000175278  normal  0.229909 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2675  metal dependent phosphohydrolase  35.2 
 
 
384 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.606537 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4294  metal dependent phosphohydrolase  34.82 
 
 
375 aa  197  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298288  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0086  metal dependent phosphohydrolase  36.34 
 
 
361 aa  190  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0147  metal dependent phosphohydrolase  35.53 
 
 
344 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0049  metal dependent phosphohydrolase  36.95 
 
 
371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2013  HD-superfamily hydrolase  36.45 
 
 
387 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000276986  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1164  metal dependent phosphohydrolase  34.75 
 
 
320 aa  181  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2404  HD-superfamily hydrolase  34.56 
 
 
321 aa  179  8e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0036501  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0158  metal dependent phosphohydrolase  36.59 
 
 
315 aa  178  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0129  metal dependent phosphohydrolase  31.48 
 
 
343 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2466  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  31.82 
 
 
328 aa  172  6.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0701415  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1091  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
347 aa  169  7e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal  0.443941 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0022  metal dependent phosphohydrolase  34.54 
 
 
361 aa  168  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0126816 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5784  metal dependent phosphohydrolase  32.89 
 
 
327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.825544 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1404  metal dependent phosphohydrolase  33.66 
 
 
343 aa  165  9e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248325  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2543  metal dependent phosphohydrolase  33 
 
 
531 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2639  metal dependent phosphohydrolase  32.67 
 
 
528 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130174  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0440  metal dependent phosphohydrolase  30.92 
 
 
377 aa  162  9e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000386707  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2339  metal dependent phosphohydrolase  34.3 
 
 
347 aa  159  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2446  metal dependent phosphohydrolase  30.67 
 
 
534 aa  159  9e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1988  metal dependent phosphohydrolase  33.22 
 
 
295 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.489678  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1317  metal dependent phosphohydrolase  31.35 
 
 
534 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0027  HD domain-containing protein  33.33 
 
 
323 aa  155  6e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0904  HD-superfamily hydrolase  33.56 
 
 
322 aa  152  5.9999999999999996e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0027  3'-5' exoribonuclease YhaM  32.7 
 
 
323 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.838244  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0317  metal dependent phosphohydrolase  30.74 
 
 
333 aa  147  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0636  3'-5' exoribonuclease YhaM  30.1 
 
 
324 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000053339  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0927  3'-5' exoribonuclease YhaM  30.1 
 
 
314 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.475944  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1452  3'-5' exoribonuclease YhaM  30.67 
 
 
376 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5827  metal dependent phosphohydrolase  30.07 
 
 
295 aa  142  8e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.163543  normal  0.236354 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3087  metal dependent phosphohydrolase  28.53 
 
 
330 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1378  3'-5' exoribonuclease YhaM  30.9 
 
 
313 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.280441  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0947  3'-5' exoribonuclease YhaM  29.77 
 
 
314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0716307  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1929  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.25 
 
 
313 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1895  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.25 
 
 
313 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.469436  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1012  3'-5' exoribonuclease YhaM  29.77 
 
 
314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4249  3'-5' exoribonuclease YhaM  29.77 
 
 
314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000074521 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1180  3'-5' exoribonuclease YhaM  29.77 
 
 
314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000316143  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1111  3'-5' exoribonuclease YhaM  29.77 
 
 
314 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189435  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0933  3'-5' exoribonuclease YhaM  29.77 
 
 
314 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0143521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0920  3'-5' exoribonuclease YhaM  29.77 
 
 
314 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0118856  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1052  3'-5' exoribonuclease YhaM  29.77 
 
 
314 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299092  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1087  3'-5' exoribonuclease YhaM  29.77 
 
 
314 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6154099999999997e-58 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0796  3'-5' exoribonuclease YhaM  29.45 
 
 
318 aa  138  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0730  HD-superfamily hydrolase  30.58 
 
 
316 aa  138  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl244  cmp-binding factor-1  32.7 
 
 
326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2193  HD-superfamily hydrolase  31.41 
 
 
314 aa  135  7.000000000000001e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1448  HD-superfamily hydrolase  29.13 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000046208  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1773  HD domain-containing protein  28.52 
 
 
313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0235466  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0847  metal dependent phosphohydrolase  32.73 
 
 
354 aa  126  4.0000000000000003e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.241634  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1766  HD-superfamily hydrolase  29.6 
 
 
313 aa  125  1e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00925857  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0473  hypothetical protein  28.37 
 
 
326 aa  120  3e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0450  metal dependent phosphohydrolase  30.42 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1871  metal dependent phosphohydrolase  28.43 
 
 
317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0913  hypothetical protein  30.16 
 
 
313 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1232  metal dependent phosphohydrolase  30.27 
 
 
228 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1243  metal dependent phosphohydrolase  33.56 
 
 
228 aa  79.3  0.00000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1443  metal dependent phosphohydrolase  28.96 
 
 
228 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.281894  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0933  metal dependent phosphohydrolase  30.93 
 
 
249 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0723  metal dependent phosphohydrolase  29.89 
 
 
228 aa  77  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2850  metal dependent phosphohydrolase  23.35 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1141  metal dependent phosphohydrolase  28.99 
 
 
320 aa  65.9  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00121912  hitchhiker  0.00000000000000887406 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0254  metal dependent phosphohydrolase  27.21 
 
 
320 aa  55.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00126604  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0222  metal dependent phosphohydrolase  26.23 
 
 
170 aa  50.4  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2967  putative metal dependent phosphohydrolase  34.38 
 
 
196 aa  46.6  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1808  hypothetical protein  36.49 
 
 
193 aa  46.2  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2021  metal dependent phosphohydrolase  25.93 
 
 
287 aa  46.2  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000315761  decreased coverage  0.0000000241246 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1363  metal dependent phosphohydrolase  34.26 
 
 
185 aa  46.2  0.0008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2991  metal dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 
201 aa  43.9  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0913946  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0067  hypothetical protein  27.5 
 
 
186 aa  43.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.250606  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3034  hypothetical protein  28.57 
 
 
575 aa  42.7  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.877854  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1325  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  29.2 
 
 
279 aa  42.7  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000284432  hitchhiker  0.00284923 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0615  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  30.36 
 
 
558 aa  42.7  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.22485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>