More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1020 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1020  glycine cleavage system protein H  100 
 
 
120 aa  236  1e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  8.91205e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1738  glycine cleavage system protein H  70 
 
 
122 aa  173  6e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  3.01495e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  65.57 
 
 
122 aa  163  6e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  64.75 
 
 
122 aa  161  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  56.78 
 
 
125 aa  141  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  48.33 
 
 
126 aa  131  4e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0244  glycine cleavage system H protein  57.52 
 
 
116 aa  130  8e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  51.67 
 
 
126 aa  129  1e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0116  glycine cleavage system protein H  53.91 
 
 
125 aa  128  2e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  53.72 
 
 
129 aa  128  2e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0131  glycine cleavage system protein H  53.91 
 
 
125 aa  128  2e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0390  glycine cleavage system H protein  51.67 
 
 
123 aa  127  4e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.927773 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3146  glycine cleavage system H protein  51.28 
 
 
124 aa  127  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.912262 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  51.69 
 
 
125 aa  127  8e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0396  glycine cleavage system H protein  50.83 
 
 
123 aa  126  9e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  53.72 
 
 
129 aa  126  9e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  53.72 
 
 
129 aa  126  9e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  53.72 
 
 
129 aa  126  9e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  53.72 
 
 
129 aa  126  9e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  53.72 
 
 
129 aa  126  9e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  53.72 
 
 
129 aa  126  9e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  53.72 
 
 
129 aa  126  9e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  53.72 
 
 
129 aa  126  9e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  53.72 
 
 
129 aa  126  9e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  53.72 
 
 
129 aa  126  9e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 
129 aa  126  9e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3527  glycine cleavage system protein H  49.15 
 
 
120 aa  126  9e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  53.72 
 
 
129 aa  126  9e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  53.72 
 
 
129 aa  126  9e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  53.72 
 
 
129 aa  126  9e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 
129 aa  125  1e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  53.72 
 
 
129 aa  126  1e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
120 aa  125  2e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1619  glycine cleavage system protein H  51.33 
 
 
121 aa  125  2e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  50.42 
 
 
126 aa  125  2e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  51.24 
 
 
129 aa  125  2e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2460  glycine cleavage system protein H  52.63 
 
 
126 aa  125  2e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  45.83 
 
 
127 aa  125  2e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0154  glycine cleavage system protein H  47.11 
 
 
131 aa  125  2e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.326161  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  47.9 
 
 
126 aa  125  2e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0680  glycine cleavage system protein H  50.86 
 
 
122 aa  124  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  51.75 
 
 
126 aa  125  3e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0030  glycine cleavage system H protein  55.93 
 
 
137 aa  124  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0338  glycine cleavage system H protein  50.85 
 
 
125 aa  124  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0357579  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0726  glycine cleavage system protein H  50.86 
 
 
122 aa  124  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1328  glycine cleavage system H protein  57.8 
 
 
126 aa  125  3e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3863  glycine cleavage system protein H  52.59 
 
 
122 aa  124  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394687  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  53.72 
 
 
129 aa  124  4e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  54.55 
 
 
129 aa  124  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0135  glycine cleavage system protein H  46.28 
 
 
131 aa  124  6e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 
129 aa  123  8e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 
129 aa  123  8e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 
129 aa  123  8e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  47.93 
 
 
129 aa  123  9e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  46.28 
 
 
130 aa  122  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2836  glycine cleavage system H protein  48.7 
 
 
120 aa  123  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  1.36421e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3300  glycine cleavage system H protein  50.86 
 
 
123 aa  122  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906564  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  51.28 
 
 
128 aa  123  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  42.37 
 
 
135 aa  122  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 
129 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00460  glycine dehydrogenase (decarboxylating), putative  47.93 
 
 
160 aa  122  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.528435  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  47.93 
 
 
129 aa  122  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1560  glycine cleavage system H protein  47.9 
 
 
124 aa  122  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0623  glycine cleavage system protein H  51.26 
 
 
130 aa  121  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1732  glycine cleavage system protein H  50.44 
 
 
121 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 
129 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3020  glycine cleavage system H protein  49.56 
 
 
124 aa  121  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.29213  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  51.69 
 
 
135 aa  121  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  47.9 
 
 
130 aa  121  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  48.74 
 
 
129 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  48.74 
 
 
129 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  48.74 
 
 
129 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 
129 aa  121  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0376  glycine cleavage system H protein  50.85 
 
 
124 aa  121  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0839  glycine cleavage system protein H  51.26 
 
 
130 aa  121  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0813  glycine cleavage system protein H  48.31 
 
 
120 aa  120  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.22287 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4327  glycine cleavage system H protein  47.9 
 
 
124 aa  120  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000233  glycine cleavage system H protein  52.07 
 
 
126 aa  120  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  47.9 
 
 
129 aa  120  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4386  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
121 aa  120  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3674  glycine cleavage system protein H  47.11 
 
 
129 aa  120  7e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  48.74 
 
 
122 aa  120  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  49.14 
 
 
126 aa  120  8e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  3.12809e-07  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  49.14 
 
 
126 aa  120  8e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  46.61 
 
 
128 aa  120  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  45.45 
 
 
130 aa  120  8e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  47.93 
 
 
126 aa  120  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1268  glycine cleavage system protein H  52.17 
 
 
128 aa  119  1e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21391  glycine cleavage system protein H  52.17 
 
 
128 aa  119  1e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  45.76 
 
 
128 aa  119  1e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  47.9 
 
 
130 aa  119  1e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  1.90356e-07 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  44.92 
 
 
127 aa  119  1e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  45.76 
 
 
128 aa  119  1e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  50 
 
 
136 aa  119  2e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2539  glycine cleavage system protein H  49.56 
 
 
129 aa  118  2e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  47.41 
 
 
127 aa  119  2e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  50.42 
 
 
126 aa  119  2e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  1.82392e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1432  glycine cleavage system protein H  47.06 
 
 
124 aa  119  2e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1937  glycine cleavage system H protein  47.06 
 
 
124 aa  119  2e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1285  glycine cleavage system protein H  48.67 
 
 
121 aa  118  2e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  0.169764 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>