More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1005 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1005  cell cycle protein  100 
 
 		 374 aa  736    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0721035  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0088  cell cycle protein  42.27 
 
 		 336 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000070241  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0635  cell cycle protein  45.15 
 
 		 354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0123937  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0088  cell cycle protein  40.94 
 
 		 336 aa  239  5e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  36.84 
 
 		 365 aa  206  6e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  32.22 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  36.57 
 
 		 376 aa  199  5e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  35.92 
 
 		 373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  31.2 
 
 		 364 aa  193  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  31.2 
 
 		 403 aa  194  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  35.88 
 
 		 379 aa  193  5e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  34 
 
 		 371 aa  193  5e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  35.73 
 
 		 368 aa  189  8e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 373 aa  189  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  32.67 
 
 		 369 aa  189  9e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 373 aa  189  9e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  33.52 
 
 		 366 aa  189  9e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  33.52 
 
 		 366 aa  188  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  35.93 
 
 		 371 aa  186  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  36.34 
 
 		 371 aa  186  6e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  32.69 
 
 		 374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  33.14 
 
 		 367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  34.01 
 
 		 369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  32.05 
 
 		 407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  33.71 
 
 		 366 aa  184  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  34.66 
 
 		 367 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  34.66 
 
 		 367 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  35.39 
 
 		 365 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0929  putative rod shape determining protein  35.87 
 
 		 380 aa  182  6e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  34.66 
 
 		 367 aa  182  6e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  34.57 
 
 		 368 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1368  cell cycle protein  34.97 
 
 		 368 aa  182  7e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  34.57 
 
 		 368 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  34.57 
 
 		 368 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  34.63 
 
 		 374 aa  182  9.000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  32.58 
 
 		 371 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  34.57 
 
 		 368 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1485  rod shape-determining protein RodA  35.33 
 
 		 380 aa  181  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.140754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  33.71 
 
 		 377 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2497  rod shape-determining protein RodA  33.05 
 
 		 373 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0956  rod shape-determining protein RodA  35.07 
 
 		 382 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215548  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  34.05 
 
 		 368 aa  180  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  32.01 
 
 		 363 aa  179  7e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  34.36 
 
 		 372 aa  179  8e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  33.99 
 
 		 366 aa  178  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  30.83 
 
 		 407 aa  178  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1009  rod shape-determining protein RodA  32.75 
 
 		 376 aa  178  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0420  cell cycle protein  32.8 
 
 		 408 aa  178  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000126174  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  32.87 
 
 		 366 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  35.13 
 
 		 366 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  34.69 
 
 		 373 aa  177  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  32.09 
 
 		 366 aa  177  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  33.83 
 
 		 423 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  34.56 
 
 		 372 aa  177  4e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3400  rod shape-determining protein RodA  34.45 
 
 		 384 aa  176  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293133  normal  0.487857 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04731  cell division protein FtsW  32.96 
 
 		 415 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  32.39 
 
 		 371 aa  176  5e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  30.81 
 
 		 372 aa  176  6e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04258  rod shape-determining protein RodA  30.16 
 
 		 372 aa  176  6e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.239433  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  32.41 
 
 		 378 aa  176  8e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  33.13 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  35.11 
 
 		 373 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  31.96 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  33.44 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  36.42 
 
 		 373 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1554  rod shape-determining protein RodA  33.73 
 
 		 357 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0173  rod shape-determining protein RodA  32.09 
 
 		 383 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1786  rod shape-determining protein RodA  32.51 
 
 		 380 aa  173  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  30.77 
 
 		 373 aa  173  5e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  30.59 
 
 		 388 aa  173  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5265  cell cycle protein  36.39 
 
 		 411 aa  173  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2816  cell cycle protein  30.85 
 
 		 374 aa  172  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1919  rod shape-determining protein RodA  35.19 
 
 		 360 aa  172  7.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.403487  hitchhiker  0.000000909205 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3450  rod shape-determining protein RodA  31.48 
 
 		 370 aa  172  7.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.921865 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0474  rod shape-determining protein RodA  34.2 
 
 		 378 aa  172  9e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268193  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  28.07 
 
 		 378 aa  172  9e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3647  rod shape-determining protein RodA  32.97 
 
 		 390 aa  172  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  32.19 
 
 		 366 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2957  rod shape-determining protein RodA  32.97 
 
 		 390 aa  172  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  32.7 
 
 		 370 aa  172  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1371  rod shape-determining protein RodA  32.48 
 
 		 373 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0444396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1106  cell cycle protein  34.2 
 
 		 371 aa  171  2e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.860681  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0846  rod shape-determining protein RodA  33.6 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0813507 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 368 aa  170  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  33.23 
 
 		 368 aa  171  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 368 aa  170  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  31.19 
 
 		 372 aa  170  4e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  33.33 
 
 		 382 aa  170  4e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  34.45 
 
 		 370 aa  169  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0568  rod shape-determining protein RodA  30.07 
 
 		 421 aa  169  8e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  31.74 
 
 		 426 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  32.43 
 
 		 370 aa  169  8e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0672  rod shape-determining protein  31.88 
 
 		 353 aa  169  9e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.722456  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  30.4 
 
 		 417 aa  168  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  31.42 
 
 		 413 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0591  rod shape-determining protein RodA  31.88 
 
 		 373 aa  168  1e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 380 aa  169  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  33.65 
 
 		 362 aa  167  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  31.96 
 
 		 374 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1127  cell cycle protein  30.23 
 
 		 399 aa  167  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>