More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0991 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0991  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
539 aa  1100    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1168  NADH dehydrogenase (quinone)  71.86 
 
 
538 aa  798    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.073062  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  68.93 
 
 
545 aa  759    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  68.93 
 
 
545 aa  761    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  54.82 
 
 
545 aa  590  1e-167  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  53.95 
 
 
602 aa  589  1e-167  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  52.23 
 
 
610 aa  582  1.0000000000000001e-165  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  52.43 
 
 
607 aa  579  1e-164  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  52.43 
 
 
607 aa  579  1e-164  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  50.28 
 
 
597 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  47.83 
 
 
614 aa  525  1e-147  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  50.75 
 
 
596 aa  521  1e-146  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  51.04 
 
 
596 aa  519  1e-146  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  50.38 
 
 
595 aa  515  1.0000000000000001e-145  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  48.58 
 
 
572 aa  514  1e-144  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  51.04 
 
 
597 aa  509  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  49.07 
 
 
594 aa  508  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  47.92 
 
 
614 aa  505  9.999999999999999e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01800  NADH dehydrogenase I subunit F  49.36 
 
 
624 aa  499  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.235185  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  49.44 
 
 
597 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  53.5 
 
 
598 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  46.6 
 
 
597 aa  491  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  50.8 
 
 
562 aa  491  1e-137  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2708  NADH dehydrogenase I, F subunit  53.27 
 
 
488 aa  485  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  49.22 
 
 
572 aa  485  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0724  NADH dehydrogenase (quinone)  55.79 
 
 
485 aa  483  1e-135  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  47.09 
 
 
597 aa  483  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  51.85 
 
 
596 aa  483  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  46.89 
 
 
677 aa  485  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2713  NADH dehydrogenase (quinone)  47.97 
 
 
552 aa  477  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  48.06 
 
 
626 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1887  NADH dehydrogenase (quinone)  46.6 
 
 
592 aa  470  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0472  NADH dehydrogenase (quinone)  44.26 
 
 
594 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.524488  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1701  NADH dehydrogenase (quinone)  45.32 
 
 
604 aa  466  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2304  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  45.49 
 
 
623 aa  465  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2721  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  43.45 
 
 
570 aa  462  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  48.57 
 
 
624 aa  464  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0657  NADH dehydrogenase (quinone)  51.64 
 
 
590 aa  462  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210561  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1018  NADH dehydrogenase (quinone)  53.68 
 
 
407 aa  462  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  44.34 
 
 
588 aa  460  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1248  NADH dehydrogenase (quinone)  44.94 
 
 
604 aa  461  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.600832  normal  0.0289049 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1604  NADP-reducing hydrogenase chain C  50.94 
 
 
486 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1828  NADH dehydrogenase (quinone)  53.19 
 
 
407 aa  459  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3505  NADH dehydrogenase (quinone)  45.2 
 
 
619 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.960223  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1634  NADP-reducing hydrogenase chain C  50.71 
 
 
486 aa  457  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000096005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1844  NADP-reducing hydrogenase chain C  50.71 
 
 
486 aa  457  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3516  NADH dehydrogenase (quinone)  51.54 
 
 
488 aa  456  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0429  NADH dehydrogenase (quinone)  44.65 
 
 
624 aa  455  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  46.72 
 
 
626 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3291  NADH dehydrogenase (quinone)  47.11 
 
 
575 aa  450  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  46.35 
 
 
626 aa  449  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1545  NADH dehydrogenase (quinone)  45.38 
 
 
668 aa  446  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1923  NADH dehydrogenase (quinone)  46.07 
 
 
539 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1718  NADH dehydrogenase (quinone)  48.5 
 
 
619 aa  446  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.081204  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  44.7 
 
 
636 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0343  NADH dehydrogenase I, F subunit  44.86 
 
 
591 aa  442  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  44.7 
 
 
636 aa  445  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1655  NADH dehydrogenase (quinone)  45.16 
 
 
627 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1110  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  46.51 
 
 
569 aa  444  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3350  NADH dehydrogenase I, F subunit  44.11 
 
 
591 aa  444  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.051471 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  46.72 
 
 
569 aa  445  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0864  hydrogenase subunit HymB, putative  44.91 
 
 
640 aa  439  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0491  NADH dehydrogenase (quinone)  46.21 
 
 
623 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1857  NADH dehydrogenase (quinone)  46.19 
 
 
600 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0226  NADH dehydrogenase (quinone)  48.46 
 
 
632 aa  441  9.999999999999999e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.096685  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1365  NADH dehydrogenase (quinone)  48.45 
 
 
532 aa  437  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529964  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3542  NADH dehydrogenase (quinone)  51.5 
 
 
537 aa  437  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0834  NADH dehydrogenase I, F subunit  46.33 
 
 
617 aa  436  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0332  NADH dehydrogenase (quinone)  43.8 
 
 
629 aa  436  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1024  NADH dehydrogenase (quinone)  52.7 
 
 
407 aa  438  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0109  NADH dehydrogenase (quinone)  43.07 
 
 
656 aa  437  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.79 
 
 
421 aa  432  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0532  NADH dehydrogenase (quinone)  47.57 
 
 
620 aa  433  1e-120  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0280377  normal  0.055647 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3133  NADH dehydrogenase (quinone)  44.09 
 
 
590 aa  432  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.846536  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4654  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  49.41 
 
 
535 aa  429  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4005  NADH dehydrogenase (quinone)  42.43 
 
 
593 aa  429  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42089e-25 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4239  NADH dehydrogenase (quinone)  43.18 
 
 
593 aa  430  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0098  NADH dehydrogenase (quinone)  45.96 
 
 
535 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0095  NADH dehydrogenase (quinone)  45.83 
 
 
535 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.693174 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0166  NADH dehydrogenase (quinone)  53.05 
 
 
612 aa  429  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0914  NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit  51.31 
 
 
571 aa  426  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3921  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  42.51 
 
 
593 aa  426  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0661  NADH dehydrogenase (quinone)  43.21 
 
 
623 aa  428  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.435318  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0729  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  43.4 
 
 
623 aa  425  1e-117  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  49.41 
 
 
634 aa  424  1e-117  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0860011  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_635  [Fe] hydrogenase, HymB subunit  43.4 
 
 
626 aa  423  1e-117  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2080  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  42.44 
 
 
635 aa  425  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310665  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1086  NADH dehydrogenase (quinone)  47.1 
 
 
526 aa  423  1e-117  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_767  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit E subfamily  43.45 
 
 
641 aa  422  1e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0782  NADH dehydrogenase (quinone)  44.15 
 
 
640 aa  421  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  46.28 
 
 
603 aa  421  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2794  NADH dehydrogenase (quinone)  45.03 
 
 
572 aa  419  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0225  NADH dehydrogenase (quinone)  50.36 
 
 
417 aa  417  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_154  [Fe] hydrogenase, HymB subunit  50.36 
 
 
417 aa  415  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24670  NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit  42.88 
 
 
597 aa  417  9.999999999999999e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0146  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  49.88 
 
 
417 aa  412  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.28536  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  42.59 
 
 
562 aa  412  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4112  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  49.16 
 
 
656 aa  412  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483313  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4166  NADH dehydrogenase (quinone)  44.73 
 
 
530 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1539  NADH dehydrogenase (quinone)  40.53 
 
 
580 aa  410  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>