More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0982 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 353 aa  724    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  51.85 
 
 		 343 aa  370  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  48.56 
 
 		 349 aa  290  2e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  48.88 
 
 		 349 aa  290  2e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  39.32 
 
 		 345 aa  210  3e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  35.96 
 
 		 360 aa  188  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  37.34 
 
 		 348 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  35.35 
 
 		 339 aa  175  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  36.75 
 
 		 363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  33.87 
 
 		 353 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  34.86 
 
 		 336 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  31.31 
 
 		 350 aa  158  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  32.36 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  34.19 
 
 		 339 aa  150  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  33.45 
 
 		 331 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  31 
 
 		 380 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0009  ApbE-like lipoprotein  33.23 
 
 		 346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109653  normal  0.0510654 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  34.38 
 
 		 338 aa  145  9e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  30.95 
 
 		 371 aa  145  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  32.53 
 
 		 386 aa  142  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.02 
 
 		 336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  32.08 
 
 		 346 aa  139  6e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  30.43 
 
 		 345 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  29.41 
 
 		 339 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0936  ApbE family lipoprotein  33.7 
 
 		 349 aa  139  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0317624  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  29.19 
 
 		 366 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  29.14 
 
 		 348 aa  138  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  32.68 
 
 		 317 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  29.65 
 
 		 342 aa  137  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  32.71 
 
 		 335 aa  137  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  34.36 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  32.79 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  36.82 
 
 		 379 aa  135  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0574  ApbE-like lipoprotein  30.83 
 
 		 279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.963363  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  29.51 
 
 		 336 aa  133  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  31.34 
 
 		 322 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  30.83 
 
 		 330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1926  ApbE family lipoprotein  34.41 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0099815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2326  ApbE family protein  31.8 
 
 		 352 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211712  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2151  ApbE family lipoprotein  34.55 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0607428  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  30.94 
 
 		 335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2058  ApbE family protein  29.94 
 
 		 370 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.673444  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.12 
 
 		 337 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2113  ApbE family protein  29.94 
 
 		 352 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  30.64 
 
 		 332 aa  129  6e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2400  ApbE family lipoprotein  34.41 
 
 		 302 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541927  hitchhiker  0.00229612 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0575  ApbE family lipoprotein  32.78 
 
 		 344 aa  129  6e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1893  ApbE family lipoprotein  34.41 
 
 		 301 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000770435  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1898  ApbE family lipoprotein  34.27 
 
 		 330 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0683316 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1919  ApbE family lipoprotein  34.41 
 
 		 301 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000213083  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  31.6 
 
 		 310 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  28.43 
 
 		 355 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0996  ApbE family protein  30.06 
 
 		 352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2093  ApbE family lipoprotein  32.63 
 
 		 333 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.11656e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1826  ApbE family lipoprotein  34.15 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000850306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.43 
 
 		 349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  30.69 
 
 		 351 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  31.77 
 
 		 350 aa  127  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.03 
 
 		 341 aa  127  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  32.56 
 
 		 316 aa  126  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  28.99 
 
 		 338 aa  126  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  27.97 
 
 		 338 aa  126  6e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  31 
 
 		 335 aa  125  8.000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  29.75 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  33.73 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  30.26 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1884  ApbE family lipoprotein  33.2 
 
 		 300 aa  122  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.717042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2084  ApbE family lipoprotein  33.87 
 
 		 275 aa  122  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107249  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  29.69 
 
 		 344 aa  122  8e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2771  ApbE family lipoprotein  29.87 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  31.34 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  28.77 
 
 		 349 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.79 
 
 		 361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2243  ApbE family lipoprotein  30.11 
 
 		 327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.208149 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  30.47 
 
 		 381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1601  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  29.63 
 
 		 358 aa  120  3e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1746  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  30.66 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000775168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1563  carboxynorspermidine decarboxylase  31.85 
 
 		 312 aa  120  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  28.91 
 
 		 331 aa  119  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3767  ApbE family lipoprotein  31.17 
 
 		 417 aa  119  9e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.301189  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2253  ApbE family protein  32.08 
 
 		 291 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  28.32 
 
 		 337 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2103  apbE family protein  32.52 
 
 		 275 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  27.83 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  27.52 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  27.86 
 
 		 374 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  27.35 
 
 		 374 aa  116  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3407  ApbE family lipoprotein  29 
 
 		 297 aa  116  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  32.13 
 
 		 315 aa  115  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3636  ApbE-like lipoprotein  28.27 
 
 		 340 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4283  apbE family protein  31.73 
 
 		 352 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2787  apbE family protein  29.29 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.778889  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2878  ApbE family lipoprotein  32.34 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.19 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1826  ApbE-like lipoprotein  32.27 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  27.1 
 
 		 347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  30.08 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0944  ApbE family lipoprotein  27.86 
 
 		 374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  28.21 
 
 		 369 aa  114  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1278  ApbE family lipoprotein  30.43 
 
 		 389 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>