More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0976 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  100 
 
 
430 aa  877    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  61.05 
 
 
363 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  55.1 
 
 
364 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  55.1 
 
 
364 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.34 
 
 
441 aa  375  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  49.01 
 
 
368 aa  343  5e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  47.35 
 
 
366 aa  335  7.999999999999999e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  45.71 
 
 
371 aa  332  1e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  46.8 
 
 
365 aa  330  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  48.75 
 
 
365 aa  328  1.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  45.6 
 
 
364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.92 
 
 
360 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.92 
 
 
360 aa  322  9.000000000000001e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.63 
 
 
360 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  44.69 
 
 
357 aa  320  3e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.03 
 
 
363 aa  316  5e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.03 
 
 
363 aa  316  5e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.13 
 
 
360 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.47 
 
 
366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.47 
 
 
366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.92 
 
 
359 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.65 
 
 
366 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.48 
 
 
364 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  44.69 
 
 
367 aa  310  4e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.65 
 
 
366 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.65 
 
 
366 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.38 
 
 
366 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.71 
 
 
360 aa  308  1.0000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.38 
 
 
366 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.38 
 
 
366 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.38 
 
 
366 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.38 
 
 
366 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  44.1 
 
 
361 aa  308  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.04 
 
 
364 aa  305  7e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  45.3 
 
 
360 aa  305  1.0000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  42.5 
 
 
370 aa  304  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.48 
 
 
363 aa  301  1e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  45.5 
 
 
375 aa  301  1e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.6 
 
 
360 aa  300  3e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  46.37 
 
 
360 aa  300  4e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  41.76 
 
 
371 aa  300  4e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.65 
 
 
366 aa  299  5e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  43.54 
 
 
372 aa  296  4e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  44.51 
 
 
351 aa  296  4e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4416  glycine cleavage system T protein  44.51 
 
 
364 aa  293  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.64 
 
 
376 aa  293  3e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  43.25 
 
 
367 aa  292  9e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0599  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.73 
 
 
362 aa  292  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.611166 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4451  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.78 
 
 
369 aa  291  1e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  41.42 
 
 
369 aa  291  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  44.54 
 
 
350 aa  289  8e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1983  aminomethyltransferase  43.01 
 
 
366 aa  287  2e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00232491  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.9 
 
 
381 aa  285  9e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.33 
 
 
369 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.33 
 
 
369 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1559  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.63 
 
 
362 aa  284  3.0000000000000004e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  40.88 
 
 
375 aa  280  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0469  glycine cleavage system T protein  43.55 
 
 
371 aa  279  9e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  42.34 
 
 
369 aa  278  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  42.13 
 
 
389 aa  276  5e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.73 
 
 
369 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3155  glycine cleavage system T protein  42.54 
 
 
362 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3205  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.15 
 
 
363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000683742  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1905  glycine cleavage system T protein  42.94 
 
 
374 aa  271  2e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.962172  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4863  glycine cleavage system T protein  39.78 
 
 
378 aa  270  2.9999999999999997e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1559  aminomethyltransferase  41.9 
 
 
371 aa  270  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1354  glycine cleavage system T protein  42.11 
 
 
371 aa  269  5.9999999999999995e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.91248  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.78 
 
 
380 aa  268  8.999999999999999e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  40.72 
 
 
364 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1515  glycine cleavage system T protein  42.33 
 
 
356 aa  266  4e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00269982  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.87 
 
 
365 aa  266  5.999999999999999e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.56 
 
 
365 aa  266  5.999999999999999e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40 
 
 
365 aa  265  8e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.34 
 
 
372 aa  264  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2759  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.72 
 
 
363 aa  265  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0339  glycine cleavage system T protein  40.66 
 
 
363 aa  264  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1647  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.73 
 
 
381 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1904  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.92 
 
 
383 aa  261  2e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0132  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.98 
 
 
360 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0117  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.98 
 
 
360 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.01 
 
 
375 aa  261  2e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0863  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.51 
 
 
365 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.18 
 
 
383 aa  261  2e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00965774  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2360  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40 
 
 
365 aa  260  3e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0807615  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0417  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.61 
 
 
362 aa  260  4e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3830  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.24 
 
 
365 aa  259  5.0000000000000005e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.434299  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2017  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.78 
 
 
365 aa  259  6e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00105963  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.28 
 
 
362 aa  259  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2351  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.35 
 
 
372 aa  259  7e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417081  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0867  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.96 
 
 
365 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1587  glycine cleavage system T protein  38.84 
 
 
363 aa  257  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1274  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.56 
 
 
362 aa  257  3e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1720  glycine cleavage system T protein  41.23 
 
 
365 aa  257  3e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.845128 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.94 
 
 
370 aa  257  3e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2675  glycine cleavage system T protein  40.11 
 
 
366 aa  256  8e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  39.28 
 
 
372 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0155  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.78 
 
 
368 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.843588  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.64 
 
 
366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0136  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.78 
 
 
368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  37.75 
 
 
366 aa  253  3e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>